RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515319.6

ZBED1-205, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ZBED1, Length 905 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-205ENST00000515319 TNRQ92752 1358 aa25.48■■□□□ 1.67
ZBED1-205ENST00000515319 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.47■■□□□ 1.67
ZBED1-205ENST00000515319 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
ZBED1-205ENST00000515319 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
ZBED1-205ENST00000515319 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
ZBED1-205ENST00000515319 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.41■■□□□ 1.66
ZBED1-205ENST00000515319 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
ZBED1-205ENST00000515319 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.41■■□□□ 1.66
ZBED1-205ENST00000515319 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
ZBED1-205ENST00000515319 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.4■■□□□ 1.66
ZBED1-205ENST00000515319 DEPDC5O75140 1603 aa25.39■■□□□ 1.66
ZBED1-205ENST00000515319 PZPP20742 1482 aa25.39■■□□□ 1.65
ZBED1-205ENST00000515319 IQGAP1P46940 1657 aa25.39■■□□□ 1.65
ZBED1-205ENST00000515319 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ZBED1-205ENST00000515319 MED14O60244 1454 aa25.38■■□□□ 1.65
ZBED1-205ENST00000515319 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.37■■□□□ 1.65
ZBED1-205ENST00000515319 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.37■■□□□ 1.65
ZBED1-205ENST00000515319 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.36■■□□□ 1.65
ZBED1-205ENST00000515319 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
ZBED1-205ENST00000515319 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.35■■□□□ 1.65
ZBED1-205ENST00000515319 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
ZBED1-205ENST00000515319 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.34■■□□□ 1.65
ZBED1-205ENST00000515319 SYNMO15061 1565 aa25.34■■□□□ 1.65
ZBED1-205ENST00000515319 NLRP1Q9C000 1473 aa25.34■■□□□ 1.65
ZBED1-205ENST00000515319 KIF3BO15066 747 aa25.33■■□□□ 1.65
ZBED1-205ENST00000515319 MIA2Q96PC5 1412 aa25.32■■□□□ 1.64
ZBED1-205ENST00000515319 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.31■■□□□ 1.64
ZBED1-205ENST00000515319 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.3■■□□□ 1.64
ZBED1-205ENST00000515319 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
ZBED1-205ENST00000515319 MBD5Q9P267 1494 aa25.28■■□□□ 1.64
ZBED1-205ENST00000515319 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.25■■□□□ 1.63
ZBED1-205ENST00000515319 TIAM1Q13009 1591 aa25.23■■□□□ 1.63
ZBED1-205ENST00000515319 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ZBED1-205ENST00000515319 POTEAQ6S8J7 498 aa25.19■■□□□ 1.62
ZBED1-205ENST00000515319 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ZBED1-205ENST00000515319 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.16■■□□□ 1.62
ZBED1-205ENST00000515319 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ZBED1-205ENST00000515319 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ZBED1-205ENST00000515319 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.11■■□□□ 1.61
ZBED1-205ENST00000515319 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.11■■□□□ 1.61
ZBED1-205ENST00000515319 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ZBED1-205ENST00000515319 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.09■■□□□ 1.61
ZBED1-205ENST00000515319 ABCC3O15438 1527 aa25.08■■□□□ 1.61
ZBED1-205ENST00000515319 ERVK-7P63135 1459 aa25.08■■□□□ 1.6
ZBED1-205ENST00000515319 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.07■■□□□ 1.6
ZBED1-205ENST00000515319 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.07■■□□□ 1.6
ZBED1-205ENST00000515319 CEP162Q5TB80 1403 aa25.05■■□□□ 1.6
ZBED1-205ENST00000515319 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.03■■□□□ 1.6
ZBED1-205ENST00000515319 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.03■■□□□ 1.6
ZBED1-205ENST00000515319 LTKP29376 864 aa25.02■■□□□ 1.6
ZBED1-205ENST00000515319 TSPY4P0CV99 314 aa25.01■■□□□ 1.59
ZBED1-205ENST00000515319 TSPY10P0CW01 314 aa25.01■■□□□ 1.59
ZBED1-205ENST00000515319 NCOA2Q15596 1464 aa25.01■■□□□ 1.59
ZBED1-205ENST00000515319 CEP152O94986 1710 aa25■■□□□ 1.59
ZBED1-205ENST00000515319 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25■■□□□ 1.59
ZBED1-205ENST00000515319 SLIT1O75093 1534 aa24.99■■□□□ 1.59
ZBED1-205ENST00000515319 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.99■■□□□ 1.59
ZBED1-205ENST00000515319 EID1Q9Y6B2 187 aa24.98■■□□□ 1.59
ZBED1-205ENST00000515319 TMEM94Q12767 1356 aa24.96■■□□□ 1.59
ZBED1-205ENST00000515319 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
ZBED1-205ENST00000515319 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.93■■□□□ 1.58
ZBED1-205ENST00000515319 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.92■■□□□ 1.58
ZBED1-205ENST00000515319 PHLPP1O60346 1717 aa24.92■■□□□ 1.58
ZBED1-205ENST00000515319 MAP3K1Q13233 1512 aa24.9■■□□□ 1.58
ZBED1-205ENST00000515319 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
ZBED1-205ENST00000515319 PIK3C2BO00750 1634 aa24.88■■□□□ 1.57
ZBED1-205ENST00000515319 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
ZBED1-205ENST00000515319 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.88■■□□□ 1.57
ZBED1-205ENST00000515319 KCNA6P17658 529 aa24.87■■□□□ 1.57
ZBED1-205ENST00000515319 JCADQ9P266 1359 aa24.87■■□□□ 1.57
ZBED1-205ENST00000515319 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.86■■□□□ 1.57
ZBED1-205ENST00000515319 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.579e-6■□□□□ 11.1
ZBED1-205ENST00000515319 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.86■■□□□ 1.57
ZBED1-205ENST00000515319 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
ZBED1-205ENST00000515319 MSH6P52701 1360 aa24.81■■□□□ 1.56
ZBED1-205ENST00000515319 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.81■■□□□ 1.56
ZBED1-205ENST00000515319 TRIM52Q96A61 297 aa24.81■■□□□ 1.56
ZBED1-205ENST00000515319 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.81■■□□□ 1.56
ZBED1-205ENST00000515319 SLAIN2Q9P270 581 aa24.8■■□□□ 1.56
ZBED1-205ENST00000515319 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
ZBED1-205ENST00000515319 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
ZBED1-205ENST00000515319 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.79■■□□□ 1.56
ZBED1-205ENST00000515319 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
ZBED1-205ENST00000515319 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.78■■□□□ 1.56
ZBED1-205ENST00000515319 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
ZBED1-205ENST00000515319 TET3O43151 1660 aa24.78■■□□□ 1.56
ZBED1-205ENST00000515319 NWD1Q149M9 1564 aa24.77■■□□□ 1.56
ZBED1-205ENST00000515319 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
ZBED1-205ENST00000515319 LRP6O75581 1613 aa24.75■■□□□ 1.55
ZBED1-205ENST00000515319 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.73■■□□□ 1.55
ZBED1-205ENST00000515319 BCANQ96GW7 911 aa24.72■■□□□ 1.55
ZBED1-205ENST00000515319 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
ZBED1-205ENST00000515319 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.69■■□□□ 1.54
ZBED1-205ENST00000515319 IDI1Q13907 227 aa24.69■■□□□ 1.54
ZBED1-205ENST00000515319 RXRBP28702 533 aa24.68■■□□□ 1.54
ZBED1-205ENST00000515319 KIF15Q9NS87 1388 aa24.67■■□□□ 1.54
ZBED1-205ENST00000515319 SHPRHQ149N8 1683 aa24.66■■□□□ 1.54
ZBED1-205ENST00000515319 ERBINQ96RT1 1412 aa24.66■■□□□ 1.54
ZBED1-205ENST00000515319 KANK1Q14678 1352 aa24.66■■□□□ 1.54
ZBED1-205ENST00000515319 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms