RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468255.5

CSNK2B-206, Transcript of casein kinase 2 beta, humanhuman

TSL 5

Gene CSNK2B, Length 1,792 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2B-206ENST00000468255 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK2B-206ENST00000468255 LAMC1P11047 1609 aa20.33■□□□□ 0.84
CSNK2B-206ENST00000468255 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.33■□□□□ 0.84
CSNK2B-206ENST00000468255 SHROOM2Q13796 1616 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK2B-206ENST00000468255 PLXNC1O60486 1568 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK2B-206ENST00000468255 E9PCH4 1651 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK2B-206ENST00000468255 RALBP1Q15311 655 aa20.31■□□□□ 0.84
CSNK2B-206ENST00000468255 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CSNK2B-206ENST00000468255 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CSNK2B-206ENST00000468255 NUDCQ9Y266 331 aa20.29■□□□□ 0.84
CSNK2B-206ENST00000468255 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.27■□□□□ 0.84
CSNK2B-206ENST00000468255 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
CSNK2B-206ENST00000468255 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.27■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.27■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 ATP10AO60312 1499 aa20.24■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 ABCC2Q92887 1545 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.23■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 CHD1O14646 1710 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 INSRP06213 1382 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 TMC1Q8TDI8 760 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.22■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 ERBINQ96RT1 1412 aa20.21■□□□□ 0.83
CSNK2B-206ENST00000468255 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK2B-206ENST00000468255 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK2B-206ENST00000468255 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.2■□□□□ 0.82
CSNK2B-206ENST00000468255 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.19■□□□□ 0.82
CSNK2B-206ENST00000468255 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
CSNK2B-206ENST00000468255 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.16■□□□□ 0.82
CSNK2B-206ENST00000468255 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.14■□□□□ 0.82
CSNK2B-206ENST00000468255 A2MP01023 1474 aa20.14■□□□□ 0.82
CSNK2B-206ENST00000468255 PLA2R1Q13018 1463 aa20.14■□□□□ 0.82
CSNK2B-206ENST00000468255 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
CSNK2B-206ENST00000468255 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.14■□□□□ 0.81
CSNK2B-206ENST00000468255 PDE3BQ13370 1112 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK2B-206ENST00000468255 NLRP13Q86W25 1043 aa20.13■□□□□ 0.81
CSNK2B-206ENST00000468255 PLCH2O75038 1416 aa20.12■□□□□ 0.81
CSNK2B-206ENST00000468255 STAC3Q96MF2 364 aa20.11■□□□□ 0.81
CSNK2B-206ENST00000468255 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.11■□□□□ 0.81
CSNK2B-206ENST00000468255 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.1■□□□□ 0.81
CSNK2B-206ENST00000468255 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CSNK2B-206ENST00000468255 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK2B-206ENST00000468255 ABCC1P33527 1531 aa20.07■□□□□ 0.8
CSNK2B-206ENST00000468255 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.06■□□□□ 0.8
CSNK2B-206ENST00000468255 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.06■□□□□ 0.8
CSNK2B-206ENST00000468255 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.05■□□□□ 0.8
CSNK2B-206ENST00000468255 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CSNK2B-206ENST00000468255 MSH5O43196 834 aa20.04■□□□□ 0.8
CSNK2B-206ENST00000468255 TMF1P82094 1093 aa20.03■□□□□ 0.8
CSNK2B-206ENST00000468255 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.03■□□□□ 0.8
CSNK2B-206ENST00000468255 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CSNK2B-206ENST00000468255 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.01■□□□□ 0.79
CSNK2B-206ENST00000468255 TESK2Q96S53 571 aa20■□□□□ 0.79
CSNK2B-206ENST00000468255 CLASP1Q7Z460 1538 aa20■□□□□ 0.79
CSNK2B-206ENST00000468255 TRPM2O94759 1503 aa19.99■□□□□ 0.79
CSNK2B-206ENST00000468255 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CSNK2B-206ENST00000468255 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.794e-9■■■□□ 14.6
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CSNK2B-206ENST00000468255 RGL3Q3MIN7 710 aa19.98■□□□□ 0.79
CSNK2B-206ENST00000468255 CDCA8Q53HL2 280 aa19.97■□□□□ 0.79
CSNK2B-206ENST00000468255 SCAPERQ9BY12 1400 aa19.97■□□□□ 0.79
CSNK2B-206ENST00000468255 DEPDC5O75140 1603 aa19.97■□□□□ 0.79
CSNK2B-206ENST00000468255 CEP152O94986 1710 aa19.97■□□□□ 0.79
CSNK2B-206ENST00000468255 IQGAP1P46940 1657 aa19.96■□□□□ 0.79
CSNK2B-206ENST00000468255 MADDQ8WXG6 1647 aa19.96■□□□□ 0.79
CSNK2B-206ENST00000468255 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.96■□□□□ 0.79
CSNK2B-206ENST00000468255 RRP1P56182 461 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
CSNK2B-206ENST00000468255 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa19.96■□□□□ 0.79
CSNK2B-206ENST00000468255 PTPRTO14522 1441 aa19.96■□□□□ 0.79
CSNK2B-206ENST00000468255 DISP3Q9P2K9 1392 aa19.95■□□□□ 0.78
CSNK2B-206ENST00000468255 SLC24A1O60721 1099 aa19.95■□□□□ 0.78
CSNK2B-206ENST00000468255 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
CSNK2B-206ENST00000468255 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa19.94■□□□□ 0.78
CSNK2B-206ENST00000468255 RCAN3Q9UKA8 241 aa19.94■□□□□ 0.78
CSNK2B-206ENST00000468255 TET3O43151 1660 aa19.94■□□□□ 0.78
CSNK2B-206ENST00000468255 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa19.93■□□□□ 0.78
CSNK2B-206ENST00000468255 WDR7Q9Y4E6 1490 aa19.93■□□□□ 0.78
CSNK2B-206ENST00000468255 SYNMO15061 1565 aa19.92■□□□□ 0.78
CSNK2B-206ENST00000468255 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CSNK2B-206ENST00000468255 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa19.91■□□□□ 0.78
CSNK2B-206ENST00000468255 PANK3Q9H999 370 aa19.9■□□□□ 0.78
CSNK2B-206ENST00000468255 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
CSNK2B-206ENST00000468255 KANK1Q14678 1352 aa19.9■□□□□ 0.78
CSNK2B-206ENST00000468255 VWDEQ8N2E2 1590 aa19.89■□□□□ 0.78
CSNK2B-206ENST00000468255 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
CSNK2B-206ENST00000468255 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa19.88■□□□□ 0.77
CSNK2B-206ENST00000468255 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
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