RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 ZBTB7CA1YPR0 619 aa11.06□□□□□ -0.64
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PTPRD-211ENST00000486161 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRD-211ENST00000486161 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa11.04□□□□□ -0.64
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PTPRD-211ENST00000486161 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa10.97□□□□□ -0.65
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PTPRD-211ENST00000486161 CFAP70Q5T0N1 1121 aa10.95□□□□□ -0.66
PTPRD-211ENST00000486161 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
PTPRD-211ENST00000486161 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
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PTPRD-211ENST00000486161 SOX12O15370 315 aa10.94□□□□□ -0.66
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PTPRD-211ENST00000486161 TMEM132EQ6IEE7 984 aa10.93□□□□□ -0.66
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PTPRD-211ENST00000486161 NBPF8Q3BBV2 869 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-211ENST00000486161 NEUROD2Q15784 382 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-211ENST00000486161 NBPF1Q3BBV0 1214 aa10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-211ENST00000486161 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
PTPRD-211ENST00000486161 CGNL1Q0VF96 1302 aa10.88□□□□□ -0.67
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PTPRD-211ENST00000486161 ADGRL2O95490 1459 aa10.87□□□□□ -0.67
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PTPRD-211ENST00000486161 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
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PTPRD-211ENST00000486161 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10.84□□□□□ -0.67
PTPRD-211ENST00000486161 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa10.83□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 ARHGEF5Q12774 1597 aa10.83□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 AMPHP49418 695 aa10.83□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 PSME1Q06323 249 aa10.83□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 CABP2Q9NPB3 220 aa10.82□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa10.82□□□□□ -0.68
PTPRD-211ENST00000486161 MBD5Q9P267 1494 aa10.82□□□□□ -0.68
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