RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471650.5

SH3BP1-207, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 900 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-207ENST00000471650 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.89■□□□□ 0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 DEPDC5O75140 1603 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 MED14O60244 1454 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 ATP7AQ04656 1500 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 A2MP01023 1474 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SH3BP1-207ENST00000471650 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 GGT6Q6P531 493 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 TNRQ92752 1358 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 MAP3K1Q13233 1512 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 APLP2Q06481 763 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 TIAM1Q13009 1591 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 UGGT1Q9NYU2 1555 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
SH3BP1-207ENST00000471650 PZPP20742 1482 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM135BQ49AJ0 1406 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 LRP6O75581 1613 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM135AQ9P2D6 1515 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 NLRP1Q9C000 1473 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 TRIM52Q96A61 297 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 KDM5DQ9BY66 1539 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 MIA2Q96PC5 1412 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 PHLPP1O60346 1717 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1-207ENST00000471650 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-207ENST00000471650 UBR1Q8IWV7 1749 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1-207ENST00000471650 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-207ENST00000471650 NCOA2Q15596 1464 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-207ENST00000471650 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1-207ENST00000471650 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1-207ENST00000471650 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-207ENST00000471650 TMEM94Q12767 1356 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP1-207ENST00000471650 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-207ENST00000471650 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-207ENST00000471650 JCADQ9P266 1359 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP1-207ENST00000471650 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 LTKP29376 864 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 ARHGAP23Q9P227 1491 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 MBD5Q9P267 1494 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 KIF3BO15066 747 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 SLIT1O75093 1534 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 ERVK-7P63135 1459 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 RGS12O14924 1447 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 SHPRHQ149N8 1683 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 ABCC3O15438 1527 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 RXRBP28702 533 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 NWD1Q149M9 1564 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 MROH1Q8NDA8 1641 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 CEP152O94986 1710 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 TXNDC2Q86VQ3 553 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 DIP2AQ14689 1571 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP1-207ENST00000471650 TET3O43151 1660 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-207ENST00000471650 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-207ENST00000471650 SLAIN2Q9P270 581 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-207ENST00000471650 PIK3C2BO00750 1634 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-207ENST00000471650 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-207ENST00000471650 EP400Q96L91 3159 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-207ENST00000471650 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-207ENST00000471650 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-207ENST00000471650 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1-207ENST00000471650 AFF2P51816 1311 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1-207ENST00000471650 PTPN23Q9H3S7 1636 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1-207ENST00000471650 KCNA6P17658 529 aa16.4■□□□□ 0.22
SH3BP1-207ENST00000471650 MAST1Q9Y2H9 1570 aa16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1-207ENST00000471650 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SH3BP1-207ENST00000471650 MSH6P52701 1360 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-207ENST00000471650 SLC26A8Q96RN1 970 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1-207ENST00000471650 RSPH4AQ5TD94 716 aa16.37■□□□□ 0.21
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