RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
ODC1-204ENST00000446285 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.66■■■■■ 4.26
ODC1-204ENST00000446285 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
ODC1-204ENST00000446285 PTPRTO14522 1441 aa41.64■■■■■ 4.26
ODC1-204ENST00000446285 NCOA1Q15788 1441 aa41.64■■■■■ 4.26
ODC1-204ENST00000446285 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.64■■■■■ 4.26
ODC1-204ENST00000446285 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.63■■■■■ 4.25
ODC1-204ENST00000446285 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.63■■■■■ 4.25
ODC1-204ENST00000446285 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
ODC1-204ENST00000446285 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
ODC1-204ENST00000446285 PZPP20742 1482 aa41.6■■■■■ 4.25
ODC1-204ENST00000446285 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.6■■■■■ 4.25
ODC1-204ENST00000446285 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.59■■■■■ 4.25
ODC1-204ENST00000446285 ABCC5O15440 1437 aa41.58■■■■■ 4.25
ODC1-204ENST00000446285 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
ODC1-204ENST00000446285 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
ODC1-204ENST00000446285 PLA2R1Q13018 1463 aa41.53■■■■■ 4.24
ODC1-204ENST00000446285 DAPK1P53355 1430 aa41.53■■■■■ 4.24
ODC1-204ENST00000446285 CERKQ8TCT0 537 aa41.51■■■■■ 4.24
ODC1-204ENST00000446285 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.51■■■■■ 4.24
ODC1-204ENST00000446285 KIF15Q9NS87 1388 aa41.5■■■■■ 4.23
ODC1-204ENST00000446285 TNRQ92752 1358 aa41.49■■■■■ 4.23
ODC1-204ENST00000446285 ERBINQ96RT1 1412 aa41.47■■■■■ 4.23
ODC1-204ENST00000446285 ABCC3O15438 1527 aa41.47■■■■■ 4.23
ODC1-204ENST00000446285 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.44■■■■■ 4.22
ODC1-204ENST00000446285 PKD2Q13563 968 aa41.43■■■■■ 4.22
ODC1-204ENST00000446285 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
ODC1-204ENST00000446285 NLRP1Q9C000 1473 aa41.38■■■■■ 4.21
ODC1-204ENST00000446285 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.37■■■■■ 4.21
ODC1-204ENST00000446285 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.37■■■■■ 4.21
ODC1-204ENST00000446285 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
ODC1-204ENST00000446285 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.34■■■■■ 4.21
ODC1-204ENST00000446285 CEP152O94986 1710 aa41.33■■■■■ 4.21
ODC1-204ENST00000446285 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.33■■■■■ 4.21
ODC1-204ENST00000446285 DEPDC5O75140 1603 aa41.3■■■■■ 4.2
ODC1-204ENST00000446285 ADGRL2O95490 1459 aa41.28■■■■■ 4.2
ODC1-204ENST00000446285 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.27■■■■■ 4.2
ODC1-204ENST00000446285 ERVK-7P63135 1459 aa41.26■■■■■ 4.2
ODC1-204ENST00000446285 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
ODC1-204ENST00000446285 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.25■■■■■ 4.19
ODC1-204ENST00000446285 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
ODC1-204ENST00000446285 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.24■■■■■ 4.19
ODC1-204ENST00000446285 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
ODC1-204ENST00000446285 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.23■■■■■ 4.19
ODC1-204ENST00000446285 KANK1Q14678 1352 aa41.23■■■■■ 4.19
ODC1-204ENST00000446285 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.21■■■■■ 4.19
ODC1-204ENST00000446285 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
ODC1-204ENST00000446285 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.13■■■■■ 4.18
ODC1-204ENST00000446285 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.13■■■■■ 4.17
ODC1-204ENST00000446285 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.13■■■■■ 4.172e-6■■□□□ 13.1
ODC1-204ENST00000446285 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.12■■■■■ 4.17
ODC1-204ENST00000446285 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.12■■■■■ 4.17
ODC1-204ENST00000446285 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.12■■■■■ 4.175e-16■■□□□ 13.7
ODC1-204ENST00000446285 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
ODC1-204ENST00000446285 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.06■■■■■ 4.16
ODC1-204ENST00000446285 MED14O60244 1454 aa41.04■■■■■ 4.16
ODC1-204ENST00000446285 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.02■■■■■ 4.16
ODC1-204ENST00000446285 ROCK1Q13464 1354 aa40.99■■■■■ 4.15
ODC1-204ENST00000446285 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
ODC1-204ENST00000446285 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.98■■■■■ 4.15
ODC1-204ENST00000446285 IQGAP1P46940 1657 aa40.94■■■■■ 4.14
ODC1-204ENST00000446285 CPS1P31327 1500 aa40.92■■■■■ 4.14
ODC1-204ENST00000446285 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
ODC1-204ENST00000446285 SLIT1O75093 1534 aa40.89■■■■■ 4.14
ODC1-204ENST00000446285 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
ODC1-204ENST00000446285 PIK3C2BO00750 1634 aa40.88■■■■■ 4.13
ODC1-204ENST00000446285 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.88■■■■■ 4.13
ODC1-204ENST00000446285 UNC13BO14795 1591 aa40.87■■■■■ 4.13
ODC1-204ENST00000446285 NOS1P29475 1434 aa40.86■■■■■ 4.13
ODC1-204ENST00000446285 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
ODC1-204ENST00000446285 TET3O43151 1660 aa40.85■■■■■ 4.13
ODC1-204ENST00000446285 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
ODC1-204ENST00000446285 SYNMO15061 1565 aa40.82■■■■■ 4.13
ODC1-204ENST00000446285 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.79■■■■■ 4.12
ODC1-204ENST00000446285 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.79■■■■■ 4.12
ODC1-204ENST00000446285 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.77■■■■■ 4.12
ODC1-204ENST00000446285 EID1Q9Y6B2 187 aa40.77■■■■■ 4.12
ODC1-204ENST00000446285 IDI1Q13907 227 aa40.76■■■■■ 4.12
ODC1-204ENST00000446285 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.75■■■■■ 4.11
ODC1-204ENST00000446285 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.75■■■■■ 4.11
ODC1-204ENST00000446285 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.73■■■■■ 4.11
ODC1-204ENST00000446285 ITGAEP38570 1179 aa40.72■■■■■ 4.11
ODC1-204ENST00000446285 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
ODC1-204ENST00000446285 ADGRB3O60242 1522 aa40.72■■■■■ 4.11
ODC1-204ENST00000446285 LTKP29376 864 aa40.71■■■■■ 4.11
ODC1-204ENST00000446285 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.71■■■■■ 4.11
ODC1-204ENST00000446285 E9PCH4 1651 aa40.62■■■■■ 4.09
ODC1-204ENST00000446285 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.61■■■■■ 4.09
ODC1-204ENST00000446285 NUP155O75694 1391 aa40.6■■■■■ 4.09
ODC1-204ENST00000446285 TOM1O60784 492 aa40.57■■■■■ 4.09
ODC1-204ENST00000446285 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.53■■■■■ 4.08
ODC1-204ENST00000446285 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.5■■■■■ 4.07
ODC1-204ENST00000446285 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.49■■■■■ 4.07
ODC1-204ENST00000446285 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
ODC1-204ENST00000446285 ZFYVE9O95405 1425 aa40.45■■■■■ 4.07
ODC1-204ENST00000446285 NAIPQ13075 1403 aa40.42■■■■■ 4.06
ODC1-204ENST00000446285 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.41■■■■■ 4.06
ODC1-204ENST00000446285 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
ODC1-204ENST00000446285 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.37■■■■■ 4.05
ODC1-204ENST00000446285 PIP4K2BP78356 416 aa40.37■■■■■ 4.05
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