RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380283.4

PXDC1-202, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PXDC1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-202ENST00000380283 BCL11AQ9H165 835 aa36.36■■■■□ 3.41
PXDC1-202ENST00000380283 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.35■■■■□ 3.41
PXDC1-202ENST00000380283 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.32■■■■□ 3.4
PXDC1-202ENST00000380283 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.31■■■■□ 3.4
PXDC1-202ENST00000380283 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.3■■■■□ 3.4
PXDC1-202ENST00000380283 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
PXDC1-202ENST00000380283 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.27■■■■□ 3.4
PXDC1-202ENST00000380283 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.27■■■■□ 3.4
PXDC1-202ENST00000380283 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.27■■■■□ 3.4
PXDC1-202ENST00000380283 ATP7AQ04656 1500 aa36.26■■■■□ 3.4
PXDC1-202ENST00000380283 PPP4R2Q9NY27 417 aa36.26■■■■□ 3.39
PXDC1-202ENST00000380283 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.39
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PXDC1-202ENST00000380283 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
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PXDC1-202ENST00000380283 PZPP20742 1482 aa36.21■■■■□ 3.39
PXDC1-202ENST00000380283 NUP155O75694 1391 aa36.21■■■■□ 3.39
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PXDC1-202ENST00000380283 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.16■■■■□ 3.38
PXDC1-202ENST00000380283 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.16■■■■□ 3.38
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PXDC1-202ENST00000380283 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.11■■■■□ 3.37
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PXDC1-202ENST00000380283 UNC13BO14795 1591 aa36.06■■■■□ 3.36
PXDC1-202ENST00000380283 MRS2Q9HD23 443 aa36.05■■■■□ 3.36
PXDC1-202ENST00000380283 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.01■■■■□ 3.36
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PXDC1-202ENST00000380283 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.99■■■■□ 3.35
PXDC1-202ENST00000380283 KIF3BO15066 747 aa35.99■■■■□ 3.35
PXDC1-202ENST00000380283 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.98■■■■□ 3.35
PXDC1-202ENST00000380283 ERICH6Q7L0X2 663 aa35.98■■■■□ 3.35
PXDC1-202ENST00000380283 KIF7Q2M1P5 1343 aa35.97■■■■□ 3.35
PXDC1-202ENST00000380283 ABCA6Q8N139 1617 aa35.94■■■■□ 3.34
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PXDC1-202ENST00000380283 E9PCH4 1651 aa35.65■■■■□ 3.3
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PXDC1-202ENST00000380283 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.61■■■■□ 3.29
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PXDC1-202ENST00000380283 REREQ9P2R6 1566 aa35.59■■■■□ 3.29
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PXDC1-202ENST00000380283 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.55■■■■□ 3.28
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PXDC1-202ENST00000380283 AGLP35573 1532 aa35.52■■■■□ 3.28
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PXDC1-202ENST00000380283 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.48■■■■□ 3.27
PXDC1-202ENST00000380283 TRPM2O94759 1503 aa35.47■■■■□ 3.27
PXDC1-202ENST00000380283 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.46■■■■□ 3.27
PXDC1-202ENST00000380283 NPATQ14207 1427 aa35.45■■■■□ 3.27
PXDC1-202ENST00000380283 DEKP35659 375 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
PXDC1-202ENST00000380283 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
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