RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.91■■■■□ 3.82
ALYREF-203ENST00000511412 KIF3BO15066 747 aa38.9■■■■□ 3.82
ALYREF-203ENST00000511412 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP38.9■■■■□ 3.82
ALYREF-203ENST00000511412 APLP2Q06481 763 aa38.81■■■■□ 3.8
ALYREF-203ENST00000511412 PLA2R1Q13018 1463 aa38.79■■■■□ 3.8
ALYREF-203ENST00000511412 PZPP20742 1482 aa38.78■■■■□ 3.8
ALYREF-203ENST00000511412 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
ALYREF-203ENST00000511412 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP38.77■■■■□ 3.8
ALYREF-203ENST00000511412 A2ML1A8K2U0 1454 aa38.74■■■■□ 3.79
ALYREF-203ENST00000511412 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.74■■■■□ 3.79
ALYREF-203ENST00000511412 CROCC2H7BZ55 1655 aa38.72■■■■□ 3.79
ALYREF-203ENST00000511412 PTPN23Q9H3S7 1636 aa38.72■■■■□ 3.79
ALYREF-203ENST00000511412 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP38.71■■■■□ 3.79
ALYREF-203ENST00000511412 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP38.71■■■■□ 3.79
ALYREF-203ENST00000511412 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP38.7■■■■□ 3.79
ALYREF-203ENST00000511412 TNRQ92752 1358 aa38.7■■■■□ 3.78
ALYREF-203ENST00000511412 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa38.68■■■■□ 3.78
ALYREF-203ENST00000511412 LTBP4Q8N2S1 1624 aa38.68■■■■□ 3.78
ALYREF-203ENST00000511412 SHANK2Q9UPX8 1470 aa38.66■■■■□ 3.78
ALYREF-203ENST00000511412 PKD2Q13563 968 aa38.66■■■■□ 3.78
ALYREF-203ENST00000511412 DUOX2Q9NRD8 1548 aa38.65■■■■□ 3.78
ALYREF-203ENST00000511412 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP38.65■■■■□ 3.78
ALYREF-203ENST00000511412 ABCC3O15438 1527 aa38.63■■■■□ 3.78
ALYREF-203ENST00000511412 MROH1Q8NDA8 1641 aa38.62■■■■□ 3.77
ALYREF-203ENST00000511412 FGD6Q6ZV73 1430 aa38.61■■■■□ 3.77
ALYREF-203ENST00000511412 ABCC5O15440 1437 aa38.6■■■■□ 3.77
ALYREF-203ENST00000511412 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP38.58■■■■□ 3.77
ALYREF-203ENST00000511412 IQSEC2Q5JU85 1478 aa38.56■■■■□ 3.76
ALYREF-203ENST00000511412 NLRP1Q9C000 1473 aa38.56■■■■□ 3.76
ALYREF-203ENST00000511412 KIF15Q9NS87 1388 aa38.56■■■■□ 3.76
ALYREF-203ENST00000511412 DAPK1P53355 1430 aa38.55■■■■□ 3.76
ALYREF-203ENST00000511412 CEP152O94986 1710 aa38.55■■■■□ 3.76
ALYREF-203ENST00000511412 ERBINQ96RT1 1412 aa38.53■■■■□ 3.76
ALYREF-203ENST00000511412 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa38.52■■■■□ 3.76
ALYREF-203ENST00000511412 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP38.5■■■■□ 3.75
ALYREF-203ENST00000511412 UGGT1Q9NYU2 1555 aa38.49■■■■□ 3.75
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP38.49■■■■□ 3.75
ALYREF-203ENST00000511412 NEURL4Q96JN8 1562 aa38.48■■■■□ 3.75
ALYREF-203ENST00000511412 ERVK-7P63135 1459 aa38.47■■■■□ 3.75
ALYREF-203ENST00000511412 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa38.44■■■■□ 3.74
ALYREF-203ENST00000511412 DEPDC5O75140 1603 aa38.42■■■■□ 3.74
ALYREF-203ENST00000511412 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP38.41■■■■□ 3.74
ALYREF-203ENST00000511412 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP38.39■■■■□ 3.74
ALYREF-203ENST00000511412 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa38.38■■■■□ 3.73
ALYREF-203ENST00000511412 ANKLE2Q86XL3 938 aa38.34■■■■□ 3.73
ALYREF-203ENST00000511412 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa38.33■■■■□ 3.73
ALYREF-203ENST00000511412 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP38.32■■■■□ 3.73
ALYREF-203ENST00000511412 CHIC2Q9UKJ5 165 aa38.32■■■■□ 3.72
ALYREF-203ENST00000511412 MED14O60244 1454 aa38.29■■■■□ 3.72
ALYREF-203ENST00000511412 ADGRL2O95490 1459 aa38.29■■■■□ 3.72
ALYREF-203ENST00000511412 KANK1Q14678 1352 aa38.29■■■■□ 3.72
ALYREF-203ENST00000511412 UBR1Q8IWV7 1749 aa38.28■■■■□ 3.72
ALYREF-203ENST00000511412 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP38.28■■■■□ 3.72
ALYREF-203ENST00000511412 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP38.27■■■■□ 3.72
ALYREF-203ENST00000511412 IQGAP1P46940 1657 aa38.27■■■■□ 3.72
ALYREF-203ENST00000511412 CPS1P31327 1500 aa38.25■■■■□ 3.71
ALYREF-203ENST00000511412 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP38.24■■■■□ 3.71
ALYREF-203ENST00000511412 VWDEQ8N2E2 1590 aa38.23■■■■□ 3.71
ALYREF-203ENST00000511412 LMTK2Q8IWU2 1503 aa38.22■■■■□ 3.71
ALYREF-203ENST00000511412 UBAP1LF5GYI3 381 aa38.17■■■■□ 3.7
ALYREF-203ENST00000511412 PIK3C2BO00750 1634 aa38.14■■■■□ 3.7
ALYREF-203ENST00000511412 EFCAB6Q5THR3 1501 aa38.13■■■■□ 3.69
ALYREF-203ENST00000511412 SLIT1O75093 1534 aa38.12■■■■□ 3.69
ALYREF-203ENST00000511412 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
ALYREF-203ENST00000511412 ARHGAP23Q9P227 1491 aa38.1■■■■□ 3.69
ALYREF-203ENST00000511412 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.1■■■■□ 3.69
ALYREF-203ENST00000511412 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.68
ALYREF-203ENST00000511412 SYNMO15061 1565 aa38.06■■■■□ 3.68
ALYREF-203ENST00000511412 STRCP1A6NGW2 1772 aa38.01■■■■□ 3.68
ALYREF-203ENST00000511412 NOS1P29475 1434 aa38■■■■□ 3.67
ALYREF-203ENST00000511412 DISP3Q9P2K9 1392 aa37.98■■■■□ 3.67
ALYREF-203ENST00000511412 TXNDC2Q86VQ3 553 aa37.98■■■■□ 3.67
ALYREF-203ENST00000511412 STAG3Q9UJ98 1225 aa37.98■■■■□ 3.67
ALYREF-203ENST00000511412 TET3O43151 1660 aa37.98■■■■□ 3.67
ALYREF-203ENST00000511412 UNC13BO14795 1591 aa37.97■■■■□ 3.67
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM2Q9UHN6 1383 aa37.97■■■■□ 3.67
ALYREF-203ENST00000511412 LTKP29376 864 aa37.97■■■■□ 3.67
ALYREF-203ENST00000511412 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP37.96■■■■□ 3.67
ALYREF-203ENST00000511412 EID1Q9Y6B2 187 aa37.96■■■■□ 3.67
ALYREF-203ENST00000511412 ADGRB3O60242 1522 aa37.95■■■■□ 3.67
ALYREF-203ENST00000511412 TOM1O60784 492 aa37.94■■■■□ 3.66
ALYREF-203ENST00000511412 ROCK1Q13464 1354 aa37.93■■■■□ 3.66
ALYREF-203ENST00000511412 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.93■■■■□ 3.66
ALYREF-203ENST00000511412 IDI1Q13907 227 aa37.93■■■■□ 3.66
ALYREF-203ENST00000511412 LRRC7Q96NW7 1537 aa37.92■■■■□ 3.66
ALYREF-203ENST00000511412 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
ALYREF-203ENST00000511412 PIP4K2BP78356 416 aa37.87■■■■□ 3.65
ALYREF-203ENST00000511412 SLC52A1Q9NWF4 448 aa37.85■■■■□ 3.65
ALYREF-203ENST00000511412 ALKQ9UM73 1620 aa37.84■■■■□ 3.65
ALYREF-203ENST00000511412 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
ALYREF-203ENST00000511412 IQGAP3Q86VI3 1631 aa37.82■■■■□ 3.64
ALYREF-203ENST00000511412 E9PCH4 1651 aa37.79■■■■□ 3.64
ALYREF-203ENST00000511412 ITGAEP38570 1179 aa37.78■■■■□ 3.64
ALYREF-203ENST00000511412 MYO5BQ9ULV0 1848 aa37.75■■■■□ 3.63
ALYREF-203ENST00000511412 HSPA1LP34931 641 aa37.74■■■■□ 3.63
ALYREF-203ENST00000511412 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa37.72■■■■□ 3.63
ALYREF-203ENST00000511412 ZFYVE9O95405 1425 aa37.68■■■■□ 3.62
ALYREF-203ENST00000511412 ILDR2Q71H61 639 aa37.67■■■■□ 3.62
ALYREF-203ENST00000511412 NUP155O75694 1391 aa37.67■■■■□ 3.62
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