RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478021.1

TRAF4-211, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 718 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-211ENST00000478021 KIF15Q9NS87 1388 aa35.1■■■■□ 3.21
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TRAF4-211ENST00000478021 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.09■■■■□ 3.21
TRAF4-211ENST00000478021 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.21
TRAF4-211ENST00000478021 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
TRAF4-211ENST00000478021 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.06■■■■□ 3.2
TRAF4-211ENST00000478021 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.06■■■■□ 3.2
TRAF4-211ENST00000478021 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.01■■■■□ 3.2
TRAF4-211ENST00000478021 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.01■■■■□ 3.2
TRAF4-211ENST00000478021 NPATQ14207 1427 aa35.01■■■■□ 3.2
TRAF4-211ENST00000478021 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35■■■■□ 3.19
TRAF4-211ENST00000478021 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.99■■■■□ 3.19
TRAF4-211ENST00000478021 PTPRKQ15262 1439 aa34.99■■■■□ 3.19
TRAF4-211ENST00000478021 ERBINQ96RT1 1412 aa34.98■■■■□ 3.19
TRAF4-211ENST00000478021 NCOA1Q15788 1441 aa34.96■■■■□ 3.19
TRAF4-211ENST00000478021 ADGRL2O95490 1459 aa34.96■■■■□ 3.19
TRAF4-211ENST00000478021 CEP152O94986 1710 aa34.94■■■■□ 3.18
TRAF4-211ENST00000478021 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
TRAF4-211ENST00000478021 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.92■■■■□ 3.18
TRAF4-211ENST00000478021 ABCC3O15438 1527 aa34.92■■■■□ 3.18
TRAF4-211ENST00000478021 PZPP20742 1482 aa34.9■■■■□ 3.18
TRAF4-211ENST00000478021 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
TRAF4-211ENST00000478021 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
TRAF4-211ENST00000478021 DEPDC5O75140 1603 aa34.86■■■■□ 3.17
TRAF4-211ENST00000478021 ITGAEP38570 1179 aa34.85■■■■□ 3.17
TRAF4-211ENST00000478021 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.84■■■■□ 3.17
TRAF4-211ENST00000478021 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
TRAF4-211ENST00000478021 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.84■■■■□ 3.17
TRAF4-211ENST00000478021 STRCQ7RTU9 1775 aa34.83■■■■□ 3.17
TRAF4-211ENST00000478021 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
TRAF4-211ENST00000478021 TNRQ92752 1358 aa34.8■■■■□ 3.16
TRAF4-211ENST00000478021 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.8■■■■□ 3.162e-7■□□□□ 10.2
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TRAF4-211ENST00000478021 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.77■■■■□ 3.16
TRAF4-211ENST00000478021 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
TRAF4-211ENST00000478021 KANK1Q14678 1352 aa34.74■■■■□ 3.15
TRAF4-211ENST00000478021 ROCK1Q13464 1354 aa34.73■■■■□ 3.15
TRAF4-211ENST00000478021 A2ML1A8K2U0 1454 aa34.72■■■■□ 3.15
TRAF4-211ENST00000478021 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.7■■■■□ 3.15
TRAF4-211ENST00000478021 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.7■■■■□ 3.15
TRAF4-211ENST00000478021 ERVK-7P63135 1459 aa34.7■■■■□ 3.15
TRAF4-211ENST00000478021 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.65■■■■□ 3.14
TRAF4-211ENST00000478021 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.64■■■■□ 3.14
TRAF4-211ENST00000478021 NLRP1Q9C000 1473 aa34.63■■■■□ 3.13
TRAF4-211ENST00000478021 UNC13BO14795 1591 aa34.62■■■■□ 3.13
TRAF4-211ENST00000478021 DMRT2Q9Y5R5 561 aa34.61■■■■□ 3.13
TRAF4-211ENST00000478021 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa34.6■■■■□ 3.13
TRAF4-211ENST00000478021 PLA2R1Q13018 1463 aa34.6■■■■□ 3.13
TRAF4-211ENST00000478021 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.57■■■■□ 3.13
TRAF4-211ENST00000478021 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.57■■■■□ 3.12
TRAF4-211ENST00000478021 PTPRTO14522 1441 aa34.56■■■■□ 3.12
TRAF4-211ENST00000478021 TET3O43151 1660 aa34.52■■■■□ 3.12
TRAF4-211ENST00000478021 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
TRAF4-211ENST00000478021 PKD2Q13563 968 aa34.49■■■■□ 3.11
TRAF4-211ENST00000478021 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.49■■■■□ 3.11
TRAF4-211ENST00000478021 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.47■■■■□ 3.11
TRAF4-211ENST00000478021 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
TRAF4-211ENST00000478021 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.47■■■■□ 3.11
TRAF4-211ENST00000478021 FBXO41Q8TF61 875 aa34.46■■■■□ 3.11
TRAF4-211ENST00000478021 SYNMO15061 1565 aa34.45■■■■□ 3.11
TRAF4-211ENST00000478021 PIK3C2BO00750 1634 aa34.44■■■■□ 3.1
TRAF4-211ENST00000478021 NUP155O75694 1391 aa34.43■■■■□ 3.1
TRAF4-211ENST00000478021 NAIPQ13075 1403 aa34.43■■■■□ 3.1
TRAF4-211ENST00000478021 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.43■■■■□ 3.1
TRAF4-211ENST00000478021 NOS1P29475 1434 aa34.41■■■■□ 3.1
TRAF4-211ENST00000478021 E9PCH4 1651 aa34.41■■■■□ 3.1
TRAF4-211ENST00000478021 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
TRAF4-211ENST00000478021 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.37■■■■□ 3.09
TRAF4-211ENST00000478021 IDI1Q13907 227 aa34.35■■■■□ 3.09
TRAF4-211ENST00000478021 HFM1A2PYH4 1435 aa34.35■■■■□ 3.09
TRAF4-211ENST00000478021 CERKQ8TCT0 537 aa34.34■■■■□ 3.09
TRAF4-211ENST00000478021 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.32■■■■□ 3.08
TRAF4-211ENST00000478021 LTBP4Q8N2S1 1624 aa34.3■■■■□ 3.08
TRAF4-211ENST00000478021 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
TRAF4-211ENST00000478021 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
TRAF4-211ENST00000478021 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
TRAF4-211ENST00000478021 ADGRB3O60242 1522 aa34.27■■■■□ 3.08
TRAF4-211ENST00000478021 SLIT1O75093 1534 aa34.27■■■■□ 3.08
TRAF4-211ENST00000478021 IQGAP1P46940 1657 aa34.27■■■■□ 3.08
TRAF4-211ENST00000478021 MED14O60244 1454 aa34.27■■■■□ 3.08
TRAF4-211ENST00000478021 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.27■■■■□ 3.08
TRAF4-211ENST00000478021 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.24■■■■□ 3.07
TRAF4-211ENST00000478021 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
TRAF4-211ENST00000478021 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.23■■■■□ 3.07
TRAF4-211ENST00000478021 LTKP29376 864 aa34.21■■■■□ 3.07
TRAF4-211ENST00000478021 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.21■■■■□ 3.07
TRAF4-211ENST00000478021 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.2■■■■□ 3.07
TRAF4-211ENST00000478021 TRIM52Q96A61 297 aa34.2■■■■□ 3.07
TRAF4-211ENST00000478021 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.18■■■■□ 3.06
TRAF4-211ENST00000478021 EID1Q9Y6B2 187 aa34.16■■■■□ 3.06
TRAF4-211ENST00000478021 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.15■■■■□ 3.06
TRAF4-211ENST00000478021 CHGAP10645 457 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
TRAF4-211ENST00000478021 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.04■■■■□ 3.04
TRAF4-211ENST00000478021 IQSEC2Q5JU85 1478 aa34.04■■■■□ 3.04
TRAF4-211ENST00000478021 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
TRAF4-211ENST00000478021 RIMS2Q9UQ26 1411 aa34.04■■■■□ 3.04
TRAF4-211ENST00000478021 ZFYVE9O95405 1425 aa34.03■■■■□ 3.04
TRAF4-211ENST00000478021 CPS1P31327 1500 aa34.02■■■■□ 3.04
TRAF4-211ENST00000478021 CLTCL1P53675 1640 aa34.01■■■■□ 3.04
TRAF4-211ENST00000478021 TRPM2O94759 1503 aa34.01■■■■□ 3.04
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