RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493016.1

TSC22D1-208, Transcript of TSC22 domain family member 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSC22D1, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1-208ENST00000493016 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.7■■□□□ 1.7
TSC22D1-208ENST00000493016 APLP2Q06481 763 aa25.68■■□□□ 1.7
TSC22D1-208ENST00000493016 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
TSC22D1-208ENST00000493016 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.68■■□□□ 1.7
TSC22D1-208ENST00000493016 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.63■■□□□ 1.69
TSC22D1-208ENST00000493016 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
TSC22D1-208ENST00000493016 PZPP20742 1482 aa25.61■■□□□ 1.69
TSC22D1-208ENST00000493016 PLA2R1Q13018 1463 aa25.61■■□□□ 1.69
TSC22D1-208ENST00000493016 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
TSC22D1-208ENST00000493016 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.59■■□□□ 1.69
TSC22D1-208ENST00000493016 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.59■■□□□ 1.69
TSC22D1-208ENST00000493016 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.58■■□□□ 1.69
TSC22D1-208ENST00000493016 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
TSC22D1-208ENST00000493016 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.58■■□□□ 1.69
TSC22D1-208ENST00000493016 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
TSC22D1-208ENST00000493016 TNRQ92752 1358 aa25.56■■□□□ 1.68
TSC22D1-208ENST00000493016 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
TSC22D1-208ENST00000493016 PKD2Q13563 968 aa25.56■■□□□ 1.68
TSC22D1-208ENST00000493016 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.55■■□□□ 1.68
TSC22D1-208ENST00000493016 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
TSC22D1-208ENST00000493016 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.54■■□□□ 1.68
TSC22D1-208ENST00000493016 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.53■■□□□ 1.68
TSC22D1-208ENST00000493016 ABCC5O15440 1437 aa25.53■■□□□ 1.68
TSC22D1-208ENST00000493016 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.52■■□□□ 1.68
TSC22D1-208ENST00000493016 ABCC3O15438 1527 aa25.52■■□□□ 1.68
TSC22D1-208ENST00000493016 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.52■■□□□ 1.68
TSC22D1-208ENST00000493016 CEP152O94986 1710 aa25.49■■□□□ 1.67
TSC22D1-208ENST00000493016 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
TSC22D1-208ENST00000493016 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
TSC22D1-208ENST00000493016 DAPK1P53355 1430 aa25.48■■□□□ 1.67
TSC22D1-208ENST00000493016 KIF15Q9NS87 1388 aa25.47■■□□□ 1.67
TSC22D1-208ENST00000493016 NLRP1Q9C000 1473 aa25.47■■□□□ 1.67
TSC22D1-208ENST00000493016 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.45■■□□□ 1.66
TSC22D1-208ENST00000493016 ERBINQ96RT1 1412 aa25.45■■□□□ 1.66
TSC22D1-208ENST00000493016 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.44■■□□□ 1.66
TSC22D1-208ENST00000493016 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.44■■□□□ 1.66
TSC22D1-208ENST00000493016 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
TSC22D1-208ENST00000493016 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.43■■□□□ 1.66
TSC22D1-208ENST00000493016 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
TSC22D1-208ENST00000493016 ERVK-7P63135 1459 aa25.4■■□□□ 1.66
TSC22D1-208ENST00000493016 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.4■■□□□ 1.66
TSC22D1-208ENST00000493016 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
TSC22D1-208ENST00000493016 DEPDC5O75140 1603 aa25.39■■□□□ 1.66
TSC22D1-208ENST00000493016 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.65
TSC22D1-208ENST00000493016 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.37■■□□□ 1.65
TSC22D1-208ENST00000493016 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.36■■□□□ 1.65
TSC22D1-208ENST00000493016 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.36■■□□□ 1.65
TSC22D1-208ENST00000493016 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.34■■□□□ 1.65
TSC22D1-208ENST00000493016 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
TSC22D1-208ENST00000493016 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.31■■□□□ 1.64
TSC22D1-208ENST00000493016 KANK1Q14678 1352 aa25.31■■□□□ 1.64
TSC22D1-208ENST00000493016 MED14O60244 1454 aa25.3■■□□□ 1.64
TSC22D1-208ENST00000493016 ADGRL2O95490 1459 aa25.3■■□□□ 1.64
TSC22D1-208ENST00000493016 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
TSC22D1-208ENST00000493016 IQGAP1P46940 1657 aa25.28■■□□□ 1.64
TSC22D1-208ENST00000493016 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
TSC22D1-208ENST00000493016 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.27■■□□□ 1.64
TSC22D1-208ENST00000493016 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.26■■□□□ 1.63
TSC22D1-208ENST00000493016 CPS1P31327 1500 aa25.25■■□□□ 1.63
TSC22D1-208ENST00000493016 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.21■■□□□ 1.63
TSC22D1-208ENST00000493016 PIK3C2BO00750 1634 aa25.2■■□□□ 1.62
TSC22D1-208ENST00000493016 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.19■■□□□ 1.62
TSC22D1-208ENST00000493016 SLIT1O75093 1534 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC22D1-208ENST00000493016 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC22D1-208ENST00000493016 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.18■■□□□ 1.62
TSC22D1-208ENST00000493016 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TSC22D1-208ENST00000493016 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TSC22D1-208ENST00000493016 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.15■■□□□ 1.62
TSC22D1-208ENST00000493016 SYNMO15061 1565 aa25.14■■□□□ 1.62
TSC22D1-208ENST00000493016 NOS1P29475 1434 aa25.12■■□□□ 1.61
TSC22D1-208ENST00000493016 LTKP29376 864 aa25.12■■□□□ 1.61
TSC22D1-208ENST00000493016 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.12■■□□□ 1.61
TSC22D1-208ENST00000493016 IDI1Q13907 227 aa25.11■■□□□ 1.61
TSC22D1-208ENST00000493016 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.11■■□□□ 1.61
TSC22D1-208ENST00000493016 TET3O43151 1660 aa25.1■■□□□ 1.61
TSC22D1-208ENST00000493016 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TSC22D1-208ENST00000493016 ROCK1Q13464 1354 aa25.09■■□□□ 1.61
TSC22D1-208ENST00000493016 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.09■■□□□ 1.61
TSC22D1-208ENST00000493016 EID1Q9Y6B2 187 aa25.09■■□□□ 1.61
TSC22D1-208ENST00000493016 UNC13BO14795 1591 aa25.09■■□□□ 1.61
TSC22D1-208ENST00000493016 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.08■■□□□ 1.61
TSC22D1-208ENST00000493016 TOM1O60784 492 aa25.07■■□□□ 1.6
TSC22D1-208ENST00000493016 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.06■■□□□ 1.6
TSC22D1-208ENST00000493016 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TSC22D1-208ENST00000493016 ADGRB3O60242 1522 aa25.05■■□□□ 1.6
TSC22D1-208ENST00000493016 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.05■■□□□ 1.6
TSC22D1-208ENST00000493016 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.04■■□□□ 1.6
TSC22D1-208ENST00000493016 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TSC22D1-208ENST00000493016 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.02■■□□□ 1.6
TSC22D1-208ENST00000493016 PIP4K2BP78356 416 aa25.01■■□□□ 1.59
TSC22D1-208ENST00000493016 ITGAEP38570 1179 aa25■■□□□ 1.59
TSC22D1-208ENST00000493016 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25■■□□□ 1.59
TSC22D1-208ENST00000493016 ALKQ9UM73 1620 aa25■■□□□ 1.59
TSC22D1-208ENST00000493016 E9PCH4 1651 aa25■■□□□ 1.59
TSC22D1-208ENST00000493016 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
TSC22D1-208ENST00000493016 HSPA1LP34931 641 aa24.94■■□□□ 1.58
TSC22D1-208ENST00000493016 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.94■■□□□ 1.58
TSC22D1-208ENST00000493016 NUP155O75694 1391 aa24.92■■□□□ 1.58
TSC22D1-208ENST00000493016 ZFYVE9O95405 1425 aa24.9■■□□□ 1.58
TSC22D1-208ENST00000493016 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms