RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416322.5

CLDN12-204, Transcript of claudin 12, humanhuman

TSL 5

Gene CLDN12, Length 1,163 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12-204ENST00000416322 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.83□□□□□ -0.04
CLDN12-204ENST00000416322 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.83□□□□□ -0.04
CLDN12-204ENST00000416322 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.82□□□□□ -0.04
CLDN12-204ENST00000416322 HSPA2P54652 639 aa14.82□□□□□ -0.04
CLDN12-204ENST00000416322 SLC4A2P04920 1241 aa14.8□□□□□ -0.04
CLDN12-204ENST00000416322 ITGAEP38570 1179 aa14.8□□□□□ -0.04
CLDN12-204ENST00000416322 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.8□□□□□ -0.04
CLDN12-204ENST00000416322 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.8□□□□□ -0.04
CLDN12-204ENST00000416322 ZMYM3Q14202 1370 aa14.79□□□□□ -0.04
CLDN12-204ENST00000416322 ABCC5O15440 1437 aa14.78□□□□□ -0.04
CLDN12-204ENST00000416322 DAPK1P53355 1430 aa14.78□□□□□ -0.04
CLDN12-204ENST00000416322 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
CLDN12-204ENST00000416322 PLXNC1O60486 1568 aa14.77□□□□□ -0.04
CLDN12-204ENST00000416322 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.77□□□□□ -0.04
CLDN12-204ENST00000416322 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.77□□□□□ -0.04
CLDN12-204ENST00000416322 KIF15Q9NS87 1388 aa14.77□□□□□ -0.04
CLDN12-204ENST00000416322 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CLDN12-204ENST00000416322 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN12-204ENST00000416322 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN12-204ENST00000416322 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN12-204ENST00000416322 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.71□□□□□ -0.05
CLDN12-204ENST00000416322 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CLDN12-204ENST00000416322 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
CLDN12-204ENST00000416322 C3P01024 1663 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN12-204ENST00000416322 KANK1Q14678 1352 aa14.7□□□□□ -0.06
CLDN12-204ENST00000416322 NPATQ14207 1427 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN12-204ENST00000416322 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CLDN12-204ENST00000416322 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.69□□□□□ -0.06
CLDN12-204ENST00000416322 ERBINQ96RT1 1412 aa14.67□□□□□ -0.06
CLDN12-204ENST00000416322 PTPRKQ15262 1439 aa14.66□□□□□ -0.06
CLDN12-204ENST00000416322 NCOA1Q15788 1441 aa14.66□□□□□ -0.06
CLDN12-204ENST00000416322 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.66□□□□□ -0.06
CLDN12-204ENST00000416322 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.66□□□□□ -0.06
CLDN12-204ENST00000416322 TNRQ92752 1358 aa14.66□□□□□ -0.06
CLDN12-204ENST00000416322 MROH2AA6NES4 1674 aa14.65□□□□□ -0.06
CLDN12-204ENST00000416322 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.63□□□□□ -0.07
CLDN12-204ENST00000416322 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLDN12-204ENST00000416322 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.62□□□□□ -0.07
CLDN12-204ENST00000416322 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CLDN12-204ENST00000416322 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.62□□□□□ -0.07
CLDN12-204ENST00000416322 PZPP20742 1482 aa14.62□□□□□ -0.07
CLDN12-204ENST00000416322 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN12-204ENST00000416322 ADGRL2O95490 1459 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN12-204ENST00000416322 ABCC3O15438 1527 aa14.61□□□□□ -0.07
CLDN12-204ENST00000416322 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CLDN12-204ENST00000416322 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.6□□□□□ -0.07
CLDN12-204ENST00000416322 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
CLDN12-204ENST00000416322 ROCK1Q13464 1354 aa14.58□□□□□ -0.08
CLDN12-204ENST00000416322 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CLDN12-204ENST00000416322 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.57□□□□□ -0.08
CLDN12-204ENST00000416322 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN12-204ENST00000416322 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN12-204ENST00000416322 PKD2Q13563 968 aa14.56□□□□□ -0.08
CLDN12-204ENST00000416322 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CLDN12-204ENST00000416322 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CLDN12-204ENST00000416322 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CLDN12-204ENST00000416322 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CLDN12-204ENST00000416322 MROH1Q8NDA8 1641 aa14.55□□□□□ -0.08
CLDN12-204ENST00000416322 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN12-204ENST00000416322 ERVK-7P63135 1459 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN12-204ENST00000416322 NLRP1Q9C000 1473 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN12-204ENST00000416322 CEP152O94986 1710 aa14.54□□□□□ -0.08
CLDN12-204ENST00000416322 NUP155O75694 1391 aa14.53□□□□□ -0.08
CLDN12-204ENST00000416322 TRIM52Q96A61 297 aa14.53□□□□□ -0.08
CLDN12-204ENST00000416322 UGGT1Q9NYU2 1555 aa14.51□□□□□ -0.09
CLDN12-204ENST00000416322 CHGAP10645 457 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CLDN12-204ENST00000416322 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa14.5□□□□□ -0.09
CLDN12-204ENST00000416322 PTPRTO14522 1441 aa14.49□□□□□ -0.09
CLDN12-204ENST00000416322 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CLDN12-204ENST00000416322 CERKQ8TCT0 537 aa14.49□□□□□ -0.09
CLDN12-204ENST00000416322 EID1Q9Y6B2 187 aa14.49□□□□□ -0.09
CLDN12-204ENST00000416322 PLA2R1Q13018 1463 aa14.49□□□□□ -0.09
CLDN12-204ENST00000416322 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CLDN12-204ENST00000416322 DEPDC5O75140 1603 aa14.48□□□□□ -0.09
CLDN12-204ENST00000416322 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.48□□□□□ -0.09
CLDN12-204ENST00000416322 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CLDN12-204ENST00000416322 BCANQ96GW7 911 aa14.48□□□□□ -0.09
CLDN12-204ENST00000416322 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CLDN12-204ENST00000416322 IDI1Q13907 227 aa14.47□□□□□ -0.09
CLDN12-204ENST00000416322 STRCQ7RTU9 1775 aa14.47□□□□□ -0.09
CLDN12-204ENST00000416322 LMTK2Q8IWU2 1503 aa14.46□□□□□ -0.09
CLDN12-204ENST00000416322 TXNDC2Q86VQ3 553 aa14.46□□□□□ -0.09
CLDN12-204ENST00000416322 SLC52A1Q9NWF4 448 aa14.45□□□□□ -0.1
CLDN12-204ENST00000416322 EFCAB6Q5THR3 1501 aa14.45□□□□□ -0.1
CLDN12-204ENST00000416322 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
CLDN12-204ENST00000416322 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.44□□□□□ -0.1
CLDN12-204ENST00000416322 FBXO41Q8TF61 875 aa14.44□□□□□ -0.1
CLDN12-204ENST00000416322 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
CLDN12-204ENST00000416322 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
CLDN12-204ENST00000416322 NAIPQ13075 1403 aa14.42□□□□□ -0.1
CLDN12-204ENST00000416322 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
CLDN12-204ENST00000416322 UNC13BO14795 1591 aa14.42□□□□□ -0.1
CLDN12-204ENST00000416322 HFM1A2PYH4 1435 aa14.41□□□□□ -0.1
CLDN12-204ENST00000416322 NOS1P29475 1434 aa14.41□□□□□ -0.1
CLDN12-204ENST00000416322 HDGFP51858 240 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
CLDN12-204ENST00000416322 TET3O43151 1660 aa14.39□□□□□ -0.11
CLDN12-204ENST00000416322 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.39□□□□□ -0.11
CLDN12-204ENST00000416322 LTKP29376 864 aa14.39□□□□□ -0.11
CLDN12-204ENST00000416322 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
CLDN12-204ENST00000416322 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms