RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491036.2

LAMA5-210, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 2

Gene LAMA5, Length 728 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-210ENST00000491036 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.36■■□□□ 1.65
LAMA5-210ENST00000491036 MIA2Q96PC5 1412 aa25.35■■□□□ 1.65
LAMA5-210ENST00000491036 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.35■■□□□ 1.65
LAMA5-210ENST00000491036 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.34■■□□□ 1.65
LAMA5-210ENST00000491036 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.33■■□□□ 1.65
LAMA5-210ENST00000491036 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
LAMA5-210ENST00000491036 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.31■■□□□ 1.64
LAMA5-210ENST00000491036 PLA2R1Q13018 1463 aa25.28■■□□□ 1.64
LAMA5-210ENST00000491036 PKD2Q13563 968 aa25.28■■□□□ 1.64
LAMA5-210ENST00000491036 TNRQ92752 1358 aa25.28■■□□□ 1.64
LAMA5-210ENST00000491036 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.28■■□□□ 1.64
LAMA5-210ENST00000491036 PZPP20742 1482 aa25.28■■□□□ 1.64
LAMA5-210ENST00000491036 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
LAMA5-210ENST00000491036 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.26■■□□□ 1.63
LAMA5-210ENST00000491036 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
LAMA5-210ENST00000491036 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.24■■□□□ 1.63
LAMA5-210ENST00000491036 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
LAMA5-210ENST00000491036 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
LAMA5-210ENST00000491036 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.2■■□□□ 1.62
LAMA5-210ENST00000491036 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
LAMA5-210ENST00000491036 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.19■■□□□ 1.62
LAMA5-210ENST00000491036 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
LAMA5-210ENST00000491036 ABCC5O15440 1437 aa25.18■■□□□ 1.62
LAMA5-210ENST00000491036 CEP152O94986 1710 aa25.17■■□□□ 1.62
LAMA5-210ENST00000491036 ABCC3O15438 1527 aa25.17■■□□□ 1.62
LAMA5-210ENST00000491036 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
LAMA5-210ENST00000491036 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
LAMA5-210ENST00000491036 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.16■■□□□ 1.62
LAMA5-210ENST00000491036 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.15■■□□□ 1.62
LAMA5-210ENST00000491036 KIF15Q9NS87 1388 aa25.15■■□□□ 1.62
LAMA5-210ENST00000491036 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.15■■□□□ 1.62
LAMA5-210ENST00000491036 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.15■■□□□ 1.62
LAMA5-210ENST00000491036 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.14■■□□□ 1.61
LAMA5-210ENST00000491036 NLRP1Q9C000 1473 aa25.14■■□□□ 1.61
LAMA5-210ENST00000491036 DAPK1P53355 1430 aa25.13■■□□□ 1.61
LAMA5-210ENST00000491036 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
LAMA5-210ENST00000491036 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
LAMA5-210ENST00000491036 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.12■■□□□ 1.61
LAMA5-210ENST00000491036 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.1■■□□□ 1.61
LAMA5-210ENST00000491036 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.1■■□□□ 1.61
LAMA5-210ENST00000491036 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.1■■□□□ 1.61
LAMA5-210ENST00000491036 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
LAMA5-210ENST00000491036 ERBINQ96RT1 1412 aa25.08■■□□□ 1.61
LAMA5-210ENST00000491036 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.08■■□□□ 1.61
LAMA5-210ENST00000491036 ERVK-7P63135 1459 aa25.08■■□□□ 1.6
LAMA5-210ENST00000491036 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.05■■□□□ 1.6
LAMA5-210ENST00000491036 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
LAMA5-210ENST00000491036 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.03■■□□□ 1.6
LAMA5-210ENST00000491036 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
LAMA5-210ENST00000491036 KANK1Q14678 1352 aa25.02■■□□□ 1.6
LAMA5-210ENST00000491036 DEPDC5O75140 1603 aa25.01■■□□□ 1.59
LAMA5-210ENST00000491036 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
LAMA5-210ENST00000491036 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.98■■□□□ 1.59
LAMA5-210ENST00000491036 MED14O60244 1454 aa24.97■■□□□ 1.59
LAMA5-210ENST00000491036 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.97■■□□□ 1.59
LAMA5-210ENST00000491036 IQGAP1P46940 1657 aa24.97■■□□□ 1.59
LAMA5-210ENST00000491036 CPS1P31327 1500 aa24.96■■□□□ 1.59
LAMA5-210ENST00000491036 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.93■■□□□ 1.58
LAMA5-210ENST00000491036 ADGRL2O95490 1459 aa24.92■■□□□ 1.58
LAMA5-210ENST00000491036 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.91■■□□□ 1.58
LAMA5-210ENST00000491036 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.89■■□□□ 1.58
LAMA5-210ENST00000491036 PIK3C2BO00750 1634 aa24.89■■□□□ 1.57
LAMA5-210ENST00000491036 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.88■■□□□ 1.57
LAMA5-210ENST00000491036 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.88■■□□□ 1.57
LAMA5-210ENST00000491036 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
LAMA5-210ENST00000491036 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
LAMA5-210ENST00000491036 TOM1O60784 492 aa24.85■■□□□ 1.57
LAMA5-210ENST00000491036 LTKP29376 864 aa24.85■■□□□ 1.57
LAMA5-210ENST00000491036 PIP4K2BP78356 416 aa24.85■■□□□ 1.57
LAMA5-210ENST00000491036 SLIT1O75093 1534 aa24.85■■□□□ 1.57
LAMA5-210ENST00000491036 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.85■■□□□ 1.57
LAMA5-210ENST00000491036 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.85■■□□□ 1.57
LAMA5-210ENST00000491036 EID1Q9Y6B2 187 aa24.84■■□□□ 1.57
LAMA5-210ENST00000491036 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.83■■□□□ 1.57
LAMA5-210ENST00000491036 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.82■■□□□ 1.56
LAMA5-210ENST00000491036 IDI1Q13907 227 aa24.82■■□□□ 1.56
LAMA5-210ENST00000491036 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
LAMA5-210ENST00000491036 SYNMO15061 1565 aa24.8■■□□□ 1.56
LAMA5-210ENST00000491036 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.79■■□□□ 1.56
LAMA5-210ENST00000491036 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
LAMA5-210ENST00000491036 NOS1P29475 1434 aa24.78■■□□□ 1.56
LAMA5-210ENST00000491036 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.76■■□□□ 1.55
LAMA5-210ENST00000491036 ITGAEP38570 1179 aa24.75■■□□□ 1.55
LAMA5-210ENST00000491036 TET3O43151 1660 aa24.75■■□□□ 1.55
LAMA5-210ENST00000491036 HSPA1LP34931 641 aa24.73■■□□□ 1.55
LAMA5-210ENST00000491036 ILDR2Q71H61 639 aa24.73■■□□□ 1.55
LAMA5-210ENST00000491036 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.73■■□□□ 1.55
LAMA5-210ENST00000491036 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
LAMA5-210ENST00000491036 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.72■■□□□ 1.55
LAMA5-210ENST00000491036 UNC13BO14795 1591 aa24.71■■□□□ 1.55
LAMA5-210ENST00000491036 ADGRB3O60242 1522 aa24.71■■□□□ 1.55
LAMA5-210ENST00000491036 ROCK1Q13464 1354 aa24.7■■□□□ 1.55
LAMA5-210ENST00000491036 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.69■■□□□ 1.54
LAMA5-210ENST00000491036 ALKQ9UM73 1620 aa24.68■■□□□ 1.54
LAMA5-210ENST00000491036 BCANQ96GW7 911 aa24.67■■□□□ 1.54
LAMA5-210ENST00000491036 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.66■■□□□ 1.54
LAMA5-210ENST00000491036 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
LAMA5-210ENST00000491036 E9PCH4 1651 aa24.65■■□□□ 1.54
LAMA5-210ENST00000491036 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
LAMA5-210ENST00000491036 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms