RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-215	ENST00000506510	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PDE4D-215	ENST00000506510	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
PDE4D-215	ENST00000506510	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
PDE4D-215	ENST00000506510	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PDE4D-215	ENST00000506510	KCNH8	Q96L42	1107 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PDE4D-215	ENST00000506510	MAP3K7	O43318	606 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PDE4D-215	ENST00000506510	OSBP	P22059	807 aa		11.87	□□□□□ -0.51
PDE4D-215	ENST00000506510	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
PDE4D-215	ENST00000506510	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		11.85	□□□□□ -0.51
PDE4D-215	ENST00000506510	COL9A1	P20849	921 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PDE4D-215	ENST00000506510	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
PDE4D-215	ENST00000506510	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PDE4D-215	ENST00000506510	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PDE4D-215	ENST00000506510	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PDE4D-215	ENST00000506510	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PDE4D-215	ENST00000506510	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PDE4D-215	ENST00000506510	TK2	O00142	265 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PDE4D-215	ENST00000506510	PROX2	Q3B8N5	592 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PDE4D-215	ENST00000506510	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PDE4D-215	ENST00000506510	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PDE4D-215	ENST00000506510	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PDE4D-215	ENST00000506510	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PDE4D-215	ENST00000506510	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
PDE4D-215	ENST00000506510	HR	O43593	1189 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PDE4D-215	ENST00000506510	MMRN1	Q13201	1228 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PDE4D-215	ENST00000506510	NUTM2F	A1L443	756 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PDE4D-215	ENST00000506510	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4D-215	ENST00000506510	CERK	Q8TCT0	537 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4D-215	ENST00000506510	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
PDE4D-215	ENST00000506510	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4D-215	ENST00000506510	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4D-215	ENST00000506510	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4D-215	ENST00000506510	TSKS	Q9UJT2	592 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4D-215	ENST00000506510	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PDE4D-215	ENST00000506510	PRSS12	P56730	875 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4D-215	ENST00000506510	PTGDR	Q13258	359 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4D-215	ENST00000506510	STAC3	Q96MF2	364 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4D-215	ENST00000506510	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4D-215	ENST00000506510	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PDE4D-215	ENST00000506510	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4D-215	ENST00000506510	PADI6	Q6TGC4	694 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4D-215	ENST00000506510	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PDE4D-215	ENST00000506510	NBPF3	Q9H094	633 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4D-215	ENST00000506510	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDE4D-215	ENST00000506510	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PDE4D-215	ENST00000506510	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PDE4D-215	ENST00000506510	FCHSD2	O94868	740 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4D-215	ENST00000506510	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4D-215	ENST00000506510	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PDE4D-215	ENST00000506510	PACS2	Q86VP3	889 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4D-215	ENST00000506510	C3orf80	F5H4A9	247 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PDE4D-215	ENST00000506510	GPR37	O15354	613 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PDE4D-215	ENST00000506510	SMAP	O00193	183 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PDE4D-215	ENST00000506510	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	11.58	□□□□□ -0.56
PDE4D-215	ENST00000506510	TTC13	Q8NBP0	860 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PDE4D-215	ENST00000506510	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PDE4D-215	ENST00000506510	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
PDE4D-215	ENST00000506510	PNMA3	Q9UL41	463 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PDE4D-215	ENST00000506510	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PDE4D-215	ENST00000506510	NBPF26	B4DH59	902 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PDE4D-215	ENST00000506510	HIC1	Q14526	733 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PDE4D-215	ENST00000506510	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PDE4D-215	ENST00000506510	TATDN2	Q93075	761 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PDE4D-215	ENST00000506510	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PDE4D-215	ENST00000506510	GNPAT	O15228	680 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PDE4D-215	ENST00000506510	FECH	P22830	423 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PDE4D-215	ENST00000506510	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
PDE4D-215	ENST00000506510	WNT2B	Q93097	391 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PDE4D-215	ENST00000506510	FAM161A	Q3B820	660 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PDE4D-215	ENST00000506510	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
PDE4D-215	ENST00000506510	BCAN	Q96GW7	911 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PDE4D-215	ENST00000506510	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PDE4D-215	ENST00000506510	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PDE4D-215	ENST00000506510	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PDE4D-215	ENST00000506510	BCAM	P50895	628 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PDE4D-215	ENST00000506510	EYA1	Q99502	592 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PDE4D-215	ENST00000506510	PTPN5	P54829	565 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PDE4D-215	ENST00000506510	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PDE4D-215	ENST00000506510	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
PDE4D-215	ENST00000506510	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PDE4D-215	ENST00000506510	LRCH3	Q96II8	777 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PDE4D-215	ENST00000506510	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PDE4D-215	ENST00000506510	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PDE4D-215	ENST00000506510	HCST	Q9UBK5	93 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PDE4D-215	ENST00000506510	RNF40	O75150	1001 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PDE4D-215	ENST00000506510	MAP2K5	Q13163	448 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PDE4D-215	ENST00000506510	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PDE4D-215	ENST00000506510	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PDE4D-215	ENST00000506510	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PDE4D-215	ENST00000506510	RCCD1	A6NED2	376 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PDE4D-215	ENST00000506510	OAT	P04181	439 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PDE4D-215	ENST00000506510	DNAJB2	P25686	324 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PDE4D-215	ENST00000506510	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PDE4D-215	ENST00000506510	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PDE4D-215	ENST00000506510	NLRP7	Q8WX94	980 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4D-215	ENST00000506510	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4D-215	ENST00000506510	WBP1L	Q9NX94	342 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4D-215	ENST00000506510	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PDE4D-215	ENST00000506510	ZMYND10	O75800	440 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4D-215	ENST00000506510	CCDC102A	Q96A19	550 aa		11.35	□□□□□ -0.59

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