RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498160.5

CTDSP1-215, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-215ENST00000498160 KIF3BO15066 747 aa26.19■■□□□ 1.78
CTDSP1-215ENST00000498160 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.18■■□□□ 1.78
CTDSP1-215ENST00000498160 UNC13BO14795 1591 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDSP1-215ENST00000498160 KANK1Q14678 1352 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDSP1-215ENST00000498160 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CTDSP1-215ENST00000498160 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDSP1-215ENST00000498160 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDSP1-215ENST00000498160 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CTDSP1-215ENST00000498160 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDSP1-215ENST00000498160 GGT6Q6P531 493 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDSP1-215ENST00000498160 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDSP1-215ENST00000498160 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDSP1-215ENST00000498160 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CTDSP1-215ENST00000498160 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDSP1-215ENST00000498160 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDSP1-215ENST00000498160 NUP155O75694 1391 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDSP1-215ENST00000498160 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDSP1-215ENST00000498160 TRIM52Q96A61 297 aa26.03■■□□□ 1.76
CTDSP1-215ENST00000498160 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.764e-17■□□□□ 10.2
CTDSP1-215ENST00000498160 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.02■■□□□ 1.76
CTDSP1-215ENST00000498160 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.01■■□□□ 1.75
CTDSP1-215ENST00000498160 MLECQ14165 292 aa26.01■■□□□ 1.75
CTDSP1-215ENST00000498160 ABCC3O15438 1527 aa26■■□□□ 1.75
CTDSP1-215ENST00000498160 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26■■□□□ 1.75
CTDSP1-215ENST00000498160 MROH2AA6NES4 1674 aa25.99■■□□□ 1.75
CTDSP1-215ENST00000498160 TET3O43151 1660 aa25.99■■□□□ 1.75
CTDSP1-215ENST00000498160 CEP152O94986 1710 aa25.96■■□□□ 1.75
CTDSP1-215ENST00000498160 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDSP1-215ENST00000498160 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CTDSP1-215ENST00000498160 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CTDSP1-215ENST00000498160 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDSP1-215ENST00000498160 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDSP1-215ENST00000498160 MADDQ8WXG6 1647 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDSP1-215ENST00000498160 PZPP20742 1482 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDSP1-215ENST00000498160 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CTDSP1-215ENST00000498160 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.89■■□□□ 1.74
CTDSP1-215ENST00000498160 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CTDSP1-215ENST00000498160 ZMYM3Q14202 1370 aa25.87■■□□□ 1.73
CTDSP1-215ENST00000498160 E9PCH4 1651 aa25.83■■□□□ 1.73
CTDSP1-215ENST00000498160 NPATQ14207 1427 aa25.82■■□□□ 1.72
CTDSP1-215ENST00000498160 PKD2Q13563 968 aa25.82■■□□□ 1.72
CTDSP1-215ENST00000498160 C3P01024 1663 aa25.8■■□□□ 1.72
CTDSP1-215ENST00000498160 PTPRMP28827 1452 aa25.79■■□□□ 1.72
CTDSP1-215ENST00000498160 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CTDSP1-215ENST00000498160 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.78■■□□□ 1.72
CTDSP1-215ENST00000498160 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.77■■□□□ 1.72
CTDSP1-215ENST00000498160 ERVK-7P63135 1459 aa25.76■■□□□ 1.71
CTDSP1-215ENST00000498160 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.75■■□□□ 1.71
CTDSP1-215ENST00000498160 NOS1P29475 1434 aa25.75■■□□□ 1.71
CTDSP1-215ENST00000498160 PTPRTO14522 1441 aa25.74■■□□□ 1.71
CTDSP1-215ENST00000498160 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.74■■□□□ 1.71
CTDSP1-215ENST00000498160 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDSP1-215ENST00000498160 TRPM2O94759 1503 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDSP1-215ENST00000498160 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.69■■□□□ 1.7
CTDSP1-215ENST00000498160 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CTDSP1-215ENST00000498160 TNRQ92752 1358 aa25.69■■□□□ 1.7
CTDSP1-215ENST00000498160 NLRP1Q9C000 1473 aa25.67■■□□□ 1.7
CTDSP1-215ENST00000498160 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.67■■□□□ 1.7
CTDSP1-215ENST00000498160 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.65■■□□□ 1.7
CTDSP1-215ENST00000498160 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
CTDSP1-215ENST00000498160 SYNMO15061 1565 aa25.65■■□□□ 1.7
CTDSP1-215ENST00000498160 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
CTDSP1-215ENST00000498160 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
CTDSP1-215ENST00000498160 PIK3C2BO00750 1634 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDSP1-215ENST00000498160 PLA2R1Q13018 1463 aa25.62■■□□□ 1.69
CTDSP1-215ENST00000498160 FOXD1Q16676 465 aa25.62■■□□□ 1.69
CTDSP1-215ENST00000498160 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CTDSP1-215ENST00000498160 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CTDSP1-215ENST00000498160 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.59■■□□□ 1.69
CTDSP1-215ENST00000498160 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.58■■□□□ 1.69
CTDSP1-215ENST00000498160 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.58■■□□□ 1.69
CTDSP1-215ENST00000498160 CLTCL1P53675 1640 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDSP1-215ENST00000498160 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDSP1-215ENST00000498160 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
CTDSP1-215ENST00000498160 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.56■■□□□ 1.68
CTDSP1-215ENST00000498160 KIF1BO60333 1816 aa25.56■■□□□ 1.68
CTDSP1-215ENST00000498160 ADGRB3O60242 1522 aa25.53■■□□□ 1.68
CTDSP1-215ENST00000498160 IDI1Q13907 227 aa25.53■■□□□ 1.68
CTDSP1-215ENST00000498160 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CTDSP1-215ENST00000498160 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.51■■□□□ 1.67
CTDSP1-215ENST00000498160 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.5■■□□□ 1.67
CTDSP1-215ENST00000498160 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDSP1-215ENST00000498160 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.46■■□□□ 1.67
CTDSP1-215ENST00000498160 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CTDSP1-215ENST00000498160 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.45■■□□□ 1.66
CTDSP1-215ENST00000498160 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDSP1-215ENST00000498160 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CTDSP1-215ENST00000498160 STAC3Q96MF2 364 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDSP1-215ENST00000498160 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDSP1-215ENST00000498160 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CTDSP1-215ENST00000498160 TONSLQ96HA7 1378 aa25.39■■□□□ 1.65
CTDSP1-215ENST00000498160 SLIT1O75093 1534 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDSP1-215ENST00000498160 NEUROD1Q13562 356 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDSP1-215ENST00000498160 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
CTDSP1-215ENST00000498160 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDSP1-215ENST00000498160 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CTDSP1-215ENST00000498160 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CTDSP1-215ENST00000498160 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDSP1-215ENST00000498160 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDSP1-215ENST00000498160 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.36■■□□□ 1.65
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