RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477464.1

SAR1A-208, Transcript of secretion associated Ras related GTPase 1A, humanhuman

TSL 2

Gene SAR1A, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1A-208ENST00000477464 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.85□□□□□ -0.99
SAR1A-208ENST00000477464 MAP3K9P80192 1104 aa8.84□□□□□ -0.99
SAR1A-208ENST00000477464 SNPHO15079 494 aa8.83□□□□□ -1
SAR1A-208ENST00000477464 GNPATO15228 680 aa8.83□□□□□ -1
SAR1A-208ENST00000477464 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
SAR1A-208ENST00000477464 FCHSD2O94868 740 aa8.81□□□□□ -1
SAR1A-208ENST00000477464 FOXK1P85037 733 aa8.81□□□□□ -1
SAR1A-208ENST00000477464 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
SAR1A-208ENST00000477464 POTEB3A0JP26 581 aa8.8□□□□□ -1
SAR1A-208ENST00000477464 HIC1Q14526 733 aa8.8□□□□□ -1
SAR1A-208ENST00000477464 POTEBQ6S5H4 581 aa8.8□□□□□ -1
SAR1A-208ENST00000477464 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.8□□□□□ -1
SAR1A-208ENST00000477464 GOPCQ9HD26 462 aa8.8□□□□□ -1
SAR1A-208ENST00000477464 PLPP6Q8IY26 295 aa8.79□□□□□ -1
SAR1A-208ENST00000477464 CLUAP1Q96AJ1 413 aa8.79□□□□□ -1
SAR1A-208ENST00000477464 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
SAR1A-208ENST00000477464 A6NJR5 290 aa8.77□□□□□ -1.01
SAR1A-208ENST00000477464 TRAK2O60296 914 aa8.77□□□□□ -1.01
SAR1A-208ENST00000477464 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SAR1A-208ENST00000477464 FECHP22830 423 aa8.75□□□□□ -1.01
SAR1A-208ENST00000477464 DDX12PQ92771 950 aa8.75□□□□□ -1.01
SAR1A-208ENST00000477464 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
SAR1A-208ENST00000477464 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.75□□□□□ -1.01
SAR1A-208ENST00000477464 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.75□□□□□ -1.01
SAR1A-208ENST00000477464 OSBPP22059 807 aa8.74□□□□□ -1.01
SAR1A-208ENST00000477464 C2orf72A6NCS6 295 aa8.73□□□□□ -1.01
SAR1A-208ENST00000477464 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
SAR1A-208ENST00000477464 EMP3P54852 163 aa8.73□□□□□ -1.01
SAR1A-208ENST00000477464 RAD21O60216 631 aa8.72□□□□□ -1.01
SAR1A-208ENST00000477464 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.72□□□□□ -1.01
SAR1A-208ENST00000477464 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.72□□□□□ -1.01
SAR1A-208ENST00000477464 FAM205CA6NFA0 338 aa8.71□□□□□ -1.02
SAR1A-208ENST00000477464 TBC1D12O60347 775 aa8.71□□□□□ -1.02
SAR1A-208ENST00000477464 MS4A1P11836 297 aa8.71□□□□□ -1.02
SAR1A-208ENST00000477464 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SAR1A-208ENST00000477464 KIF3CO14782 793 aa8.7□□□□□ -1.02
SAR1A-208ENST00000477464 MCM6Q14566 821 aa8.7□□□□□ -1.02
SAR1A-208ENST00000477464 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.69□□□□□ -1.02
SAR1A-208ENST00000477464 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SAR1A-208ENST00000477464 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SAR1A-208ENST00000477464 CLCN1P35523 988 aa8.68□□□□□ -1.02
SAR1A-208ENST00000477464 PTGER2P43116 358 aa8.67□□□□□ -1.02
SAR1A-208ENST00000477464 PTGDRQ13258 359 aa8.67□□□□□ -1.02
SAR1A-208ENST00000477464 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.66□□□□□ -1.02
SAR1A-208ENST00000477464 RIMBP2O15034 1052 aa8.64□□□□□ -1.03
SAR1A-208ENST00000477464 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SAR1A-208ENST00000477464 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SAR1A-208ENST00000477464 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SAR1A-208ENST00000477464 DOK7Q18PE1 504 aa8.64□□□□□ -1.03
SAR1A-208ENST00000477464 NECTIN2Q92692 538 aa8.64□□□□□ -1.03
SAR1A-208ENST00000477464 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SAR1A-208ENST00000477464 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.64□□□□□ -1.03
SAR1A-208ENST00000477464 EVI5O60447 810 aa8.63□□□□□ -1.03
SAR1A-208ENST00000477464 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.63□□□□□ -1.03
SAR1A-208ENST00000477464 OXER1Q8TDS5 423 aa8.62□□□□□ -1.03
SAR1A-208ENST00000477464 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SAR1A-208ENST00000477464 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.61□□□□□ -1.03
SAR1A-208ENST00000477464 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.61□□□□□ -1.03
SAR1A-208ENST00000477464 POM121Q96HA1 1249 aa8.61□□□□□ -1.03
SAR1A-208ENST00000477464 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.61□□□□□ -1.03
SAR1A-208ENST00000477464 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SAR1A-208ENST00000477464 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.6□□□□□ -1.03
SAR1A-208ENST00000477464 MAP3K7O43318 606 aa8.59□□□□□ -1.03
SAR1A-208ENST00000477464 SLC34A2O95436 690 aa8.58□□□□□ -1.04
SAR1A-208ENST00000477464 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SAR1A-208ENST00000477464 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.58□□□□□ -1.04
SAR1A-208ENST00000477464 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.58□□□□□ -1.04
SAR1A-208ENST00000477464 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.57□□□□□ -1.04
SAR1A-208ENST00000477464 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.56□□□□□ -1.04
SAR1A-208ENST00000477464 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SAR1A-208ENST00000477464 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SAR1A-208ENST00000477464 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SAR1A-208ENST00000477464 WWC1Q8IX03 1113 aa8.55□□□□□ -1.04
SAR1A-208ENST00000477464 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SAR1A-208ENST00000477464 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SAR1A-208ENST00000477464 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.55□□□□□ -1.04
SAR1A-208ENST00000477464 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SAR1A-208ENST00000477464 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SAR1A-208ENST00000477464 EPAS1Q99814 870 aa8.54□□□□□ -1.04
SAR1A-208ENST00000477464 COG6Q9Y2V7 657 aa8.54□□□□□ -1.04
SAR1A-208ENST00000477464 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.54□□□□□ -1.04
SAR1A-208ENST00000477464 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SAR1A-208ENST00000477464 PHF14O94880 888 aa8.51□□□□□ -1.05
SAR1A-208ENST00000477464 OATP04181 439 aa8.51□□□□□ -1.05
SAR1A-208ENST00000477464 ARSIQ5FYB1 569 aa8.51□□□□□ -1.05
SAR1A-208ENST00000477464 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.51□□□□□ -1.05
SAR1A-208ENST00000477464 RETREG2Q8NC44 543 aa8.51□□□□□ -1.05
SAR1A-208ENST00000477464 BANK1Q8NDB2 785 aa8.51□□□□□ -1.05
SAR1A-208ENST00000477464 PHOX2BQ99453 314 aa8.51□□□□□ -1.05
SAR1A-208ENST00000477464 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SAR1A-208ENST00000477464 ERBB3P21860 1342 aa8.51□□□□□ -1.05
SAR1A-208ENST00000477464 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.5□□□□□ -1.05
SAR1A-208ENST00000477464 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.5□□□□□ -1.05
SAR1A-208ENST00000477464 NLRP7Q8WX94 980 aa8.5□□□□□ -1.05
SAR1A-208ENST00000477464 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
SAR1A-208ENST00000477464 RFC5P40937 340 aa8.49□□□□□ -1.05
SAR1A-208ENST00000477464 FAM161AQ3B820 660 aa8.49□□□□□ -1.05
SAR1A-208ENST00000477464 PRM3Q9NNZ6 103 aa8.49□□□□□ -1.05
SAR1A-208ENST00000477464 SNRKQ9NRH2 765 aa8.49□□□□□ -1.05
SAR1A-208ENST00000477464 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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