RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479310.5

WDR27-208, Transcript of WD repeat domain 27, humanhuman

TSL 5

Gene WDR27, Length 1,289 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR27-208ENST00000479310 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
WDR27-208ENST00000479310 NCOA1Q15788 1441 aa28.39■■■□□ 2.14
WDR27-208ENST00000479310 ADGRL2O95490 1459 aa28.39■■■□□ 2.13
WDR27-208ENST00000479310 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.38■■■□□ 2.13
WDR27-208ENST00000479310 MROH2AA6NES4 1674 aa28.38■■■□□ 2.13
WDR27-208ENST00000479310 PTPRKQ15262 1439 aa28.36■■■□□ 2.13
WDR27-208ENST00000479310 ITGAEP38570 1179 aa28.36■■■□□ 2.13
WDR27-208ENST00000479310 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
WDR27-208ENST00000479310 ERBINQ96RT1 1412 aa28.35■■■□□ 2.13
WDR27-208ENST00000479310 ZMYM3Q14202 1370 aa28.31■■■□□ 2.12
WDR27-208ENST00000479310 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.3■■■□□ 2.12
WDR27-208ENST00000479310 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.29■■■□□ 2.12
WDR27-208ENST00000479310 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.28■■■□□ 2.12
WDR27-208ENST00000479310 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.27■■■□□ 2.12
WDR27-208ENST00000479310 ROCK1Q13464 1354 aa28.26■■■□□ 2.12
WDR27-208ENST00000479310 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
WDR27-208ENST00000479310 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
WDR27-208ENST00000479310 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.24■■■□□ 2.11
WDR27-208ENST00000479310 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.23■■■□□ 2.11
WDR27-208ENST00000479310 DEPDC5O75140 1603 aa28.23■■■□□ 2.11
WDR27-208ENST00000479310 CEP152O94986 1710 aa28.22■■■□□ 2.11
WDR27-208ENST00000479310 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
WDR27-208ENST00000479310 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.21■■■□□ 2.11
WDR27-208ENST00000479310 ABCC3O15438 1527 aa28.21■■■□□ 2.11
WDR27-208ENST00000479310 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.2■■■□□ 2.15e-7■■■□□ 15.6
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WDR27-208ENST00000479310 KANK1Q14678 1352 aa28.16■■■□□ 2.1
WDR27-208ENST00000479310 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.16■■■□□ 2.1
WDR27-208ENST00000479310 PZPP20742 1482 aa28.15■■■□□ 2.1
WDR27-208ENST00000479310 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.14■■■□□ 2.1
WDR27-208ENST00000479310 HSPA2P54652 639 aa28.1■■■□□ 2.09
WDR27-208ENST00000479310 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
WDR27-208ENST00000479310 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
WDR27-208ENST00000479310 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.09■■■□□ 2.09
WDR27-208ENST00000479310 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.08■■■□□ 2.09
WDR27-208ENST00000479310 UNC13BO14795 1591 aa28.07■■■□□ 2.08
WDR27-208ENST00000479310 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.06■■■□□ 2.08
WDR27-208ENST00000479310 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.05■■■□□ 2.08
WDR27-208ENST00000479310 TNRQ92752 1358 aa28.04■■■□□ 2.08
WDR27-208ENST00000479310 NAIPQ13075 1403 aa28.03■■■□□ 2.08
WDR27-208ENST00000479310 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
WDR27-208ENST00000479310 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.01■■■□□ 2.08
WDR27-208ENST00000479310 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28■■■□□ 2.07
WDR27-208ENST00000479310 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
WDR27-208ENST00000479310 ERVK-7P63135 1459 aa28■■■□□ 2.07
WDR27-208ENST00000479310 HFM1A2PYH4 1435 aa28■■■□□ 2.07
WDR27-208ENST00000479310 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.98■■■□□ 2.07
WDR27-208ENST00000479310 TET3O43151 1660 aa27.97■■■□□ 2.07
WDR27-208ENST00000479310 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.96■■■□□ 2.07
WDR27-208ENST00000479310 NUP155O75694 1391 aa27.95■■■□□ 2.06
WDR27-208ENST00000479310 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.95■■■□□ 2.06
WDR27-208ENST00000479310 NLRP1Q9C000 1473 aa27.93■■■□□ 2.06
WDR27-208ENST00000479310 STRCQ7RTU9 1775 aa27.89■■■□□ 2.06
WDR27-208ENST00000479310 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
WDR27-208ENST00000479310 E9PCH4 1651 aa27.87■■■□□ 2.05
WDR27-208ENST00000479310 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.86■■■□□ 2.05
WDR27-208ENST00000479310 NOS1P29475 1434 aa27.84■■■□□ 2.05
WDR27-208ENST00000479310 SYNMO15061 1565 aa27.83■■■□□ 2.05
WDR27-208ENST00000479310 TRIM52Q96A61 297 aa27.83■■■□□ 2.05
WDR27-208ENST00000479310 PLA2R1Q13018 1463 aa27.82■■■□□ 2.04
WDR27-208ENST00000479310 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
WDR27-208ENST00000479310 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.79■■■□□ 2.04
WDR27-208ENST00000479310 PIK3C2BO00750 1634 aa27.78■■■□□ 2.04
WDR27-208ENST00000479310 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.77■■■□□ 2.04
WDR27-208ENST00000479310 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.77■■■□□ 2.04
WDR27-208ENST00000479310 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.76■■■□□ 2.03
WDR27-208ENST00000479310 IDI1Q13907 227 aa27.75■■■□□ 2.03
WDR27-208ENST00000479310 PKD2Q13563 968 aa27.74■■■□□ 2.03
WDR27-208ENST00000479310 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.74■■■□□ 2.03
WDR27-208ENST00000479310 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.74■■■□□ 2.03
WDR27-208ENST00000479310 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
WDR27-208ENST00000479310 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.71■■■□□ 2.03
WDR27-208ENST00000479310 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
WDR27-208ENST00000479310 PTPRTO14522 1441 aa27.7■■■□□ 2.03
WDR27-208ENST00000479310 FOXD1Q16676 465 aa27.7■■■□□ 2.02
WDR27-208ENST00000479310 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
WDR27-208ENST00000479310 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.69■■■□□ 2.02
WDR27-208ENST00000479310 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.68■■■□□ 2.02
WDR27-208ENST00000479310 ADGRB3O60242 1522 aa27.67■■■□□ 2.02
WDR27-208ENST00000479310 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
WDR27-208ENST00000479310 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.65■■■□□ 2.02
WDR27-208ENST00000479310 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.65■■■□□ 2.02
WDR27-208ENST00000479310 SLIT1O75093 1534 aa27.63■■■□□ 2.01
WDR27-208ENST00000479310 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.62■■■□□ 2.01
WDR27-208ENST00000479310 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.61■■■□□ 2.01
WDR27-208ENST00000479310 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.6■■■□□ 2.01
WDR27-208ENST00000479310 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
WDR27-208ENST00000479310 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.6■■■□□ 2.01
WDR27-208ENST00000479310 TRPM2O94759 1503 aa27.59■■■□□ 2.01
WDR27-208ENST00000479310 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
WDR27-208ENST00000479310 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.58■■■□□ 2.01
WDR27-208ENST00000479310 EID1Q9Y6B2 187 aa27.58■■■□□ 2.01
WDR27-208ENST00000479310 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2
WDR27-208ENST00000479310 MED14O60244 1454 aa27.57■■■□□ 2
WDR27-208ENST00000479310 IQGAP1P46940 1657 aa27.57■■■□□ 2
WDR27-208ENST00000479310 LTKP29376 864 aa27.56■■■□□ 2
WDR27-208ENST00000479310 CLTCL1P53675 1640 aa27.56■■■□□ 2
WDR27-208ENST00000479310 KIF1BO60333 1816 aa27.51■■□□□ 1.99
WDR27-208ENST00000479310 HRCP23327 699 aa27.51■■□□□ 1.99
WDR27-208ENST00000479310 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.49■■□□□ 1.99
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