RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489495.5

FUBP1-211, Transcript of far upstream element binding protein 1, human

TSL 2

Gene FUBP1, Length 2,156 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FUBP1-211	ENST00000489495	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FUBP1-211	ENST00000489495	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FUBP1-211	ENST00000489495	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FUBP1-211	ENST00000489495	SNPH	O15079	494 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FUBP1-211	ENST00000489495	IGSF3	O75054	1194 aa		4.98	□□□□□ -1.61
FUBP1-211	ENST00000489495	TRIM52	Q96A61	297 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUBP1-211	ENST00000489495	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FUBP1-211	ENST00000489495	ANP32C	O43423	234 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	ZMYND10	O75800	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	MFSD10	Q14728	455 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	EEA1	Q15075	1411 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	PDE4A	P27815	886 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	EMP3	P54852	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	DPYSL4	O14531	572 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	NEFM	P07197	916 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	NACAD	O15069	1562 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	RAD21	O60216	631 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	CAMK2B	Q13554	666 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	SEC24B	O95487	1268 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	GOLGA2	Q08379	1002 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	DSG2	Q14126	1118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	ZNF428	Q96B54	188 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	GOLGA3	Q08378	1498 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FUBP1-211	ENST00000489495	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.62	2e-12	■■□□□ 12.1
FUBP1-211	ENST00000489495	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	CUX2	O14529	1486 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	RGS22	Q8NE09	1264 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	MTMR7	Q9Y216	660 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	CLIP1	P30622	1438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	POTEB3	A0JP26	581 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	GPR37	O15354	613 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	POTEB	Q6S5H4	581 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	MICALL2	Q8IY33	904 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	AK7	Q96M32	723 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	FAM205C	A6NFA0	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	ABCC8	Q09428	1581 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	SOGA1	O94964	1423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	NCAPD3	P42695	1498 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	FAM117A	Q9C073	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	C2orf72	A6NCS6	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	TRIM66	O15016	1216 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	FECH	P22830	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	FGD1	P98174	961 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	WDR97	A6NE52	1622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	TIE1	P35590	1138 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	PDIA6	Q15084	440 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FUBP1-211	ENST00000489495	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
FUBP1-211	ENST00000489495	PDE4D	Q08499	809 aa		4.84	□□□□□ -1.64
FUBP1-211	ENST00000489495	AAMP	Q13685	434 aa		4.84	□□□□□ -1.64
FUBP1-211	ENST00000489495	NFKBIB	Q15653	356 aa		4.84	□□□□□ -1.64

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