RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 USP47Q96K76 1375 aa23.93■■□□□ 1.42
FAAP20-211ENST00000469733 AFAP1Q8N556 730 aa23.93■■□□□ 1.42
FAAP20-211ENST00000469733 KDM5CP41229 1560 aa23.92■■□□□ 1.42
FAAP20-211ENST00000469733 PLA2R1Q13018 1463 aa23.92■■□□□ 1.42
FAAP20-211ENST00000469733 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.91■■□□□ 1.42
FAAP20-211ENST00000469733 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
FAAP20-211ENST00000469733 ADGRL1O94910 1474 aa23.9■■□□□ 1.42
FAAP20-211ENST00000469733 ATP7AQ04656 1500 aa23.89■■□□□ 1.42
FAAP20-211ENST00000469733 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.89■■□□□ 1.42
FAAP20-211ENST00000469733 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.89■■□□□ 1.42
FAAP20-211ENST00000469733 ATP10AO60312 1499 aa23.88■■□□□ 1.41
FAAP20-211ENST00000469733 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.87■■□□□ 1.41
FAAP20-211ENST00000469733 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.87■■□□□ 1.41
FAAP20-211ENST00000469733 DEPDC5O75140 1603 aa23.84■■□□□ 1.41
FAAP20-211ENST00000469733 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.84■■□□□ 1.41
FAAP20-211ENST00000469733 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.84■■□□□ 1.41
FAAP20-211ENST00000469733 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.8■■□□□ 1.4
FAAP20-211ENST00000469733 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
FAAP20-211ENST00000469733 A2MP01023 1474 aa23.8■■□□□ 1.4
FAAP20-211ENST00000469733 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.79■■□□□ 1.4
FAAP20-211ENST00000469733 E9PCH4 1651 aa23.79■■□□□ 1.4
FAAP20-211ENST00000469733 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.79■■□□□ 1.4
FAAP20-211ENST00000469733 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
FAAP20-211ENST00000469733 RGL3Q3MIN7 710 aa23.78■■□□□ 1.4
FAAP20-211ENST00000469733 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
FAAP20-211ENST00000469733 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.77■■□□□ 1.4
FAAP20-211ENST00000469733 CD109Q6YHK3 1445 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-211ENST00000469733 TET3O43151 1660 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-211ENST00000469733 KANK1Q14678 1352 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-211ENST00000469733 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
FAAP20-211ENST00000469733 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
FAAP20-211ENST00000469733 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.74■■□□□ 1.39
FAAP20-211ENST00000469733 TRPM2O94759 1503 aa23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-211ENST00000469733 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-211ENST00000469733 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.72■■□□□ 1.39
FAAP20-211ENST00000469733 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
FAAP20-211ENST00000469733 LAMC1P11047 1609 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-211ENST00000469733 KIF3BO15066 747 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-211ENST00000469733 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-211ENST00000469733 PTPRTO14522 1441 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-211ENST00000469733 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-211ENST00000469733 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-211ENST00000469733 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-211ENST00000469733 CEP152O94986 1710 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-211ENST00000469733 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-211ENST00000469733 CLTCL1P53675 1640 aa23.64■■□□□ 1.38
FAAP20-211ENST00000469733 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.63■■□□□ 1.37
FAAP20-211ENST00000469733 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.62■■□□□ 1.37
FAAP20-211ENST00000469733 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.62■■□□□ 1.37
FAAP20-211ENST00000469733 NEO1Q92859 1461 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-211ENST00000469733 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC184Q52MB2 194 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-211ENST00000469733 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-211ENST00000469733 MRS2Q9HD23 443 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-211ENST00000469733 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-211ENST00000469733 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-211ENST00000469733 MADDQ8WXG6 1647 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-211ENST00000469733 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.57■■□□□ 1.36
FAAP20-211ENST00000469733 STAC3Q96MF2 364 aa23.57■■□□□ 1.36
FAAP20-211ENST00000469733 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.56■■□□□ 1.36
FAAP20-211ENST00000469733 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
FAAP20-211ENST00000469733 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.55■■□□□ 1.36
FAAP20-211ENST00000469733 ABCA6Q8N139 1617 aa23.53■■□□□ 1.36
FAAP20-211ENST00000469733 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.52■■□□□ 1.36
FAAP20-211ENST00000469733 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.35
FAAP20-211ENST00000469733 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-211ENST00000469733 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-211ENST00000469733 KIF1BO60333 1816 aa23.49■■□□□ 1.35
FAAP20-211ENST00000469733 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-211ENST00000469733 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-211ENST00000469733 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-211ENST00000469733 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-211ENST00000469733 TESK2Q96S53 571 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-211ENST00000469733 IQGAP1P46940 1657 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-211ENST00000469733 GLI2P10070 1586 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-211ENST00000469733 RAPGEF3O95398 923 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-211ENST00000469733 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-211ENST00000469733 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-211ENST00000469733 RICTORQ6R327 1708 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-211ENST00000469733 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-211ENST00000469733 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-211ENST00000469733 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-211ENST00000469733 TMF1P82094 1093 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-211ENST00000469733 MYOM2P54296 1465 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-211ENST00000469733 GGT6Q6P531 493 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-211ENST00000469733 NEFLP07196 543 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-211ENST00000469733 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-211ENST00000469733 IFT172Q9UG01 1749 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-211ENST00000469733 ABCC3O15438 1527 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-211ENST00000469733 MROH2AA6NES4 1674 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-211ENST00000469733 NPATQ14207 1427 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-211ENST00000469733 RALBP1Q15311 655 aa23.4■■□□□ 1.34
FAAP20-211ENST00000469733 FKBP8Q14318 412 aa23.39■■□□□ 1.34
FAAP20-211ENST00000469733 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-211ENST00000469733 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-211ENST00000469733 ADGRB3O60242 1522 aa23.38■■□□□ 1.33
FAAP20-211ENST00000469733 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.37■■□□□ 1.33
FAAP20-211ENST00000469733 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
FAAP20-211ENST00000469733 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms