RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375865.6

CSNK2B-201, Transcript of casein kinase 2 beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene CSNK2B, Length 908 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2B-201ENST00000375865 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.89■■□□□ 1.25
CSNK2B-201ENST00000375865 PKD2Q13563 968 aa22.88■■□□□ 1.25
CSNK2B-201ENST00000375865 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.86■■□□□ 1.25
CSNK2B-201ENST00000375865 PZPP20742 1482 aa22.85■■□□□ 1.25
CSNK2B-201ENST00000375865 MAP3K1Q13233 1512 aa22.84■■□□□ 1.25
CSNK2B-201ENST00000375865 TSPY4P0CV99 314 aa22.83■■□□□ 1.25
CSNK2B-201ENST00000375865 TSPY10P0CW01 314 aa22.83■■□□□ 1.25
CSNK2B-201ENST00000375865 TNRQ92752 1358 aa22.83■■□□□ 1.25
CSNK2B-201ENST00000375865 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.83■■□□□ 1.25
CSNK2B-201ENST00000375865 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.82■■□□□ 1.24
CSNK2B-201ENST00000375865 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.82■■□□□ 1.24
CSNK2B-201ENST00000375865 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CSNK2B-201ENST00000375865 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.79■■□□□ 1.24
CSNK2B-201ENST00000375865 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.79■■□□□ 1.24
CSNK2B-201ENST00000375865 MIA2Q96PC5 1412 aa22.79■■□□□ 1.24
CSNK2B-201ENST00000375865 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.78■■□□□ 1.24
CSNK2B-201ENST00000375865 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.75■■□□□ 1.23
CSNK2B-201ENST00000375865 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
CSNK2B-201ENST00000375865 ABCC3O15438 1527 aa22.73■■□□□ 1.23
CSNK2B-201ENST00000375865 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.73■■□□□ 1.23
CSNK2B-201ENST00000375865 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CSNK2B-201ENST00000375865 ILDR2Q71H61 639 aa22.72■■□□□ 1.23
CSNK2B-201ENST00000375865 ABCC5O15440 1437 aa22.71■■□□□ 1.23
CSNK2B-201ENST00000375865 NLRP1Q9C000 1473 aa22.7■■□□□ 1.22
CSNK2B-201ENST00000375865 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.68■■□□□ 1.22
CSNK2B-201ENST00000375865 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CSNK2B-201ENST00000375865 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.67■■□□□ 1.22
CSNK2B-201ENST00000375865 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.66■■□□□ 1.22
CSNK2B-201ENST00000375865 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.66■■□□□ 1.22
CSNK2B-201ENST00000375865 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK2B-201ENST00000375865 MED14O60244 1454 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK2B-201ENST00000375865 ERVK-7P63135 1459 aa22.65■■□□□ 1.22
CSNK2B-201ENST00000375865 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CSNK2B-201ENST00000375865 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.63■■□□□ 1.21
CSNK2B-201ENST00000375865 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.63■■□□□ 1.21
CSNK2B-201ENST00000375865 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.63■■□□□ 1.21
CSNK2B-201ENST00000375865 KIF15Q9NS87 1388 aa22.63■■□□□ 1.21
CSNK2B-201ENST00000375865 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.62■■□□□ 1.21
CSNK2B-201ENST00000375865 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CSNK2B-201ENST00000375865 DAPK1P53355 1430 aa22.59■■□□□ 1.21
CSNK2B-201ENST00000375865 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.59■■□□□ 1.21
CSNK2B-201ENST00000375865 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.58■■□□□ 1.21
CSNK2B-201ENST00000375865 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
CSNK2B-201ENST00000375865 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.57■■□□□ 1.2
CSNK2B-201ENST00000375865 DEPDC5O75140 1603 aa22.57■■□□□ 1.2
CSNK2B-201ENST00000375865 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CSNK2B-201ENST00000375865 CPS1P31327 1500 aa22.57■■□□□ 1.2
CSNK2B-201ENST00000375865 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CSNK2B-201ENST00000375865 ERBINQ96RT1 1412 aa22.57■■□□□ 1.2
CSNK2B-201ENST00000375865 LTKP29376 864 aa22.55■■□□□ 1.2
CSNK2B-201ENST00000375865 ALKQ9UM73 1620 aa22.55■■□□□ 1.2
CSNK2B-201ENST00000375865 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.53■■□□□ 1.2
CSNK2B-201ENST00000375865 CEP152O94986 1710 aa22.52■■□□□ 1.2
CSNK2B-201ENST00000375865 APLP2Q06481 763 aa22.52■■□□□ 1.2
CSNK2B-201ENST00000375865 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.52■■□□□ 1.2
CSNK2B-201ENST00000375865 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.52■■□□□ 1.2
CSNK2B-201ENST00000375865 HSPA1LP34931 641 aa22.51■■□□□ 1.19
CSNK2B-201ENST00000375865 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.194e-9■■■□□ 14.6
CSNK2B-201ENST00000375865 PIP4K2BP78356 416 aa22.48■■□□□ 1.19
CSNK2B-201ENST00000375865 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.48■■□□□ 1.19
CSNK2B-201ENST00000375865 SLIT1O75093 1534 aa22.47■■□□□ 1.19
CSNK2B-201ENST00000375865 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.47■■□□□ 1.19
CSNK2B-201ENST00000375865 IQGAP1P46940 1657 aa22.47■■□□□ 1.19
CSNK2B-201ENST00000375865 SOCS7O14512 581 aa22.47■■□□□ 1.19
CSNK2B-201ENST00000375865 TOM1O60784 492 aa22.47■■□□□ 1.19
CSNK2B-201ENST00000375865 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.47■■□□□ 1.19
CSNK2B-201ENST00000375865 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.46■■□□□ 1.19
CSNK2B-201ENST00000375865 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.46■■□□□ 1.19
CSNK2B-201ENST00000375865 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CSNK2B-201ENST00000375865 IDI1Q13907 227 aa22.45■■□□□ 1.18
CSNK2B-201ENST00000375865 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.45■■□□□ 1.18
CSNK2B-201ENST00000375865 ADGRL2O95490 1459 aa22.43■■□□□ 1.18
CSNK2B-201ENST00000375865 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.42■■□□□ 1.18
CSNK2B-201ENST00000375865 NOS1P29475 1434 aa22.41■■□□□ 1.18
CSNK2B-201ENST00000375865 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CSNK2B-201ENST00000375865 KANK1Q14678 1352 aa22.39■■□□□ 1.18
CSNK2B-201ENST00000375865 PIK3C2BO00750 1634 aa22.39■■□□□ 1.17
CSNK2B-201ENST00000375865 SYNMO15061 1565 aa22.38■■□□□ 1.17
CSNK2B-201ENST00000375865 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CSNK2B-201ENST00000375865 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CSNK2B-201ENST00000375865 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.35■■□□□ 1.17
CSNK2B-201ENST00000375865 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.33■■□□□ 1.17
CSNK2B-201ENST00000375865 EID1Q9Y6B2 187 aa22.33■■□□□ 1.17
CSNK2B-201ENST00000375865 TET3O43151 1660 aa22.32■■□□□ 1.16
CSNK2B-201ENST00000375865 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CSNK2B-201ENST00000375865 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.29■■□□□ 1.16
CSNK2B-201ENST00000375865 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.28■■□□□ 1.16
CSNK2B-201ENST00000375865 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.28■■□□□ 1.16
CSNK2B-201ENST00000375865 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CSNK2B-201ENST00000375865 KCNA6P17658 529 aa22.26■■□□□ 1.15
CSNK2B-201ENST00000375865 ADGRB3O60242 1522 aa22.26■■□□□ 1.15
CSNK2B-201ENST00000375865 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CSNK2B-201ENST00000375865 TMEM94Q12767 1356 aa22.25■■□□□ 1.15
CSNK2B-201ENST00000375865 ZFYVE9O95405 1425 aa22.24■■□□□ 1.15
CSNK2B-201ENST00000375865 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CSNK2B-201ENST00000375865 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CSNK2B-201ENST00000375865 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CSNK2B-201ENST00000375865 ROCK1Q13464 1354 aa22.21■■□□□ 1.15
CSNK2B-201ENST00000375865 UNC13BO14795 1591 aa22.18■■□□□ 1.14
CSNK2B-201ENST00000375865 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.18■■□□□ 1.14
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