RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376504.3

PTF1A-201, Transcript of pancreas associated transcription factor 1a, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTF1A, Length 1,537 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1A-201ENST00000376504 KIF3BO15066 747 aa47.28■■■■■ 5.16
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PTF1A-201ENST00000376504 KDM5DQ9BY66 1539 aa47.26■■■■■ 5.16
PTF1A-201ENST00000376504 MROH1Q8NDA8 1641 aa47.26■■■■■ 5.16
PTF1A-201ENST00000376504 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP47.22■■■■■ 5.15
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PTF1A-201ENST00000376504 PZPP20742 1482 aa47.19■■■■■ 5.15
PTF1A-201ENST00000376504 NUP155O75694 1391 aa47.19■■■■■ 5.14
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PTF1A-201ENST00000376504 VWDEQ8N2E2 1590 aa47.14■■■■■ 5.14
PTF1A-201ENST00000376504 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP47.14■■■■■ 5.14
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PTF1A-201ENST00000376504 CEP152O94986 1710 aa47.01■■■■■ 5.12
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PTF1A-201ENST00000376504 KANK1Q14678 1352 aa47.01■■■■■ 5.12
PTF1A-201ENST00000376504 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP47■■■■■ 5.12
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PTF1A-201ENST00000376504 TET3O43151 1660 aa46.95■■■■■ 5.11
PTF1A-201ENST00000376504 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP46.94■■■■■ 5.1
PTF1A-201ENST00000376504 ABCC3O15438 1527 aa46.93■■■■■ 5.1
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PTF1A-201ENST00000376504 MLECQ14165 292 aa46.87■■■■■ 5.09
PTF1A-201ENST00000376504 E9PCH4 1651 aa46.85■■■■■ 5.09
PTF1A-201ENST00000376504 PPP6R1Q9UPN7 881 aa46.84■■■■■ 5.09
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PTF1A-201ENST00000376504 EFCAB6Q5THR3 1501 aa46.83■■■■■ 5.09
PTF1A-201ENST00000376504 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa46.83■■■■■ 5.09
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PTF1A-201ENST00000376504 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa46.68■■■■■ 5.06
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PTF1A-201ENST00000376504 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa46.66■■■■■ 5.06
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PTF1A-201ENST00000376504 PLA2R1Q13018 1463 aa46.62■■■■■ 5.05
PTF1A-201ENST00000376504 MROH2AA6NES4 1674 aa46.61■■■■■ 5.05
PTF1A-201ENST00000376504 ADAMTSL3P82987 1691 aa46.61■■■■■ 5.05
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PTF1A-201ENST00000376504 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP46.57■■■■■ 5.05
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PTF1A-201ENST00000376504 MADDQ8WXG6 1647 aa46.56■■■■■ 5.04
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PTF1A-201ENST00000376504 ZMYM3Q14202 1370 aa46.51■■■■■ 5.04
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PTF1A-201ENST00000376504 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP46.46■■■■■ 5.03
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PTF1A-201ENST00000376504 ERVK-7P63135 1459 aa46.42■■■■■ 5.02
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PTF1A-201ENST00000376504 CLTCL1P53675 1640 aa46.4■■■■■ 5.02
PTF1A-201ENST00000376504 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa46.4■■■■■ 5.02
PTF1A-201ENST00000376504 CCDC144AA2RUR9 1427 aa46.39■■■■■ 5.02
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PTF1A-201ENST00000376504 PIK3C2BO00750 1634 aa46.33■■■■■ 5.01
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PTF1A-201ENST00000376504 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa46.16■■■■■ 4.98
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PTF1A-201ENST00000376504 TONSLQ96HA7 1378 aa46.16■■■■■ 4.98
PTF1A-201ENST00000376504 PTPRMP28827 1452 aa46.14■■■■■ 4.98
PTF1A-201ENST00000376504 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa46.14■■■■■ 4.98
PTF1A-201ENST00000376504 IDI1Q13907 227 aa46.13■■■■■ 4.98
PTF1A-201ENST00000376504 NEURL4Q96JN8 1562 aa46.13■■■■■ 4.98
PTF1A-201ENST00000376504 PLPPR3Q6T4P5 718 aa46.12■■■■■ 4.97
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PTF1A-201ENST00000376504 DCAF11Q8TEB1 546 aa45.85■■■■■ 4.93
PTF1A-201ENST00000376504 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP45.83■■■■■ 4.93
PTF1A-201ENST00000376504 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP45.82■■■■■ 4.93
PTF1A-201ENST00000376504 STAG3Q9UJ98 1225 aa45.82■■■■■ 4.93
PTF1A-201ENST00000376504 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP45.82■■■■■ 4.93
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PTF1A-201ENST00000376504 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa45.79■■■■■ 4.92
PTF1A-201ENST00000376504 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa45.78■■■■■ 4.92
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