RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473970.2

RPARP-AS1-201, RPARP antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPARP-AS1, Length 1,297 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPARP-AS1-201ENST00000473970 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.5■■□□□ 1.35
RPARP-AS1-201ENST00000473970 FBXO41Q8TF61 875 aa23.5■■□□□ 1.35
RPARP-AS1-201ENST00000473970 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
RPARP-AS1-201ENST00000473970 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
RPARP-AS1-201ENST00000473970 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.48■■□□□ 1.35
RPARP-AS1-201ENST00000473970 PTPRTO14522 1441 aa23.48■■□□□ 1.35
RPARP-AS1-201ENST00000473970 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.48■■□□□ 1.35
RPARP-AS1-201ENST00000473970 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.48■■□□□ 1.35
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.47■■□□□ 1.35
RPARP-AS1-201ENST00000473970 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
RPARP-AS1-201ENST00000473970 NCOA1Q15788 1441 aa23.46■■□□□ 1.35
RPARP-AS1-201ENST00000473970 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.44■■□□□ 1.34
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
RPARP-AS1-201ENST00000473970 PZPP20742 1482 aa23.43■■□□□ 1.34
RPARP-AS1-201ENST00000473970 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.43■■□□□ 1.34
RPARP-AS1-201ENST00000473970 PLA2R1Q13018 1463 aa23.43■■□□□ 1.34
RPARP-AS1-201ENST00000473970 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.42■■□□□ 1.34
RPARP-AS1-201ENST00000473970 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.41■■□□□ 1.34
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ABCC5O15440 1437 aa23.41■■□□□ 1.34
RPARP-AS1-201ENST00000473970 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.38■■□□□ 1.33
RPARP-AS1-201ENST00000473970 DAPK1P53355 1430 aa23.37■■□□□ 1.33
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CERKQ8TCT0 537 aa23.37■■□□□ 1.33
RPARP-AS1-201ENST00000473970 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.37■■□□□ 1.33
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ERBINQ96RT1 1412 aa23.36■■□□□ 1.33
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ABCC3O15438 1527 aa23.35■■□□□ 1.33
RPARP-AS1-201ENST00000473970 PKD2Q13563 968 aa23.35■■□□□ 1.33
RPARP-AS1-201ENST00000473970 TNRQ92752 1358 aa23.35■■□□□ 1.33
RPARP-AS1-201ENST00000473970 KIF15Q9NS87 1388 aa23.35■■□□□ 1.33
RPARP-AS1-201ENST00000473970 NLRP1Q9C000 1473 aa23.31■■□□□ 1.32
RPARP-AS1-201ENST00000473970 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
RPARP-AS1-201ENST00000473970 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
RPARP-AS1-201ENST00000473970 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.3■■□□□ 1.32
RPARP-AS1-201ENST00000473970 DEPDC5O75140 1603 aa23.3■■□□□ 1.32
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.29■■□□□ 1.32
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CEP152O94986 1710 aa23.28■■□□□ 1.32
RPARP-AS1-201ENST00000473970 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.27■■□□□ 1.32
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ADGRL2O95490 1459 aa23.27■■□□□ 1.32
RPARP-AS1-201ENST00000473970 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.26■■□□□ 1.31
RPARP-AS1-201ENST00000473970 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.25■■□□□ 1.31
RPARP-AS1-201ENST00000473970 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.25■■□□□ 1.31
RPARP-AS1-201ENST00000473970 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.25■■□□□ 1.31
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ERVK-7P63135 1459 aa23.24■■□□□ 1.31
RPARP-AS1-201ENST00000473970 MSH5O43196 834 aa23.22■■□□□ 1.31
RPARP-AS1-201ENST00000473970 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
RPARP-AS1-201ENST00000473970 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.22■■□□□ 1.31
RPARP-AS1-201ENST00000473970 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.19■■□□□ 1.3
RPARP-AS1-201ENST00000473970 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.19■■□□□ 1.3
RPARP-AS1-201ENST00000473970 KANK1Q14678 1352 aa23.19■■□□□ 1.3
RPARP-AS1-201ENST00000473970 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.18■■□□□ 1.3
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.17■■□□□ 1.3
RPARP-AS1-201ENST00000473970 MED14O60244 1454 aa23.16■■□□□ 1.3
RPARP-AS1-201ENST00000473970 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.15■■□□□ 1.3
RPARP-AS1-201ENST00000473970 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.297e-6■■■□□ 16.5
RPARP-AS1-201ENST00000473970 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.13■■□□□ 1.29
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.11■■□□□ 1.29
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
RPARP-AS1-201ENST00000473970 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ROCK1Q13464 1354 aa23.1■■□□□ 1.29
RPARP-AS1-201ENST00000473970 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
RPARP-AS1-201ENST00000473970 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.08■■□□□ 1.28
RPARP-AS1-201ENST00000473970 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
RPARP-AS1-201ENST00000473970 IQGAP1P46940 1657 aa23.06■■□□□ 1.28
RPARP-AS1-201ENST00000473970 SLIT1O75093 1534 aa23.06■■□□□ 1.28
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CPS1P31327 1500 aa23.06■■□□□ 1.28
RPARP-AS1-201ENST00000473970 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.05■■□□□ 1.28
RPARP-AS1-201ENST00000473970 UNC13BO14795 1591 aa23.04■■□□□ 1.28
RPARP-AS1-201ENST00000473970 NOS1P29475 1434 aa23.03■■□□□ 1.28
RPARP-AS1-201ENST00000473970 TET3O43151 1660 aa23.03■■□□□ 1.28
RPARP-AS1-201ENST00000473970 PIK3C2BO00750 1634 aa23.02■■□□□ 1.28
RPARP-AS1-201ENST00000473970 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.01■■□□□ 1.27
RPARP-AS1-201ENST00000473970 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
RPARP-AS1-201ENST00000473970 SYNMO15061 1565 aa23■■□□□ 1.27
RPARP-AS1-201ENST00000473970 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.97■■□□□ 1.27
RPARP-AS1-201ENST00000473970 IDI1Q13907 227 aa22.95■■□□□ 1.26
RPARP-AS1-201ENST00000473970 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.95■■□□□ 1.26
RPARP-AS1-201ENST00000473970 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.94■■□□□ 1.26
RPARP-AS1-201ENST00000473970 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
RPARP-AS1-201ENST00000473970 EID1Q9Y6B2 187 aa22.94■■□□□ 1.26
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ADGRB3O60242 1522 aa22.92■■□□□ 1.26
RPARP-AS1-201ENST00000473970 LTKP29376 864 aa22.92■■□□□ 1.26
RPARP-AS1-201ENST00000473970 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.92■■□□□ 1.26
RPARP-AS1-201ENST00000473970 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.91■■□□□ 1.26
RPARP-AS1-201ENST00000473970 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.91■■□□□ 1.26
RPARP-AS1-201ENST00000473970 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.9■■□□□ 1.26
RPARP-AS1-201ENST00000473970 E9PCH4 1651 aa22.89■■□□□ 1.25
RPARP-AS1-201ENST00000473970 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
RPARP-AS1-201ENST00000473970 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.85■■□□□ 1.25
RPARP-AS1-201ENST00000473970 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.84■■□□□ 1.25
RPARP-AS1-201ENST00000473970 TOM1O60784 492 aa22.84■■□□□ 1.25
RPARP-AS1-201ENST00000473970 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.83■■□□□ 1.25
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ITGAEP38570 1179 aa22.83■■□□□ 1.25
RPARP-AS1-201ENST00000473970 NUP155O75694 1391 aa22.83■■□□□ 1.25
RPARP-AS1-201ENST00000473970 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ZFYVE9O95405 1425 aa22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms