RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496553.5

NDUFS2-215, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S2, human

TSL 2

Gene NDUFS2, Length 888 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
NDUFS2-215	ENST00000496553	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.09	■■■□□ 2.89
NDUFS2-215	ENST00000496553	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		33.08	■■■□□ 2.89
NDUFS2-215	ENST00000496553	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
NDUFS2-215	ENST00000496553	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.05	■■■□□ 2.88
NDUFS2-215	ENST00000496553	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33	■■■□□ 2.87
NDUFS2-215	ENST00000496553	PZP	P20742	1482 aa		32.99	■■■□□ 2.87
NDUFS2-215	ENST00000496553	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.98	■■■□□ 2.87
NDUFS2-215	ENST00000496553	PKD2	Q13563	968 aa		32.97	■■■□□ 2.87
NDUFS2-215	ENST00000496553	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
NDUFS2-215	ENST00000496553	TNR	Q92752	1358 aa		32.96	■■■□□ 2.87
NDUFS2-215	ENST00000496553	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.95	■■■□□ 2.86
NDUFS2-215	ENST00000496553	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.86
NDUFS2-215	ENST00000496553	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.92	■■■□□ 2.86
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
NDUFS2-215	ENST00000496553	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
NDUFS2-215	ENST00000496553	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		32.9	■■■□□ 2.86
NDUFS2-215	ENST00000496553	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
NDUFS2-215	ENST00000496553	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
NDUFS2-215	ENST00000496553	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.89	■■■□□ 2.86
NDUFS2-215	ENST00000496553	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.88	■■■□□ 2.85
NDUFS2-215	ENST00000496553	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.87	■■■□□ 2.85
NDUFS2-215	ENST00000496553	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.85	■■■□□ 2.85
NDUFS2-215	ENST00000496553	ABCC3	O15438	1527 aa		32.84	■■■□□ 2.85
NDUFS2-215	ENST00000496553	NLRP1	Q9C000	1473 aa		32.84	■■■□□ 2.85
NDUFS2-215	ENST00000496553	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.83	■■■□□ 2.85
NDUFS2-215	ENST00000496553	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.83	■■■□□ 2.85
NDUFS2-215	ENST00000496553	ABCC5	O15440	1437 aa		32.82	■■■□□ 2.84
NDUFS2-215	ENST00000496553	DAPK1	P53355	1430 aa		32.8	■■■□□ 2.84
NDUFS2-215	ENST00000496553	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.79	■■■□□ 2.84
NDUFS2-215	ENST00000496553	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
NDUFS2-215	ENST00000496553	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
NDUFS2-215	ENST00000496553	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.77	■■■□□ 2.84
NDUFS2-215	ENST00000496553	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.76	■■■□□ 2.84
NDUFS2-215	ENST00000496553	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.76	■■■□□ 2.83
NDUFS2-215	ENST00000496553	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
NDUFS2-215	ENST00000496553	CEP152	O94986	1710 aa		32.74	■■■□□ 2.83
NDUFS2-215	ENST00000496553	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.74	■■■□□ 2.83
NDUFS2-215	ENST00000496553	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.72	■■■□□ 2.83
NDUFS2-215	ENST00000496553	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.72	■■■□□ 2.83
NDUFS2-215	ENST00000496553	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
NDUFS2-215	ENST00000496553	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.7	■■■□□ 2.83
NDUFS2-215	ENST00000496553	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.7	■■■□□ 2.83
NDUFS2-215	ENST00000496553	KANK1	Q14678	1352 aa		32.69	■■■□□ 2.82
NDUFS2-215	ENST00000496553	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.66	■■■□□ 2.82
NDUFS2-215	ENST00000496553	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.66	■■■□□ 2.82
NDUFS2-215	ENST00000496553	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.64	■■■□□ 2.82	2e-6	■□□□□ 10.1
NDUFS2-215	ENST00000496553	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.63	■■■□□ 2.81
NDUFS2-215	ENST00000496553	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
NDUFS2-215	ENST00000496553	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.62	■■■□□ 2.81
NDUFS2-215	ENST00000496553	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
NDUFS2-215	ENST00000496553	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
NDUFS2-215	ENST00000496553	MED14	O60244	1454 aa		32.57	■■■□□ 2.8
NDUFS2-215	ENST00000496553	CPS1	P31327	1500 aa		32.56	■■■□□ 2.8
NDUFS2-215	ENST00000496553	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		32.56	■■■□□ 2.8
NDUFS2-215	ENST00000496553	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.55	■■■□□ 2.8
NDUFS2-215	ENST00000496553	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.53	■■■□□ 2.8
NDUFS2-215	ENST00000496553	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.53	■■■□□ 2.8
NDUFS2-215	ENST00000496553	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.5	■■■□□ 2.79
NDUFS2-215	ENST00000496553	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.47	■■■□□ 2.79
NDUFS2-215	ENST00000496553	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.45	■■■□□ 2.79
NDUFS2-215	ENST00000496553	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.44	■■■□□ 2.78
NDUFS2-215	ENST00000496553	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
NDUFS2-215	ENST00000496553	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.42	■■■□□ 2.78
NDUFS2-215	ENST00000496553	SLIT1	O75093	1534 aa		32.41	■■■□□ 2.78
NDUFS2-215	ENST00000496553	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.41	■■■□□ 2.78
NDUFS2-215	ENST00000496553	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.4	■■■□□ 2.78
NDUFS2-215	ENST00000496553	TOM1	O60784	492 aa		32.39	■■■□□ 2.78
NDUFS2-215	ENST00000496553	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.39	■■■□□ 2.78
NDUFS2-215	ENST00000496553	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.39	■■■□□ 2.78
NDUFS2-215	ENST00000496553	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		32.38	■■■□□ 2.77
NDUFS2-215	ENST00000496553	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
NDUFS2-215	ENST00000496553	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
NDUFS2-215	ENST00000496553	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
NDUFS2-215	ENST00000496553	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.32	■■■□□ 2.77
NDUFS2-215	ENST00000496553	SYNM	O15061	1565 aa		32.32	■■■□□ 2.77
NDUFS2-215	ENST00000496553	LTK	P29376	864 aa		32.32	■■■□□ 2.76
NDUFS2-215	ENST00000496553	IDI1	Q13907	227 aa		32.31	■■■□□ 2.76
NDUFS2-215	ENST00000496553	NOS1	P29475	1434 aa		32.31	■■■□□ 2.76
NDUFS2-215	ENST00000496553	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.31	■■■□□ 2.76
NDUFS2-215	ENST00000496553	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.3	■■■□□ 2.76
NDUFS2-215	ENST00000496553	PIP4K2B	P78356	416 aa		32.29	■■■□□ 2.76
NDUFS2-215	ENST00000496553	TET3	O43151	1660 aa		32.29	■■■□□ 2.76
NDUFS2-215	ENST00000496553	UNC13B	O14795	1591 aa		32.27	■■■□□ 2.76
NDUFS2-215	ENST00000496553	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.26	■■■□□ 2.76
NDUFS2-215	ENST00000496553	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.25	■■■□□ 2.75
NDUFS2-215	ENST00000496553	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.25	■■■□□ 2.75
NDUFS2-215	ENST00000496553	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.24	■■■□□ 2.75
NDUFS2-215	ENST00000496553	ITGAE	P38570	1179 aa		32.22	■■■□□ 2.75
NDUFS2-215	ENST00000496553	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
NDUFS2-215	ENST00000496553	HSPA1L	P34931	641 aa		32.15	■■■□□ 2.74
NDUFS2-215	ENST00000496553	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.15	■■■□□ 2.74
NDUFS2-215	ENST00000496553	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
NDUFS2-215	ENST00000496553	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.13	■■■□□ 2.73
NDUFS2-215	ENST00000496553	NUP155	O75694	1391 aa		32.1	■■■□□ 2.73
NDUFS2-215	ENST00000496553		E9PCH4	1651 aa		32.1	■■■□□ 2.73
NDUFS2-215	ENST00000496553	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
NDUFS2-215	ENST00000496553	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.08	■■■□□ 2.73
NDUFS2-215	ENST00000496553	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.08	■■■□□ 2.73
NDUFS2-215	ENST00000496553	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72

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