RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.7■■□□□ 1.38
HERC3-206ENST00000431413 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.69■■□□□ 1.38
HERC3-206ENST00000431413 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.69■■□□□ 1.38
HERC3-206ENST00000431413 PKD2Q13563 968 aa23.68■■□□□ 1.38
HERC3-206ENST00000431413 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
HERC3-206ENST00000431413 PLA2R1Q13018 1463 aa23.67■■□□□ 1.38
HERC3-206ENST00000431413 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
HERC3-206ENST00000431413 PZPP20742 1482 aa23.66■■□□□ 1.38
HERC3-206ENST00000431413 TNRQ92752 1358 aa23.65■■□□□ 1.38
HERC3-206ENST00000431413 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.65■■□□□ 1.38
HERC3-206ENST00000431413 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
HERC3-206ENST00000431413 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.64■■□□□ 1.38
HERC3-206ENST00000431413 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.59■■□□□ 1.37
HERC3-206ENST00000431413 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
HERC3-206ENST00000431413 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
HERC3-206ENST00000431413 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.59■■□□□ 1.37
HERC3-206ENST00000431413 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.58■■□□□ 1.37
HERC3-206ENST00000431413 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
HERC3-206ENST00000431413 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.58■■□□□ 1.36
HERC3-206ENST00000431413 ABCC5O15440 1437 aa23.57■■□□□ 1.36
HERC3-206ENST00000431413 KIF15Q9NS87 1388 aa23.56■■□□□ 1.36
HERC3-206ENST00000431413 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
HERC3-206ENST00000431413 NLRP1Q9C000 1473 aa23.56■■□□□ 1.36
HERC3-206ENST00000431413 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
HERC3-206ENST00000431413 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.55■■□□□ 1.36
HERC3-206ENST00000431413 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.55■■□□□ 1.36
HERC3-206ENST00000431413 DAPK1P53355 1430 aa23.54■■□□□ 1.36
HERC3-206ENST00000431413 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
HERC3-206ENST00000431413 ABCC3O15438 1527 aa23.54■■□□□ 1.36
HERC3-206ENST00000431413 ERBINQ96RT1 1412 aa23.52■■□□□ 1.36
HERC3-206ENST00000431413 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.52■■□□□ 1.36
HERC3-206ENST00000431413 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.51■■□□□ 1.35
HERC3-206ENST00000431413 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
HERC3-206ENST00000431413 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.51■■□□□ 1.35
HERC3-206ENST00000431413 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.5■■□□□ 1.35
HERC3-206ENST00000431413 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.48■■□□□ 1.35
HERC3-206ENST00000431413 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.48■■□□□ 1.35
HERC3-206ENST00000431413 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
HERC3-206ENST00000431413 KANK1Q14678 1352 aa23.47■■□□□ 1.35
HERC3-206ENST00000431413 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.47■■□□□ 1.35
HERC3-206ENST00000431413 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
HERC3-206ENST00000431413 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.45■■□□□ 1.34
HERC3-206ENST00000431413 ERVK-7P63135 1459 aa23.45■■□□□ 1.34
HERC3-206ENST00000431413 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
HERC3-206ENST00000431413 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HERC3-206ENST00000431413 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.42■■□□□ 1.34
HERC3-206ENST00000431413 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HERC3-206ENST00000431413 CEP152O94986 1710 aa23.4■■□□□ 1.34
HERC3-206ENST00000431413 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HERC3-206ENST00000431413 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.38■■□□□ 1.33
HERC3-206ENST00000431413 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.37■■□□□ 1.33
HERC3-206ENST00000431413 MED14O60244 1454 aa23.36■■□□□ 1.33
HERC3-206ENST00000431413 DEPDC5O75140 1603 aa23.36■■□□□ 1.33
HERC3-206ENST00000431413 ADGRL2O95490 1459 aa23.36■■□□□ 1.33
HERC3-206ENST00000431413 CPS1P31327 1500 aa23.33■■□□□ 1.33
HERC3-206ENST00000431413 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.32■■□□□ 1.32
HERC3-206ENST00000431413 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
HERC3-206ENST00000431413 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.31■■□□□ 1.32
HERC3-206ENST00000431413 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.31■■□□□ 1.32
HERC3-206ENST00000431413 EID1Q9Y6B2 187 aa23.3■■□□□ 1.32
HERC3-206ENST00000431413 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.28■■□□□ 1.32
HERC3-206ENST00000431413 IQGAP1P46940 1657 aa23.28■■□□□ 1.32
HERC3-206ENST00000431413 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.27■■□□□ 1.32
HERC3-206ENST00000431413 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.27■■□□□ 1.32
HERC3-206ENST00000431413 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
HERC3-206ENST00000431413 TOM1O60784 492 aa23.26■■□□□ 1.31
HERC3-206ENST00000431413 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.24■■□□□ 1.31
HERC3-206ENST00000431413 SLIT1O75093 1534 aa23.23■■□□□ 1.31
HERC3-206ENST00000431413 IDI1Q13907 227 aa23.23■■□□□ 1.31
HERC3-206ENST00000431413 LTKP29376 864 aa23.22■■□□□ 1.31
HERC3-206ENST00000431413 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.22■■□□□ 1.31
HERC3-206ENST00000431413 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.22■■□□□ 1.31
HERC3-206ENST00000431413 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HERC3-206ENST00000431413 ROCK1Q13464 1354 aa23.21■■□□□ 1.31
HERC3-206ENST00000431413 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.21■■□□□ 1.31
HERC3-206ENST00000431413 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.21■■□□□ 1.31
HERC3-206ENST00000431413 NOS1P29475 1434 aa23.2■■□□□ 1.3
HERC3-206ENST00000431413 PIK3C2BO00750 1634 aa23.19■■□□□ 1.3
HERC3-206ENST00000431413 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
HERC3-206ENST00000431413 PIP4K2BP78356 416 aa23.18■■□□□ 1.3
HERC3-206ENST00000431413 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
HERC3-206ENST00000431413 ITGAEP38570 1179 aa23.16■■□□□ 1.3
HERC3-206ENST00000431413 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
HERC3-206ENST00000431413 SYNMO15061 1565 aa23.14■■□□□ 1.3
HERC3-206ENST00000431413 TET3O43151 1660 aa23.12■■□□□ 1.29
HERC3-206ENST00000431413 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.12■■□□□ 1.29
HERC3-206ENST00000431413 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
HERC3-206ENST00000431413 UNC13BO14795 1591 aa23.1■■□□□ 1.29
HERC3-206ENST00000431413 ADGRB3O60242 1522 aa23.1■■□□□ 1.29
HERC3-206ENST00000431413 BCANQ96GW7 911 aa23.08■■□□□ 1.29
HERC3-206ENST00000431413 NUP155O75694 1391 aa23.07■■□□□ 1.28
HERC3-206ENST00000431413 HSPA1LP34931 641 aa23.07■■□□□ 1.28
HERC3-206ENST00000431413 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.06■■□□□ 1.28
HERC3-206ENST00000431413 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.06■■□□□ 1.28
HERC3-206ENST00000431413 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.05■■□□□ 1.28
HERC3-206ENST00000431413 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
HERC3-206ENST00000431413 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
HERC3-206ENST00000431413 KCNA6P17658 529 aa23.03■■□□□ 1.28
HERC3-206ENST00000431413 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.01■■□□□ 1.27
HERC3-206ENST00000431413 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
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