RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA0556O60303 1618 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 CRBNQ96SW2 442 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 KIF14Q15058 1648 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 JPH4Q96JJ6 628 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 RALBP1Q15311 655 aa17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 DCAF11Q8TEB1 546 aa17.87■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 C20orf194Q5TEA3 1177 aa17.86■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 NFKBIBQ15653 356 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 NLRP13Q86W25 1043 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 RALGAPBQ86X10 1494 aa17.85■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 GSE1Q14687 1217 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 CHD1O14646 1710 aa17.83■□□□□ 0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 NUP155O75694 1391 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 DDRGK1Q96HY6 314 aa17.82■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 PDE3BQ13370 1112 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 PLB1Q6P1J6 1458 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 PARD3Q8TEW0 1356 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 E9PCH4 1651 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 NBPF1Q3BBV0 1214 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RGL3Q3MIN7 710 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 RGS3P49796 1198 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 KDM2BQ8NHM5 1336 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 ADGBQ8N7X0 1667 aa17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1-206ENST00000469947 C8orf34Q49A92 452 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 PANK3Q9H999 370 aa17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 ADGRL2O95490 1459 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 ADAMTS8Q9UP79 889 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 DISP3Q9P2K9 1392 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 INSRP06213 1382 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM161AQ3B820 660 aa17.68■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 ERCC6L2Q5T890 1561 aa17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 PTPRGP23470 1445 aa17.65■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 C9orf84Q5VXU9 1444 aa17.64■□□□□ 0.42
SH3BP1-206ENST00000469947 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 CROCC2H7BZ55 1655 aa17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ABCA8O94911 1581 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 DUSP27Q5VZP5 1158 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 SHROOM2Q13796 1616 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ITSN2Q9NZM3 1697 aa17.62■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 PRAG1Q86YV5 1406 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 TSPY4P0CV99 314 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 TSPY10P0CW01 314 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 TESK2Q96S53 571 aa17.61■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 ATP10BO94823 1461 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 KDM5DQ9BY66 1539 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.59■□□□□ 0.413e-7■■■■□ 23.3
SH3BP1-206ENST00000469947 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC146Q8IYE0 955 aa17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1-206ENST00000469947 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 POGKQ9P215 609 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC144AA2RUR9 1427 aa17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 GOLGA2Q08379 1002 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 ARXQ96QS3 562 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM43AQ8N2R8 423 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 ERBINQ96RT1 1412 aa17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 PLEKHD1A6NEE1 506 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 BCAR3O75815 825 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 PPP2R1AP30153 589 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 TMF1P82094 1093 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 SEC24BO95487 1268 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 IGHDP01880 384 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 RSPH6AQ9H0K4 717 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-206ENST00000469947 A2MP01023 1474 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM135AQ9P2D6 1515 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 KNSTRNQ9Y448 316 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF521Q96K83 1311 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP1-206ENST00000469947 USP19O94966 1318 aa17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms