RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490386.1

CLEC3B-203, Transcript of C-type lectin domain family 3 member B, humanhuman

TSL 3

Gene CLEC3B, Length 708 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3B-203ENST00000490386 KDM5DQ9BY66 1539 aa45.08■■■■■ 4.81
CLEC3B-203ENST00000490386 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa45.02■■■■■ 4.8
CLEC3B-203ENST00000490386 PKD2Q13563 968 aa45.02■■■■■ 4.8
CLEC3B-203ENST00000490386 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP45.01■■■■■ 4.8
CLEC3B-203ENST00000490386 PZPP20742 1482 aa45■■■■■ 4.79
CLEC3B-203ENST00000490386 FGD6Q6ZV73 1430 aa44.99■■■■■ 4.79
CLEC3B-203ENST00000490386 ABCC5O15440 1437 aa44.98■■■■■ 4.79
CLEC3B-203ENST00000490386 MYO3AQ8NEV4 1616 aa44.97■■■■■ 4.79
CLEC3B-203ENST00000490386 TNRQ92752 1358 aa44.97■■■■■ 4.79
CLEC3B-203ENST00000490386 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP44.97■■■■■ 4.79
CLEC3B-203ENST00000490386 PLA2R1Q13018 1463 aa44.97■■■■■ 4.79
CLEC3B-203ENST00000490386 PTPN23Q9H3S7 1636 aa44.97■■■■■ 4.79
CLEC3B-203ENST00000490386 SHANK2Q9UPX8 1470 aa44.96■■■■■ 4.79
CLEC3B-203ENST00000490386 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa44.95■■■■■ 4.79
CLEC3B-203ENST00000490386 A2ML1A8K2U0 1454 aa44.94■■■■■ 4.78
CLEC3B-203ENST00000490386 DUOX2Q9NRD8 1548 aa44.94■■■■■ 4.78
CLEC3B-203ENST00000490386 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP44.93■■■■■ 4.78
CLEC3B-203ENST00000490386 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
CLEC3B-203ENST00000490386 KIF15Q9NS87 1388 aa44.91■■■■■ 4.78
CLEC3B-203ENST00000490386 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP44.9■■■■■ 4.78
CLEC3B-203ENST00000490386 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa44.9■■■■■ 4.78
CLEC3B-203ENST00000490386 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP44.9■■■■■ 4.78
CLEC3B-203ENST00000490386 DAPK1P53355 1430 aa44.89■■■■■ 4.78
CLEC3B-203ENST00000490386 ERBINQ96RT1 1412 aa44.82■■■■■ 4.77
CLEC3B-203ENST00000490386 ABCC3O15438 1527 aa44.81■■■■■ 4.76
CLEC3B-203ENST00000490386 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP44.81■■■■■ 4.76
CLEC3B-203ENST00000490386 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa44.8■■■■■ 4.76
CLEC3B-203ENST00000490386 NLRP1Q9C000 1473 aa44.79■■■■■ 4.76
CLEC3B-203ENST00000490386 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
CLEC3B-203ENST00000490386 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
CLEC3B-203ENST00000490386 CHIC2Q9UKJ5 165 aa44.75■■■■■ 4.75
CLEC3B-203ENST00000490386 CROCC2H7BZ55 1655 aa44.74■■■■■ 4.75
CLEC3B-203ENST00000490386 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP44.71■■■■■ 4.75
CLEC3B-203ENST00000490386 ANKLE2Q86XL3 938 aa44.7■■■■■ 4.75
CLEC3B-203ENST00000490386 LTBP4Q8N2S1 1624 aa44.7■■■■■ 4.75
CLEC3B-203ENST00000490386 MROH1Q8NDA8 1641 aa44.7■■■■■ 4.75
CLEC3B-203ENST00000490386 KANK1Q14678 1352 aa44.66■■■■■ 4.74
CLEC3B-203ENST00000490386 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP44.65■■■■■ 4.74
CLEC3B-203ENST00000490386 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa44.65■■■■■ 4.74
CLEC3B-203ENST00000490386 IQSEC2Q5JU85 1478 aa44.64■■■■■ 4.74
CLEC3B-203ENST00000490386 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP44.63■■■■■ 4.74
CLEC3B-203ENST00000490386 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa44.63■■■■■ 4.73
CLEC3B-203ENST00000490386 UGGT1Q9NYU2 1555 aa44.63■■■■■ 4.73
CLEC3B-203ENST00000490386 ERVK-7P63135 1459 aa44.62■■■■■ 4.73
CLEC3B-203ENST00000490386 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP44.62■■■■■ 4.73
CLEC3B-203ENST00000490386 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP44.61■■■■■ 4.73
CLEC3B-203ENST00000490386 ADGRL2O95490 1459 aa44.57■■■■■ 4.73
CLEC3B-203ENST00000490386 CEP152O94986 1710 aa44.5■■■■■ 4.71
CLEC3B-203ENST00000490386 DEPDC5O75140 1603 aa44.5■■■■■ 4.71
CLEC3B-203ENST00000490386 MED14O60244 1454 aa44.45■■■■■ 4.71
CLEC3B-203ENST00000490386 NEURL4Q96JN8 1562 aa44.43■■■■■ 4.7
CLEC3B-203ENST00000490386 LMTK2Q8IWU2 1503 aa44.43■■■■■ 4.7
CLEC3B-203ENST00000490386 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa44.42■■■■■ 4.7
CLEC3B-203ENST00000490386 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
CLEC3B-203ENST00000490386 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
CLEC3B-203ENST00000490386 VWDEQ8N2E2 1590 aa44.38■■■■■ 4.69
CLEC3B-203ENST00000490386 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP44.32■■■■■ 4.69
CLEC3B-203ENST00000490386 ROCK1Q13464 1354 aa44.31■■■■■ 4.68
CLEC3B-203ENST00000490386 UBAP1LF5GYI3 381 aa44.31■■■■■ 4.68
CLEC3B-203ENST00000490386 STAG3Q9UJ98 1225 aa44.31■■■■■ 4.68
CLEC3B-203ENST00000490386 CPS1P31327 1500 aa44.29■■■■■ 4.68
CLEC3B-203ENST00000490386 EID1Q9Y6B2 187 aa44.29■■■■■ 4.68
CLEC3B-203ENST00000490386 TXNDC2Q86VQ3 553 aa44.28■■■■■ 4.68
CLEC3B-203ENST00000490386 IDI1Q13907 227 aa44.27■■■■■ 4.68
CLEC3B-203ENST00000490386 UBR1Q8IWV7 1749 aa44.25■■■■■ 4.67
CLEC3B-203ENST00000490386 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.25■■■■■ 4.67
CLEC3B-203ENST00000490386 SLC52A1Q9NWF4 448 aa44.25■■■■■ 4.67
CLEC3B-203ENST00000490386 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP44.23■■■■■ 4.67
CLEC3B-203ENST00000490386 ARHGAP23Q9P227 1491 aa44.23■■■■■ 4.67
CLEC3B-203ENST00000490386 SLIT1O75093 1534 aa44.23■■■■■ 4.67
CLEC3B-203ENST00000490386 LTKP29376 864 aa44.22■■■■■ 4.67
CLEC3B-203ENST00000490386 NOS1P29475 1434 aa44.22■■■■■ 4.67
CLEC3B-203ENST00000490386 EFCAB6Q5THR3 1501 aa44.2■■■■■ 4.67
CLEC3B-203ENST00000490386 IQGAP1P46940 1657 aa44.19■■■■■ 4.67
CLEC3B-203ENST00000490386 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.66
CLEC3B-203ENST00000490386 TMEM2Q9UHN6 1383 aa44.18■■■■■ 4.66
CLEC3B-203ENST00000490386 TOM1O60784 492 aa44.15■■■■■ 4.66
CLEC3B-203ENST00000490386 ITGAEP38570 1179 aa44.15■■■■■ 4.66
CLEC3B-203ENST00000490386 PIK3C2BO00750 1634 aa44.11■■■■■ 4.65
CLEC3B-203ENST00000490386 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
CLEC3B-203ENST00000490386 SYNMO15061 1565 aa44.06■■■■■ 4.64
CLEC3B-203ENST00000490386 UNC13BO14795 1591 aa44.02■■■■■ 4.64
CLEC3B-203ENST00000490386 TET3O43151 1660 aa44.02■■■■■ 4.64
CLEC3B-203ENST00000490386 HDGFP51858 240 aaKnown RBP43.99■■■■■ 4.63
CLEC3B-203ENST00000490386 NUP155O75694 1391 aa43.98■■■■■ 4.63
CLEC3B-203ENST00000490386 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP43.96■■■■■ 4.63
CLEC3B-203ENST00000490386 ADGRB3O60242 1522 aa43.94■■■■■ 4.63
CLEC3B-203ENST00000490386 PIP4K2BP78356 416 aa43.94■■■■■ 4.62
CLEC3B-203ENST00000490386 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP43.93■■■■■ 4.62
CLEC3B-203ENST00000490386 LRRC7Q96NW7 1537 aa43.93■■■■■ 4.62
CLEC3B-203ENST00000490386 GCC2Q8IWJ2 1684 aa43.89■■■■■ 4.62
CLEC3B-203ENST00000490386 IQGAP3Q86VI3 1631 aa43.86■■■■■ 4.61
CLEC3B-203ENST00000490386 DISP3Q9P2K9 1392 aa43.86■■■■■ 4.61
CLEC3B-203ENST00000490386 KCNA6P17658 529 aa43.83■■■■■ 4.61
CLEC3B-203ENST00000490386 BCANQ96GW7 911 aa43.83■■■■■ 4.61
CLEC3B-203ENST00000490386 SLC26A8Q96RN1 970 aa43.83■■■■■ 4.61
CLEC3B-203ENST00000490386 STRCP1A6NGW2 1772 aa43.82■■■■■ 4.61
CLEC3B-203ENST00000490386 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP43.82■■■■■ 4.61
CLEC3B-203ENST00000490386 CHGAP10645 457 aaKnown RBP43.8■■■■■ 4.6
CLEC3B-203ENST00000490386 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP43.79■■■■■ 4.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms