RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489824.1

RPS6KB1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase B1, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KB1, Length 909 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1-208ENST00000489824 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.69■■■□□ 2.5
RPS6KB1-208ENST00000489824 MAP3K1Q13233 1512 aa30.68■■■□□ 2.5
RPS6KB1-208ENST00000489824 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
RPS6KB1-208ENST00000489824 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.68■■■□□ 2.5
RPS6KB1-208ENST00000489824 TNRQ92752 1358 aa30.66■■■□□ 2.5
RPS6KB1-208ENST00000489824 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.65■■■□□ 2.5
RPS6KB1-208ENST00000489824 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.65■■■□□ 2.5
RPS6KB1-208ENST00000489824 APLP2Q06481 763 aa30.64■■■□□ 2.5
RPS6KB1-208ENST00000489824 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
RPS6KB1-208ENST00000489824 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.63■■■□□ 2.49
RPS6KB1-208ENST00000489824 PZPP20742 1482 aa30.63■■■□□ 2.49
RPS6KB1-208ENST00000489824 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
RPS6KB1-208ENST00000489824 MIA2Q96PC5 1412 aa30.62■■■□□ 2.49
RPS6KB1-208ENST00000489824 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.61■■■□□ 2.49
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
RPS6KB1-208ENST00000489824 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.58■■■□□ 2.49
RPS6KB1-208ENST00000489824 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
RPS6KB1-208ENST00000489824 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
RPS6KB1-208ENST00000489824 NLRP1Q9C000 1473 aa30.5■■■□□ 2.47
RPS6KB1-208ENST00000489824 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
RPS6KB1-208ENST00000489824 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.47■■■□□ 2.47
RPS6KB1-208ENST00000489824 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
RPS6KB1-208ENST00000489824 ABCC3O15438 1527 aa30.46■■■□□ 2.47
RPS6KB1-208ENST00000489824 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.45■■■□□ 2.47
RPS6KB1-208ENST00000489824 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.45■■■□□ 2.47
RPS6KB1-208ENST00000489824 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.44■■■□□ 2.46
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
RPS6KB1-208ENST00000489824 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.43■■■□□ 2.46
RPS6KB1-208ENST00000489824 KIF15Q9NS87 1388 aa30.41■■■□□ 2.46
RPS6KB1-208ENST00000489824 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.41■■■□□ 2.46
RPS6KB1-208ENST00000489824 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
RPS6KB1-208ENST00000489824 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.39■■■□□ 2.46
RPS6KB1-208ENST00000489824 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.39■■■□□ 2.46
RPS6KB1-208ENST00000489824 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.39■■■□□ 2.46
RPS6KB1-208ENST00000489824 ABCC5O15440 1437 aa30.39■■■□□ 2.45
RPS6KB1-208ENST00000489824 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.37■■■□□ 2.45
RPS6KB1-208ENST00000489824 ERVK-7P63135 1459 aa30.36■■■□□ 2.45
RPS6KB1-208ENST00000489824 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.36■■■□□ 2.45
RPS6KB1-208ENST00000489824 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.35■■■□□ 2.45
RPS6KB1-208ENST00000489824 ERBINQ96RT1 1412 aa30.35■■■□□ 2.45
RPS6KB1-208ENST00000489824 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.35■■■□□ 2.45
RPS6KB1-208ENST00000489824 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
RPS6KB1-208ENST00000489824 DAPK1P53355 1430 aa30.33■■■□□ 2.45
RPS6KB1-208ENST00000489824 CPS1P31327 1500 aa30.32■■■□□ 2.44
RPS6KB1-208ENST00000489824 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.32■■■□□ 2.44
RPS6KB1-208ENST00000489824 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.32■■■□□ 2.44
RPS6KB1-208ENST00000489824 CEP152O94986 1710 aa30.3■■■□□ 2.44
RPS6KB1-208ENST00000489824 MED14O60244 1454 aa30.29■■■□□ 2.44
RPS6KB1-208ENST00000489824 DEPDC5O75140 1603 aa30.29■■■□□ 2.44
RPS6KB1-208ENST00000489824 KANK1Q14678 1352 aa30.28■■■□□ 2.44
RPS6KB1-208ENST00000489824 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.28■■■□□ 2.44
RPS6KB1-208ENST00000489824 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
RPS6KB1-208ENST00000489824 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.27■■■□□ 2.44
RPS6KB1-208ENST00000489824 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.44
RPS6KB1-208ENST00000489824 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.24■■■□□ 2.43
RPS6KB1-208ENST00000489824 TOM1O60784 492 aa30.24■■■□□ 2.43
RPS6KB1-208ENST00000489824 IQGAP1P46940 1657 aa30.21■■■□□ 2.43
RPS6KB1-208ENST00000489824 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.21■■■□□ 2.43
RPS6KB1-208ENST00000489824 PIP4K2BP78356 416 aa30.21■■■□□ 2.43
RPS6KB1-208ENST00000489824 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
RPS6KB1-208ENST00000489824 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.17■■■□□ 2.42
RPS6KB1-208ENST00000489824 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
RPS6KB1-208ENST00000489824 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
RPS6KB1-208ENST00000489824 ILDR2Q71H61 639 aa30.15■■■□□ 2.42
RPS6KB1-208ENST00000489824 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.15■■■□□ 2.42
RPS6KB1-208ENST00000489824 EID1Q9Y6B2 187 aa30.15■■■□□ 2.42
RPS6KB1-208ENST00000489824 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.15■■■□□ 2.42
RPS6KB1-208ENST00000489824 SLIT1O75093 1534 aa30.09■■■□□ 2.41
RPS6KB1-208ENST00000489824 LTKP29376 864 aa30.09■■■□□ 2.41
RPS6KB1-208ENST00000489824 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.09■■■□□ 2.41
RPS6KB1-208ENST00000489824 ADGRL2O95490 1459 aa30.08■■■□□ 2.41
RPS6KB1-208ENST00000489824 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.08■■■□□ 2.41
RPS6KB1-208ENST00000489824 HSPA1LP34931 641 aa30.08■■■□□ 2.41
RPS6KB1-208ENST00000489824 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.04■■■□□ 2.4
RPS6KB1-208ENST00000489824 PIK3C2BO00750 1634 aa30.04■■■□□ 2.4
RPS6KB1-208ENST00000489824 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.03■■■□□ 2.4
RPS6KB1-208ENST00000489824 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.03■■■□□ 2.4
RPS6KB1-208ENST00000489824 SOCS7O14512 581 aa30.02■■■□□ 2.4
RPS6KB1-208ENST00000489824 IDI1Q13907 227 aa30.02■■■□□ 2.4
RPS6KB1-208ENST00000489824 SYNMO15061 1565 aa30.02■■■□□ 2.4
RPS6KB1-208ENST00000489824 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.01■■■□□ 2.39
RPS6KB1-208ENST00000489824 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.98■■■□□ 2.39
RPS6KB1-208ENST00000489824 NOS1P29475 1434 aa29.96■■■□□ 2.39
RPS6KB1-208ENST00000489824 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.96■■■□□ 2.39
RPS6KB1-208ENST00000489824 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
RPS6KB1-208ENST00000489824 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
RPS6KB1-208ENST00000489824 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
RPS6KB1-208ENST00000489824 ALKQ9UM73 1620 aa29.91■■■□□ 2.38
RPS6KB1-208ENST00000489824 ADGRB3O60242 1522 aa29.91■■■□□ 2.38
RPS6KB1-208ENST00000489824 BCANQ96GW7 911 aa29.9■■■□□ 2.38
RPS6KB1-208ENST00000489824 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.87■■■□□ 2.37
RPS6KB1-208ENST00000489824 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
RPS6KB1-208ENST00000489824 KCNA6P17658 529 aa29.84■■■□□ 2.37
RPS6KB1-208ENST00000489824 ROCK1Q13464 1354 aa29.84■■■□□ 2.37
RPS6KB1-208ENST00000489824 TET3O43151 1660 aa29.83■■■□□ 2.37
RPS6KB1-208ENST00000489824 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
RPS6KB1-208ENST00000489824 ITGAEP38570 1179 aa29.82■■■□□ 2.36
RPS6KB1-208ENST00000489824 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
RPS6KB1-208ENST00000489824 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
RPS6KB1-208ENST00000489824 TMEM94Q12767 1356 aa29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms