RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRK-208ENST00000392449 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRK-208ENST00000392449 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRK-208ENST00000392449 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRK-208ENST00000392449 MIA2Q96PC5 1412 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRK-208ENST00000392449 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PTPRK-208ENST00000392449 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRK-208ENST00000392449 PZPP20742 1482 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRK-208ENST00000392449 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRK-208ENST00000392449 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PTPRK-208ENST00000392449 APLP2Q06481 763 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRK-208ENST00000392449 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PTPRK-208ENST00000392449 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRK-208ENST00000392449 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRK-208ENST00000392449 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRK-208ENST00000392449 TNRQ92752 1358 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRK-208ENST00000392449 PLA2R1Q13018 1463 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRK-208ENST00000392449 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PTPRK-208ENST00000392449 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRK-208ENST00000392449 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRK-208ENST00000392449 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PTPRK-208ENST00000392449 ABCC3O15438 1527 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRK-208ENST00000392449 ABCC5O15440 1437 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PTPRK-208ENST00000392449 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRK-208ENST00000392449 CEP152O94986 1710 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRK-208ENST00000392449 PKD2Q13563 968 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRK-208ENST00000392449 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRK-208ENST00000392449 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRK-208ENST00000392449 KIF15Q9NS87 1388 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRK-208ENST00000392449 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRK-208ENST00000392449 DAPK1P53355 1430 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRK-208ENST00000392449 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRK-208ENST00000392449 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PTPRK-208ENST00000392449 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRK-208ENST00000392449 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.74
PTPRK-208ENST00000392449 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PTPRK-208ENST00000392449 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRK-208ENST00000392449 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRK-208ENST00000392449 NLRP1Q9C000 1473 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRK-208ENST00000392449 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRK-208ENST00000392449 ERVK-7P63135 1459 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRK-208ENST00000392449 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PTPRK-208ENST00000392449 ERBINQ96RT1 1412 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRK-208ENST00000392449 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRK-208ENST00000392449 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.731e-6■■□□□ 13
PTPRK-208ENST00000392449 DEPDC5O75140 1603 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRK-208ENST00000392449 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
PTPRK-208ENST00000392449 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
PTPRK-208ENST00000392449 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRK-208ENST00000392449 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRK-208ENST00000392449 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRK-208ENST00000392449 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PTPRK-208ENST00000392449 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRK-208ENST00000392449 IQGAP1P46940 1657 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRK-208ENST00000392449 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRK-208ENST00000392449 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRK-208ENST00000392449 MED14O60244 1454 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRK-208ENST00000392449 ADGRL2O95490 1459 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRK-208ENST00000392449 KANK1Q14678 1352 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRK-208ENST00000392449 PIK3C2BO00750 1634 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRK-208ENST00000392449 CPS1P31327 1500 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRK-208ENST00000392449 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRK-208ENST00000392449 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRK-208ENST00000392449 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
PTPRK-208ENST00000392449 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRK-208ENST00000392449 SYNMO15061 1565 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRK-208ENST00000392449 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
PTPRK-208ENST00000392449 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.64■■□□□ 1.69
PTPRK-208ENST00000392449 LTKP29376 864 aa25.64■■□□□ 1.69
PTPRK-208ENST00000392449 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.64■■□□□ 1.69
PTPRK-208ENST00000392449 SLIT1O75093 1534 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRK-208ENST00000392449 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRK-208ENST00000392449 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRK-208ENST00000392449 PIP4K2BP78356 416 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRK-208ENST00000392449 IDI1Q13907 227 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRK-208ENST00000392449 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
PTPRK-208ENST00000392449 NOS1P29475 1434 aa25.58■■□□□ 1.68
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PTPRK-208ENST00000392449 ALKQ9UM73 1620 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRK-208ENST00000392449 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.55■■□□□ 1.68
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PTPRK-208ENST00000392449 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
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PTPRK-208ENST00000392449 TET3O43151 1660 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRK-208ENST00000392449 ADGRB3O60242 1522 aa25.52■■□□□ 1.68
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PTPRK-208ENST00000392449 TOM1O60784 492 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRK-208ENST00000392449 ILDR2Q71H61 639 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRK-208ENST00000392449 HSPA1LP34931 641 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRK-208ENST00000392449 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRK-208ENST00000392449 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRK-208ENST00000392449 ROCK1Q13464 1354 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRK-208ENST00000392449 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PTPRK-208ENST00000392449 E9PCH4 1651 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRK-208ENST00000392449 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
PTPRK-208ENST00000392449 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRK-208ENST00000392449 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRK-208ENST00000392449 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.42■■□□□ 1.66
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