RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507253.5

PITX1-206, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-206ENST00000507253 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
PITX1-206ENST00000507253 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.41■■■■□ 3.42
PITX1-206ENST00000507253 NPATQ14207 1427 aa36.39■■■■□ 3.42
PITX1-206ENST00000507253 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.39■■■■□ 3.42
PITX1-206ENST00000507253 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.38■■■■□ 3.41
PITX1-206ENST00000507253 ERBINQ96RT1 1412 aa36.37■■■■□ 3.41
PITX1-206ENST00000507253 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
PITX1-206ENST00000507253 ADGRL2O95490 1459 aa36.33■■■■□ 3.41
PITX1-206ENST00000507253 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.33■■■■□ 3.41
PITX1-206ENST00000507253 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.41
PITX1-206ENST00000507253 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.31■■■■□ 3.4
PITX1-206ENST00000507253 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.31■■■■□ 3.4
PITX1-206ENST00000507253 NCOA1Q15788 1441 aa36.29■■■■□ 3.4
PITX1-206ENST00000507253 PTPRKQ15262 1439 aa36.27■■■■□ 3.4
PITX1-206ENST00000507253 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.27■■■■□ 3.4
PITX1-206ENST00000507253 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.26■■■■□ 3.39
PITX1-206ENST00000507253 HSPA2P54652 639 aa36.25■■■■□ 3.39
PITX1-206ENST00000507253 PZPP20742 1482 aa36.23■■■■□ 3.39
PITX1-206ENST00000507253 ABCC3O15438 1527 aa36.23■■■■□ 3.39
PITX1-206ENST00000507253 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
PITX1-206ENST00000507253 DEPDC5O75140 1603 aa36.21■■■■□ 3.39
PITX1-206ENST00000507253 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.2■■■■□ 3.39
PITX1-206ENST00000507253 CEP152O94986 1710 aa36.17■■■■□ 3.38
PITX1-206ENST00000507253 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
PITX1-206ENST00000507253 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
PITX1-206ENST00000507253 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.14■■■■□ 3.38
PITX1-206ENST00000507253 ROCK1Q13464 1354 aa36.14■■■■□ 3.38
PITX1-206ENST00000507253 KANK1Q14678 1352 aa36.13■■■■□ 3.37
PITX1-206ENST00000507253 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.11■■■■□ 3.37
PITX1-206ENST00000507253 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
PITX1-206ENST00000507253 TNRQ92752 1358 aa36.09■■■■□ 3.37
PITX1-206ENST00000507253 ITGAEP38570 1179 aa36.05■■■■□ 3.36
PITX1-206ENST00000507253 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.05■■■■□ 3.36
PITX1-206ENST00000507253 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
PITX1-206ENST00000507253 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.03■■■■□ 3.36
PITX1-206ENST00000507253 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.02■■■■□ 3.36
PITX1-206ENST00000507253 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.02■■■■□ 3.36
PITX1-206ENST00000507253 STRCQ7RTU9 1775 aa36.02■■■■□ 3.36
PITX1-206ENST00000507253 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.01■■■■□ 3.36
PITX1-206ENST00000507253 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.01■■■■□ 3.36
PITX1-206ENST00000507253 ERVK-7P63135 1459 aa35.99■■■■□ 3.35
PITX1-206ENST00000507253 NLRP1Q9C000 1473 aa35.99■■■■□ 3.35
PITX1-206ENST00000507253 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.98■■■■□ 3.35
PITX1-206ENST00000507253 UNC13BO14795 1591 aa35.95■■■■□ 3.35
PITX1-206ENST00000507253 PLA2R1Q13018 1463 aa35.95■■■■□ 3.35
PITX1-206ENST00000507253 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
PITX1-206ENST00000507253 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.91■■■■□ 3.34
PITX1-206ENST00000507253 PTPRTO14522 1441 aa35.87■■■■□ 3.33
PITX1-206ENST00000507253 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.86■■■■□ 3.33
PITX1-206ENST00000507253 TET3O43151 1660 aa35.85■■■■□ 3.33
PITX1-206ENST00000507253 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.82■■■■□ 3.33
PITX1-206ENST00000507253 PKD2Q13563 968 aa35.82■■■■□ 3.32
PITX1-206ENST00000507253 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
PITX1-206ENST00000507253 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.8■■■■□ 3.32
PITX1-206ENST00000507253 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
PITX1-206ENST00000507253 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
PITX1-206ENST00000507253 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.75■■■■□ 3.31
PITX1-206ENST00000507253 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.74■■■■□ 3.31
PITX1-206ENST00000507253 NAIPQ13075 1403 aa35.73■■■■□ 3.31
PITX1-206ENST00000507253 NUP155O75694 1391 aa35.72■■■■□ 3.31
PITX1-206ENST00000507253 NOS1P29475 1434 aa35.72■■■■□ 3.31
PITX1-206ENST00000507253 HFM1A2PYH4 1435 aa35.7■■■■□ 3.31
PITX1-206ENST00000507253 SYNMO15061 1565 aa35.7■■■■□ 3.31
PITX1-206ENST00000507253 PIK3C2BO00750 1634 aa35.68■■■■□ 3.3
PITX1-206ENST00000507253 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
PITX1-206ENST00000507253 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.67■■■■□ 3.3
PITX1-206ENST00000507253 E9PCH4 1651 aa35.66■■■■□ 3.3
PITX1-206ENST00000507253 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.64■■■■□ 3.3
PITX1-206ENST00000507253 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.61■■■■□ 3.29
PITX1-206ENST00000507253 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.6■■■■□ 3.29
PITX1-206ENST00000507253 MED14O60244 1454 aa35.58■■■■□ 3.29
PITX1-206ENST00000507253 ADGRB3O60242 1522 aa35.57■■■■□ 3.29
PITX1-206ENST00000507253 SLIT1O75093 1534 aa35.57■■■■□ 3.29
PITX1-206ENST00000507253 IDI1Q13907 227 aa35.57■■■■□ 3.28
PITX1-206ENST00000507253 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.56■■■■□ 3.28
PITX1-206ENST00000507253 IQGAP1P46940 1657 aa35.54■■■■□ 3.28
PITX1-206ENST00000507253 CERKQ8TCT0 537 aa35.54■■■■□ 3.28
PITX1-206ENST00000507253 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
PITX1-206ENST00000507253 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
PITX1-206ENST00000507253 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.5■■■■□ 3.27
PITX1-206ENST00000507253 EID1Q9Y6B2 187 aa35.49■■■■□ 3.27
PITX1-206ENST00000507253 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.49■■■■□ 3.27
PITX1-206ENST00000507253 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.48■■■■□ 3.27
PITX1-206ENST00000507253 FBXO41Q8TF61 875 aa35.46■■■■□ 3.27
PITX1-206ENST00000507253 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
PITX1-206ENST00000507253 TRIM52Q96A61 297 aa35.45■■■■□ 3.27
PITX1-206ENST00000507253 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
PITX1-206ENST00000507253 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.44■■■■□ 3.26
PITX1-206ENST00000507253 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.42■■■■□ 3.26
PITX1-206ENST00000507253 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.41■■■■□ 3.26
PITX1-206ENST00000507253 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.4■■■■□ 3.26
PITX1-206ENST00000507253 LTKP29376 864 aa35.39■■■■□ 3.26
PITX1-206ENST00000507253 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
PITX1-206ENST00000507253 CPS1P31327 1500 aa35.35■■■■□ 3.25
PITX1-206ENST00000507253 TRPM2O94759 1503 aa35.33■■■■□ 3.25
PITX1-206ENST00000507253 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
PITX1-206ENST00000507253 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
PITX1-206ENST00000507253 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.32■■■■□ 3.24
PITX1-206ENST00000507253 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
PITX1-206ENST00000507253 ZFYVE9O95405 1425 aa35.29■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.8 ms