RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469140.2

MTA1-209, Transcript of metastasis associated 1, human

TSL 5

Gene MTA1, Length 1,666 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTA1-209	ENST00000469140	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	34.52	■■■■□ 3.12
MTA1-209	ENST00000469140	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		34.5	■■■■□ 3.11
MTA1-209	ENST00000469140	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		34.48	■■■■□ 3.11
MTA1-209	ENST00000469140	KIF3B	O15066	747 aa		34.45	■■■■□ 3.11
MTA1-209	ENST00000469140	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	34.44	■■■■□ 3.1	5e-6	■□□□□ 9.7
MTA1-209	ENST00000469140	DEPDC5	O75140	1603 aa		34.43	■■■■□ 3.1
MTA1-209	ENST00000469140	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		34.42	■■■■□ 3.1
MTA1-209	ENST00000469140	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		34.41	■■■■□ 3.1
MTA1-209	ENST00000469140	ATP10A	O60312	1499 aa		34.4	■■■■□ 3.1
MTA1-209	ENST00000469140	PKD2	Q13563	968 aa		34.38	■■■■□ 3.09
MTA1-209	ENST00000469140	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		34.38	■■■■□ 3.09
MTA1-209	ENST00000469140	KANK1	Q14678	1352 aa		34.36	■■■■□ 3.09
MTA1-209	ENST00000469140	RERE	Q9P2R6	1566 aa		34.34	■■■■□ 3.09
MTA1-209	ENST00000469140	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	34.34	■■■■□ 3.09
MTA1-209	ENST00000469140	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	34.34	■■■■□ 3.09
MTA1-209	ENST00000469140	FOXD1	Q16676	465 aa		34.33	■■■■□ 3.09
MTA1-209	ENST00000469140	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		34.32	■■■■□ 3.09
MTA1-209	ENST00000469140	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		34.32	■■■■□ 3.08
MTA1-209	ENST00000469140	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		34.31	■■■■□ 3.08
MTA1-209	ENST00000469140	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		34.31	■■■■□ 3.08
MTA1-209	ENST00000469140	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		34.31	■■■■□ 3.08
MTA1-209	ENST00000469140	NEUROD1	Q13562	356 aa		34.27	■■■■□ 3.08
MTA1-209	ENST00000469140	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		34.26	■■■■□ 3.08
MTA1-209	ENST00000469140	AGL	P35573	1532 aa		34.25	■■■■□ 3.07
MTA1-209	ENST00000469140	GGT6	Q6P531	493 aa		34.23	■■■■□ 3.07
MTA1-209	ENST00000469140	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		34.19	■■■■□ 3.06
MTA1-209	ENST00000469140	TET3	O43151	1660 aa		34.19	■■■■□ 3.06
MTA1-209	ENST00000469140	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	34.14	■■■■□ 3.06
MTA1-209	ENST00000469140	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		34.13	■■■■□ 3.05
MTA1-209	ENST00000469140	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		34.12	■■■■□ 3.05
MTA1-209	ENST00000469140	TONSL	Q96HA7	1378 aa		34.11	■■■■□ 3.05
MTA1-209	ENST00000469140		E9PCH4	1651 aa		34.1	■■■■□ 3.05
MTA1-209	ENST00000469140	ABCC3	O15438	1527 aa		34.09	■■■■□ 3.05
MTA1-209	ENST00000469140	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		34.09	■■■■□ 3.05
MTA1-209	ENST00000469140	CEP152	O94986	1710 aa		34.07	■■■■□ 3.04
MTA1-209	ENST00000469140	PLA2R1	Q13018	1463 aa		34.06	■■■■□ 3.04
MTA1-209	ENST00000469140	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		34.06	■■■■□ 3.04
MTA1-209	ENST00000469140	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	34.06	■■■■□ 3.04
MTA1-209	ENST00000469140	PTPRT	O14522	1441 aa		34.03	■■■■□ 3.04
MTA1-209	ENST00000469140	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		34.02	■■■■□ 3.04
MTA1-209	ENST00000469140	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.98	■■■■□ 3.03
MTA1-209	ENST00000469140	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.98	■■■■□ 3.03
MTA1-209	ENST00000469140	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	33.97	■■■■□ 3.03
MTA1-209	ENST00000469140	TRPM2	O94759	1503 aa		33.97	■■■■□ 3.03
MTA1-209	ENST00000469140	NPAT	Q14207	1427 aa		33.96	■■■■□ 3.03
MTA1-209	ENST00000469140	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	33.96	■■■■□ 3.03
MTA1-209	ENST00000469140	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		33.95	■■■■□ 3.03
MTA1-209	ENST00000469140	MLEC	Q14165	292 aa		33.93	■■■■□ 3.02
MTA1-209	ENST00000469140	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		33.92	■■■■□ 3.02
MTA1-209	ENST00000469140	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.86	■■■■□ 3.01
MTA1-209	ENST00000469140	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.86	■■■■□ 3.01
MTA1-209	ENST00000469140	NOS1	P29475	1434 aa		33.84	■■■■□ 3.01
MTA1-209	ENST00000469140	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.83	■■■■□ 3.01
MTA1-209	ENST00000469140	CLTCL1	P53675	1640 aa		33.8	■■■■□ 3
MTA1-209	ENST00000469140	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		33.75	■■■□□ 2.99
MTA1-209	ENST00000469140	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		33.74	■■■□□ 2.99
MTA1-209	ENST00000469140	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.73	■■■□□ 2.99
MTA1-209	ENST00000469140	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
MTA1-209	ENST00000469140	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.72	■■■□□ 2.99
MTA1-209	ENST00000469140	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.72	■■■□□ 2.99
MTA1-209	ENST00000469140	RGL3	Q3MIN7	710 aa		33.71	■■■□□ 2.99
MTA1-209	ENST00000469140	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.7	■■■□□ 2.99
MTA1-209	ENST00000469140	SYNM	O15061	1565 aa		33.7	■■■□□ 2.99
MTA1-209	ENST00000469140	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		33.7	■■■□□ 2.99
MTA1-209	ENST00000469140	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		33.68	■■■□□ 2.98
MTA1-209	ENST00000469140	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.68	■■■□□ 2.98
MTA1-209	ENST00000469140	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.68	■■■□□ 2.98
MTA1-209	ENST00000469140	PIK3C2B	O00750	1634 aa		33.67	■■■□□ 2.98
MTA1-209	ENST00000469140	KIF1B	O60333	1816 aa		33.65	■■■□□ 2.98
MTA1-209	ENST00000469140	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.65	■■■□□ 2.98
MTA1-209	ENST00000469140	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.65	■■■□□ 2.98
MTA1-209	ENST00000469140	STAC3	Q96MF2	364 aa		33.64	■■■□□ 2.98
MTA1-209	ENST00000469140	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		33.62	■■■□□ 2.97
MTA1-209	ENST00000469140	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		33.61	■■■□□ 2.97
MTA1-209	ENST00000469140	ADGRB3	O60242	1522 aa		33.6	■■■□□ 2.97
MTA1-209	ENST00000469140	IDI1	Q13907	227 aa		33.6	■■■□□ 2.97
MTA1-209	ENST00000469140	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.59	■■■□□ 2.97
MTA1-209	ENST00000469140	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	33.55	■■■□□ 2.96
MTA1-209	ENST00000469140	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	33.54	■■■□□ 2.96
MTA1-209	ENST00000469140	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	33.52	■■■□□ 2.96
MTA1-209	ENST00000469140	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		33.52	■■■□□ 2.96
MTA1-209	ENST00000469140	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		33.52	■■■□□ 2.96
MTA1-209	ENST00000469140	TNR	Q92752	1358 aa		33.49	■■■□□ 2.95
MTA1-209	ENST00000469140	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		33.48	■■■□□ 2.95
MTA1-209	ENST00000469140	C3	P01024	1663 aa		33.47	■■■□□ 2.95
MTA1-209	ENST00000469140	MADD	Q8WXG6	1647 aa		33.47	■■■□□ 2.95
MTA1-209	ENST00000469140	MYOM2	P54296	1465 aa		33.46	■■■□□ 2.95
MTA1-209	ENST00000469140	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		33.46	■■■□□ 2.95
MTA1-209	ENST00000469140	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		33.45	■■■□□ 2.95
MTA1-209	ENST00000469140	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.45	■■■□□ 2.94
MTA1-209	ENST00000469140	IFT172	Q9UG01	1749 aa		33.43	■■■□□ 2.94
MTA1-209	ENST00000469140	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		33.42	■■■□□ 2.94
MTA1-209	ENST00000469140	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
MTA1-209	ENST00000469140	PPL	O60437	1756 aa		33.38	■■■□□ 2.93
MTA1-209	ENST00000469140	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		33.37	■■■□□ 2.93
MTA1-209	ENST00000469140	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.37	■■■□□ 2.93
MTA1-209	ENST00000469140	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		33.36	■■■□□ 2.93
MTA1-209	ENST00000469140	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	33.36	■■■□□ 2.93
MTA1-209	ENST00000469140	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.35	■■■□□ 2.93
MTA1-209	ENST00000469140	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		33.35	■■■□□ 2.93

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