RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491530.5

CHTF18-211, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 819 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-211ENST00000491530 GGT6Q6P531 493 aa23.61■■□□□ 1.37
CHTF18-211ENST00000491530 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.6■■□□□ 1.37
CHTF18-211ENST00000491530 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.6■■□□□ 1.37
CHTF18-211ENST00000491530 NPATQ14207 1427 aa23.59■■□□□ 1.37
CHTF18-211ENST00000491530 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CHTF18-211ENST00000491530 NCOA1Q15788 1441 aa23.59■■□□□ 1.37
CHTF18-211ENST00000491530 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.58■■□□□ 1.36
CHTF18-211ENST00000491530 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.56■■□□□ 1.36
CHTF18-211ENST00000491530 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.56■■□□□ 1.36
CHTF18-211ENST00000491530 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CHTF18-211ENST00000491530 PTPRKQ15262 1439 aa23.56■■□□□ 1.36
CHTF18-211ENST00000491530 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.52■■□□□ 1.36
CHTF18-211ENST00000491530 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CHTF18-211ENST00000491530 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.51■■□□□ 1.35
CHTF18-211ENST00000491530 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.51■■□□□ 1.35
CHTF18-211ENST00000491530 TSPY4P0CV99 314 aa23.51■■□□□ 1.35
CHTF18-211ENST00000491530 TSPY10P0CW01 314 aa23.51■■□□□ 1.35
CHTF18-211ENST00000491530 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CHTF18-211ENST00000491530 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.5■■□□□ 1.35
CHTF18-211ENST00000491530 ADGRL2O95490 1459 aa23.48■■□□□ 1.35
CHTF18-211ENST00000491530 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.46■■□□□ 1.35
CHTF18-211ENST00000491530 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CHTF18-211ENST00000491530 ITGAEP38570 1179 aa23.45■■□□□ 1.34
CHTF18-211ENST00000491530 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.44■■□□□ 1.34
CHTF18-211ENST00000491530 CEP152O94986 1710 aa23.42■■□□□ 1.34
CHTF18-211ENST00000491530 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.42■■□□□ 1.34
CHTF18-211ENST00000491530 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CHTF18-211ENST00000491530 DEPDC5O75140 1603 aa23.42■■□□□ 1.34
CHTF18-211ENST00000491530 KIF3BO15066 747 aa23.42■■□□□ 1.34
CHTF18-211ENST00000491530 PLA2R1Q13018 1463 aa23.42■■□□□ 1.34
CHTF18-211ENST00000491530 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CHTF18-211ENST00000491530 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.4■■□□□ 1.34
CHTF18-211ENST00000491530 PKD2Q13563 968 aa23.4■■□□□ 1.34
CHTF18-211ENST00000491530 PZPP20742 1482 aa23.4■■□□□ 1.34
CHTF18-211ENST00000491530 ROCK1Q13464 1354 aa23.4■■□□□ 1.34
CHTF18-211ENST00000491530 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.4■■□□□ 1.34
CHTF18-211ENST00000491530 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.39■■□□□ 1.34
CHTF18-211ENST00000491530 KIF15Q9NS87 1388 aa23.39■■□□□ 1.33
CHTF18-211ENST00000491530 ABCC3O15438 1527 aa23.38■■□□□ 1.33
CHTF18-211ENST00000491530 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.37■■□□□ 1.33
CHTF18-211ENST00000491530 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.36■■□□□ 1.33
CHTF18-211ENST00000491530 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CHTF18-211ENST00000491530 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CHTF18-211ENST00000491530 TNRQ92752 1358 aa23.34■■□□□ 1.33
CHTF18-211ENST00000491530 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.33■■□□□ 1.33
CHTF18-211ENST00000491530 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.32■■□□□ 1.32
CHTF18-211ENST00000491530 ERBINQ96RT1 1412 aa23.32■■□□□ 1.32
CHTF18-211ENST00000491530 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.31■■□□□ 1.32
CHTF18-211ENST00000491530 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.31■■□□□ 1.32
CHTF18-211ENST00000491530 ILDR2Q71H61 639 aa23.3■■□□□ 1.32
CHTF18-211ENST00000491530 NAIPQ13075 1403 aa23.29■■□□□ 1.32
CHTF18-211ENST00000491530 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.28■■□□□ 1.32
CHTF18-211ENST00000491530 HFM1A2PYH4 1435 aa23.28■■□□□ 1.32
CHTF18-211ENST00000491530 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.27■■□□□ 1.32
CHTF18-211ENST00000491530 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CHTF18-211ENST00000491530 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.26■■□□□ 1.31
CHTF18-211ENST00000491530 ERVK-7P63135 1459 aa23.23■■□□□ 1.31
CHTF18-211ENST00000491530 NLRP1Q9C000 1473 aa23.22■■□□□ 1.31
CHTF18-211ENST00000491530 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.21■■□□□ 1.31
CHTF18-211ENST00000491530 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.2■■□□□ 1.3
CHTF18-211ENST00000491530 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
CHTF18-211ENST00000491530 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.19■■□□□ 1.3
CHTF18-211ENST00000491530 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.19■■□□□ 1.3
CHTF18-211ENST00000491530 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CHTF18-211ENST00000491530 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CHTF18-211ENST00000491530 UNC13BO14795 1591 aa23.18■■□□□ 1.3
CHTF18-211ENST00000491530 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.17■■□□□ 1.3
CHTF18-211ENST00000491530 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.15■■□□□ 1.3
CHTF18-211ENST00000491530 SOCS7O14512 581 aa23.15■■□□□ 1.3
CHTF18-211ENST00000491530 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.15■■□□□ 1.3
CHTF18-211ENST00000491530 CPS1P31327 1500 aa23.14■■□□□ 1.3
CHTF18-211ENST00000491530 PIP4K2BP78356 416 aa23.14■■□□□ 1.29
CHTF18-211ENST00000491530 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CHTF18-211ENST00000491530 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CHTF18-211ENST00000491530 SYNMO15061 1565 aa23.1■■□□□ 1.29
CHTF18-211ENST00000491530 TET3O43151 1660 aa23.09■■□□□ 1.29
CHTF18-211ENST00000491530 IQGAP1P46940 1657 aa23.09■■□□□ 1.29
CHTF18-211ENST00000491530 PIK3C2BO00750 1634 aa23.09■■□□□ 1.29
CHTF18-211ENST00000491530 TOM1O60784 492 aa23.09■■□□□ 1.29
CHTF18-211ENST00000491530 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.09■■□□□ 1.29
CHTF18-211ENST00000491530 MED14O60244 1454 aa23.09■■□□□ 1.29
CHTF18-211ENST00000491530 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.08■■□□□ 1.29
CHTF18-211ENST00000491530 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.299e-8■□□□□ 10.2
CHTF18-211ENST00000491530 HSPA1LP34931 641 aa23.06■■□□□ 1.28
CHTF18-211ENST00000491530 SLIT1O75093 1534 aa23.03■■□□□ 1.28
CHTF18-211ENST00000491530 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.03■■□□□ 1.28
CHTF18-211ENST00000491530 NUP155O75694 1391 aa23.02■■□□□ 1.28
CHTF18-211ENST00000491530 KANK1Q14678 1352 aa23.02■■□□□ 1.28
CHTF18-211ENST00000491530 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.01■■□□□ 1.27
CHTF18-211ENST00000491530 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.01■■□□□ 1.27
CHTF18-211ENST00000491530 E9PCH4 1651 aa23■■□□□ 1.27
CHTF18-211ENST00000491530 NOS1P29475 1434 aa22.99■■□□□ 1.27
CHTF18-211ENST00000491530 HRCP23327 699 aa22.99■■□□□ 1.27
CHTF18-211ENST00000491530 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.98■■□□□ 1.27
CHTF18-211ENST00000491530 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CHTF18-211ENST00000491530 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CHTF18-211ENST00000491530 ADGRB3O60242 1522 aa22.98■■□□□ 1.27
CHTF18-211ENST00000491530 TRIM52Q96A61 297 aa22.96■■□□□ 1.27
CHTF18-211ENST00000491530 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CHTF18-211ENST00000491530 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.95■■□□□ 1.26
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