RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495098.5

MTMR3-212, Transcript of myotubularin related protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MTMR3, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3-212ENST00000495098 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa34.12■■■■□ 3.05
MTMR3-212ENST00000495098 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
MTMR3-212ENST00000495098 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa34.11■■■■□ 3.05
MTMR3-212ENST00000495098 KDM5DQ9BY66 1539 aa34.09■■■■□ 3.05
MTMR3-212ENST00000495098 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
MTMR3-212ENST00000495098 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.07■■■■□ 3.05
MTMR3-212ENST00000495098 TNRQ92752 1358 aa34.01■■■■□ 3.04
MTMR3-212ENST00000495098 PZPP20742 1482 aa34■■■■□ 3.03
MTMR3-212ENST00000495098 PTPN23Q9H3S7 1636 aa33.99■■■■□ 3.03
MTMR3-212ENST00000495098 A2ML1A8K2U0 1454 aa33.99■■■■□ 3.03
MTMR3-212ENST00000495098 FAM135AQ9P2D6 1515 aa33.99■■■■□ 3.03
MTMR3-212ENST00000495098 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
MTMR3-212ENST00000495098 PLA2R1Q13018 1463 aa33.97■■■■□ 3.03
MTMR3-212ENST00000495098 PKD2Q13563 968 aa33.96■■■■□ 3.03
MTMR3-212ENST00000495098 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
MTMR3-212ENST00000495098 LTBP4Q8N2S1 1624 aa33.95■■■■□ 3.03
MTMR3-212ENST00000495098 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
MTMR3-212ENST00000495098 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
MTMR3-212ENST00000495098 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.93■■■■□ 3.02
MTMR3-212ENST00000495098 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
MTMR3-212ENST00000495098 ABCC5O15440 1437 aa33.9■■■■□ 3.02
MTMR3-212ENST00000495098 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa33.9■■■■□ 3.02
MTMR3-212ENST00000495098 ABCC3O15438 1527 aa33.89■■■■□ 3.02
MTMR3-212ENST00000495098 DUOX2Q9NRD8 1548 aa33.89■■■■□ 3.02
MTMR3-212ENST00000495098 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
MTMR3-212ENST00000495098 CEP152O94986 1710 aa33.89■■■■□ 3.02
MTMR3-212ENST00000495098 FGD6Q6ZV73 1430 aa33.87■■■■□ 3.01
MTMR3-212ENST00000495098 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
MTMR3-212ENST00000495098 KIF15Q9NS87 1388 aa33.86■■■■□ 3.01
MTMR3-212ENST00000495098 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.86■■■■□ 3.01
MTMR3-212ENST00000495098 MROH1Q8NDA8 1641 aa33.85■■■■□ 3.01
MTMR3-212ENST00000495098 DAPK1P53355 1430 aa33.85■■■■□ 3.01
MTMR3-212ENST00000495098 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
MTMR3-212ENST00000495098 CHIC2Q9UKJ5 165 aa33.83■■■■□ 3.01
MTMR3-212ENST00000495098 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP33.81■■■■□ 3
MTMR3-212ENST00000495098 NLRP1Q9C000 1473 aa33.8■■■■□ 3
MTMR3-212ENST00000495098 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
MTMR3-212ENST00000495098 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP33.79■■■■□ 39e-7■■□□□ 12.2
MTMR3-212ENST00000495098 UGGT1Q9NYU2 1555 aa33.79■■■■□ 3
MTMR3-212ENST00000495098 ANKLE2Q86XL3 938 aa33.75■■■□□ 2.99
MTMR3-212ENST00000495098 ERBINQ96RT1 1412 aa33.75■■■□□ 2.99
MTMR3-212ENST00000495098 ERVK-7P63135 1459 aa33.75■■■□□ 2.99
MTMR3-212ENST00000495098 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa33.74■■■□□ 2.99
MTMR3-212ENST00000495098 NEURL4Q96JN8 1562 aa33.74■■■□□ 2.99
MTMR3-212ENST00000495098 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
MTMR3-212ENST00000495098 IQSEC2Q5JU85 1478 aa33.74■■■□□ 2.99
MTMR3-212ENST00000495098 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa33.71■■■□□ 2.99
MTMR3-212ENST00000495098 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
MTMR3-212ENST00000495098 UBAP1LF5GYI3 381 aa33.65■■■□□ 2.98
MTMR3-212ENST00000495098 DEPDC5O75140 1603 aa33.64■■■□□ 2.98
MTMR3-212ENST00000495098 KANK1Q14678 1352 aa33.64■■■□□ 2.98
MTMR3-212ENST00000495098 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
MTMR3-212ENST00000495098 UBR1Q8IWV7 1749 aa33.6■■■□□ 2.97
MTMR3-212ENST00000495098 IQGAP1P46940 1657 aa33.58■■■□□ 2.97
MTMR3-212ENST00000495098 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa33.58■■■□□ 2.97
MTMR3-212ENST00000495098 MED14O60244 1454 aa33.56■■■□□ 2.96
MTMR3-212ENST00000495098 ADGRL2O95490 1459 aa33.56■■■□□ 2.96
MTMR3-212ENST00000495098 CPS1P31327 1500 aa33.53■■■□□ 2.96
MTMR3-212ENST00000495098 VWDEQ8N2E2 1590 aa33.52■■■□□ 2.96
MTMR3-212ENST00000495098 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
MTMR3-212ENST00000495098 STAG3Q9UJ98 1225 aa33.5■■■□□ 2.95
MTMR3-212ENST00000495098 PIK3C2BO00750 1634 aa33.5■■■□□ 2.95
MTMR3-212ENST00000495098 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP33.49■■■□□ 2.95
MTMR3-212ENST00000495098 DISP3Q9P2K9 1392 aa33.47■■■□□ 2.95
MTMR3-212ENST00000495098 TXNDC2Q86VQ3 553 aa33.46■■■□□ 2.95
MTMR3-212ENST00000495098 LMTK2Q8IWU2 1503 aa33.46■■■□□ 2.95
MTMR3-212ENST00000495098 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa33.45■■■□□ 2.95
MTMR3-212ENST00000495098 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.95
MTMR3-212ENST00000495098 LTKP29376 864 aa33.45■■■□□ 2.95
MTMR3-212ENST00000495098 PIP4K2BP78356 416 aa33.44■■■□□ 2.94
MTMR3-212ENST00000495098 STRCP1A6NGW2 1772 aa33.43■■■□□ 2.94
MTMR3-212ENST00000495098 IDI1Q13907 227 aa33.41■■■□□ 2.94
MTMR3-212ENST00000495098 EID1Q9Y6B2 187 aa33.41■■■□□ 2.94
MTMR3-212ENST00000495098 EFCAB6Q5THR3 1501 aa33.41■■■□□ 2.94
MTMR3-212ENST00000495098 SLIT1O75093 1534 aa33.4■■■□□ 2.94
MTMR3-212ENST00000495098 ARHGAP23Q9P227 1491 aa33.4■■■□□ 2.94
MTMR3-212ENST00000495098 ITGAEP38570 1179 aa33.4■■■□□ 2.94
MTMR3-212ENST00000495098 SYNMO15061 1565 aa33.39■■■□□ 2.94
MTMR3-212ENST00000495098 TOM1O60784 492 aa33.39■■■□□ 2.94
MTMR3-212ENST00000495098 TMEM2Q9UHN6 1383 aa33.34■■■□□ 2.93
MTMR3-212ENST00000495098 NOS1P29475 1434 aa33.33■■■□□ 2.93
MTMR3-212ENST00000495098 ROCK1Q13464 1354 aa33.33■■■□□ 2.93
MTMR3-212ENST00000495098 LRRC7Q96NW7 1537 aa33.3■■■□□ 2.92
MTMR3-212ENST00000495098 TET3O43151 1660 aa33.29■■■□□ 2.92
MTMR3-212ENST00000495098 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
MTMR3-212ENST00000495098 HSPA1LP34931 641 aa33.27■■■□□ 2.92
MTMR3-212ENST00000495098 UNC13BO14795 1591 aa33.26■■■□□ 2.92
MTMR3-212ENST00000495098 SLC52A1Q9NWF4 448 aa33.26■■■□□ 2.91
MTMR3-212ENST00000495098 ADGRB3O60242 1522 aa33.26■■■□□ 2.91
MTMR3-212ENST00000495098 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.26■■■□□ 2.91
MTMR3-212ENST00000495098 MYO5BQ9ULV0 1848 aa33.25■■■□□ 2.91
MTMR3-212ENST00000495098 ILDR2Q71H61 639 aa33.25■■■□□ 2.91
MTMR3-212ENST00000495098 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
MTMR3-212ENST00000495098 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP33.25■■■□□ 2.91
MTMR3-212ENST00000495098 BCANQ96GW7 911 aa33.22■■■□□ 2.91
MTMR3-212ENST00000495098 ALKQ9UM73 1620 aa33.2■■■□□ 2.91
MTMR3-212ENST00000495098 SLC26A8Q96RN1 970 aa33.2■■■□□ 2.91
MTMR3-212ENST00000495098 E9PCH4 1651 aa33.18■■■□□ 2.9
MTMR3-212ENST00000495098 CHGAP10645 457 aaKnown RBP33.18■■■□□ 2.9
MTMR3-212ENST00000495098 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms