RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.55■■■□□ 2.32
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SH3BP4-209ENST00000484097 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
SH3BP4-209ENST00000484097 HSPA2P54652 639 aa29.5■■■□□ 2.31
SH3BP4-209ENST00000484097 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.5■■■□□ 2.31
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SH3BP4-209ENST00000484097 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.47■■■□□ 2.31
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SH3BP4-209ENST00000484097 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
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SH3BP4-209ENST00000484097 NAIPQ13075 1403 aa29.02■■■□□ 2.24
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SH3BP4-209ENST00000484097 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.95■■■□□ 2.22
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SH3BP4-209ENST00000484097 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.73■■■□□ 2.19
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SH3BP4-209ENST00000484097 BCANQ96GW7 911 aa28.69■■■□□ 2.18
SH3BP4-209ENST00000484097 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
SH3BP4-209ENST00000484097 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.66■■■□□ 2.18
SH3BP4-209ENST00000484097 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.66■■■□□ 2.18
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