RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 OSCARQ8IYS5 282 aa26.28■■□□□ 1.8
NISCH-201ENST00000345716 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
NISCH-201ENST00000345716 PTMAP06454 111 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
NISCH-201ENST00000345716 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
NISCH-201ENST00000345716 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.26■■□□□ 1.79
NISCH-201ENST00000345716 CFAP44Q96MT7 982 aa26.25■■□□□ 1.79
NISCH-201ENST00000345716 FGD1P98174 961 aa26.24■■□□□ 1.79
NISCH-201ENST00000345716 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.24■■□□□ 1.79
NISCH-201ENST00000345716 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.24■■□□□ 1.79
NISCH-201ENST00000345716 EVC2Q86UK5 1308 aa26.24■■□□□ 1.79
NISCH-201ENST00000345716 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
NISCH-201ENST00000345716 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
NISCH-201ENST00000345716 NUTM2FA1L443 756 aa26.23■■□□□ 1.79
NISCH-201ENST00000345716 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.22■■□□□ 1.79
NISCH-201ENST00000345716 MCCP23508 829 aa26.22■■□□□ 1.79
NISCH-201ENST00000345716 STK31Q9BXU1 1019 aa26.19■■□□□ 1.78
NISCH-201ENST00000345716 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa26.18■■□□□ 1.78
NISCH-201ENST00000345716 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.18■■□□□ 1.78
NISCH-201ENST00000345716 PLIN1O60240 522 aa26.18■■□□□ 1.78
NISCH-201ENST00000345716 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.18■■□□□ 1.78
NISCH-201ENST00000345716 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
NISCH-201ENST00000345716 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.17■■□□□ 1.78
NISCH-201ENST00000345716 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.17■■□□□ 1.78
NISCH-201ENST00000345716 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
NISCH-201ENST00000345716 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.16■■□□□ 1.78
NISCH-201ENST00000345716 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.15■■□□□ 1.78
NISCH-201ENST00000345716 E9PSI1 815 aa26.15■■□□□ 1.78
NISCH-201ENST00000345716 AMPHP49418 695 aa26.15■■□□□ 1.78
NISCH-201ENST00000345716 TIAM1Q13009 1591 aa26.14■■□□□ 1.78
NISCH-201ENST00000345716 APAF1O14727 1248 aa26.14■■□□□ 1.78
NISCH-201ENST00000345716 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.13■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 IFT140Q96RY7 1462 aa26.13■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 STAC3Q96MF2 364 aa26.12■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 TAOK2Q9UL54 1235 aa26.12■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 SYNJ2O15056 1496 aa26.12■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 NPHP1O15259 732 aa26.12■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 MIA2Q96PC5 1412 aa26.12■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.11■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.1■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 PLCB2Q00722 1185 aa26.09■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 AFAP1Q8N556 730 aa26.09■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.09■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.09■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 CRBNQ96SW2 442 aa26.08■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.08■■□□□ 1.77
NISCH-201ENST00000345716 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.08■■□□□ 1.76
NISCH-201ENST00000345716 COG3Q96JB2 828 aa26.07■■□□□ 1.76
NISCH-201ENST00000345716 HFM1A2PYH4 1435 aa26.07■■□□□ 1.76
NISCH-201ENST00000345716 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
NISCH-201ENST00000345716 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa26.06■■□□□ 1.76
NISCH-201ENST00000345716 HMMRO75330 724 aa26.05■■□□□ 1.76
NISCH-201ENST00000345716 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
NISCH-201ENST00000345716 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
NISCH-201ENST00000345716 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
NISCH-201ENST00000345716 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa26.02■■□□□ 1.76
NISCH-201ENST00000345716 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
NISCH-201ENST00000345716 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.01■■□□□ 1.75
NISCH-201ENST00000345716 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.01■■□□□ 1.75
NISCH-201ENST00000345716 COG6Q9Y2V7 657 aa26■■□□□ 1.75
NISCH-201ENST00000345716 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.99■■□□□ 1.75
NISCH-201ENST00000345716 PDE4AP27815 886 aa25.99■■□□□ 1.75
NISCH-201ENST00000345716 HECW1Q76N89 1606 aa25.99■■□□□ 1.75
NISCH-201ENST00000345716 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.99■■□□□ 1.75
NISCH-201ENST00000345716 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.99■■□□□ 1.75
NISCH-201ENST00000345716 NGEFQ8N5V2 710 aa25.99■■□□□ 1.75
NISCH-201ENST00000345716 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
NISCH-201ENST00000345716 GBP4Q96PP9 640 aa25.98■■□□□ 1.75
NISCH-201ENST00000345716 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
NISCH-201ENST00000345716 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.97■■□□□ 1.75
NISCH-201ENST00000345716 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.97■■□□□ 1.75
NISCH-201ENST00000345716 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
NISCH-201ENST00000345716 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.94■■□□□ 1.74
NISCH-201ENST00000345716 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.94■■□□□ 1.74
NISCH-201ENST00000345716 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
NISCH-201ENST00000345716 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
NISCH-201ENST00000345716 FAM161AQ3B820 660 aa25.93■■□□□ 1.74
NISCH-201ENST00000345716 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.93■■□□□ 1.74
NISCH-201ENST00000345716 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.746e-7■■□□□ 12.5
NISCH-201ENST00000345716 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.93■■□□□ 1.74
NISCH-201ENST00000345716 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.93■■□□□ 1.74
NISCH-201ENST00000345716 RUNDC1Q96C34 613 aa25.92■■□□□ 1.74
NISCH-201ENST00000345716 DAPK1P53355 1430 aa25.92■■□□□ 1.74
NISCH-201ENST00000345716 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
NISCH-201ENST00000345716 RIPK4P57078 832 aa25.9■■□□□ 1.74
NISCH-201ENST00000345716 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
NISCH-201ENST00000345716 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
NISCH-201ENST00000345716 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
NISCH-201ENST00000345716 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.87■■□□□ 1.73
NISCH-201ENST00000345716 CABP2Q9NPB3 220 aa25.87■■□□□ 1.73
NISCH-201ENST00000345716 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.87■■□□□ 1.73
NISCH-201ENST00000345716 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.87■■□□□ 1.73
NISCH-201ENST00000345716 PTMSP20962 102 aa25.86■■□□□ 1.73
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