RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000310418.8

CLTB-201, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-201ENST00000310418 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.79■■■■□ 3.32
CLTB-201ENST00000310418 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.79■■■■□ 3.32
CLTB-201ENST00000310418 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.78■■■■□ 3.32
CLTB-201ENST00000310418 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.76■■■■□ 3.31
CLTB-201ENST00000310418 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.76■■■■□ 3.31
CLTB-201ENST00000310418 PLA2R1Q13018 1463 aa35.75■■■■□ 3.31
CLTB-201ENST00000310418 APLP2Q06481 763 aa35.73■■■■□ 3.31
CLTB-201ENST00000310418 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.72■■■■□ 3.31
CLTB-201ENST00000310418 PZPP20742 1482 aa35.72■■■■□ 3.31
CLTB-201ENST00000310418 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
CLTB-201ENST00000310418 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.71■■■■□ 3.31
CLTB-201ENST00000310418 PKD2Q13563 968 aa35.7■■■■□ 3.31
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CLTB-201ENST00000310418 TNRQ92752 1358 aa35.68■■■■□ 3.3
CLTB-201ENST00000310418 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
CLTB-201ENST00000310418 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
CLTB-201ENST00000310418 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
CLTB-201ENST00000310418 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.59■■■■□ 3.29
CLTB-201ENST00000310418 ABCC3O15438 1527 aa35.57■■■■□ 3.29
CLTB-201ENST00000310418 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
CLTB-201ENST00000310418 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.57■■■■□ 3.28
CLTB-201ENST00000310418 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
CLTB-201ENST00000310418 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.56■■■■□ 3.28
CLTB-201ENST00000310418 ABCC5O15440 1437 aa35.55■■■■□ 3.28
CLTB-201ENST00000310418 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.54■■■■□ 3.28
CLTB-201ENST00000310418 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.54■■■■□ 3.28
CLTB-201ENST00000310418 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.53■■■■□ 3.28
CLTB-201ENST00000310418 NLRP1Q9C000 1473 aa35.53■■■■□ 3.28
CLTB-201ENST00000310418 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.51■■■■□ 3.28
CLTB-201ENST00000310418 KIF15Q9NS87 1388 aa35.51■■■■□ 3.27
CLTB-201ENST00000310418 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
CLTB-201ENST00000310418 DAPK1P53355 1430 aa35.48■■■■□ 3.27
CLTB-201ENST00000310418 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.47■■■■□ 3.27
CLTB-201ENST00000310418 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
CLTB-201ENST00000310418 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.46■■■■□ 3.27
CLTB-201ENST00000310418 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.46■■■■□ 3.27
CLTB-201ENST00000310418 CEP152O94986 1710 aa35.46■■■■□ 3.27
CLTB-201ENST00000310418 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.45■■■■□ 3.27
CLTB-201ENST00000310418 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.45■■■■□ 3.27
CLTB-201ENST00000310418 ERBINQ96RT1 1412 aa35.44■■■■□ 3.26
CLTB-201ENST00000310418 ERVK-7P63135 1459 aa35.42■■■■□ 3.26
CLTB-201ENST00000310418 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.42■■■■□ 3.26
CLTB-201ENST00000310418 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
CLTB-201ENST00000310418 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.35■■■■□ 3.25
CLTB-201ENST00000310418 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.34■■■■□ 3.25
CLTB-201ENST00000310418 DEPDC5O75140 1603 aa35.32■■■■□ 3.25
CLTB-201ENST00000310418 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.25
CLTB-201ENST00000310418 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.32■■■■□ 3.24
CLTB-201ENST00000310418 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.31■■■■□ 3.24
CLTB-201ENST00000310418 MED14O60244 1454 aa35.3■■■■□ 3.24
CLTB-201ENST00000310418 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.3■■■■□ 3.24
CLTB-201ENST00000310418 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
CLTB-201ENST00000310418 KANK1Q14678 1352 aa35.26■■■■□ 3.24
CLTB-201ENST00000310418 CPS1P31327 1500 aa35.26■■■■□ 3.23
CLTB-201ENST00000310418 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.24■■■■□ 3.23
CLTB-201ENST00000310418 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
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CLTB-201ENST00000310418 IQGAP1P46940 1657 aa35.23■■■■□ 3.23
CLTB-201ENST00000310418 ADGRL2O95490 1459 aa35.21■■■■□ 3.23
CLTB-201ENST00000310418 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.17■■■■□ 3.22
CLTB-201ENST00000310418 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.15■■■■□ 3.22
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CLTB-201ENST00000310418 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.11■■■■□ 3.21
CLTB-201ENST00000310418 PIK3C2BO00750 1634 aa35.1■■■■□ 3.21
CLTB-201ENST00000310418 LTKP29376 864 aa35.08■■■■□ 3.21
CLTB-201ENST00000310418 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.08■■■■□ 3.21
CLTB-201ENST00000310418 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.07■■■■□ 3.21
CLTB-201ENST00000310418 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.07■■■■□ 3.21
CLTB-201ENST00000310418 TOM1O60784 492 aa35.06■■■■□ 3.2
CLTB-201ENST00000310418 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.04■■■■□ 3.2
CLTB-201ENST00000310418 EID1Q9Y6B2 187 aa35.04■■■■□ 3.2
CLTB-201ENST00000310418 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.04■■■■□ 3.2
CLTB-201ENST00000310418 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
CLTB-201ENST00000310418 SYNMO15061 1565 aa35.02■■■■□ 3.2
CLTB-201ENST00000310418 PIP4K2BP78356 416 aa35.02■■■■□ 3.2
CLTB-201ENST00000310418 IDI1Q13907 227 aa35.02■■■■□ 3.2
CLTB-201ENST00000310418 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.01■■■■□ 3.2
CLTB-201ENST00000310418 NOS1P29475 1434 aa35.01■■■■□ 3.2
CLTB-201ENST00000310418 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.19
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CLTB-201ENST00000310418 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
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CLTB-201ENST00000310418 HSPA1LP34931 641 aa34.92■■■■□ 3.18
CLTB-201ENST00000310418 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.92■■■■□ 3.18
CLTB-201ENST00000310418 ADGRB3O60242 1522 aa34.91■■■■□ 3.18
CLTB-201ENST00000310418 TET3O43151 1660 aa34.91■■■■□ 3.18
CLTB-201ENST00000310418 ALKQ9UM73 1620 aa34.91■■■■□ 3.18
CLTB-201ENST00000310418 ROCK1Q13464 1354 aa34.9■■■■□ 3.18
CLTB-201ENST00000310418 UNC13BO14795 1591 aa34.9■■■■□ 3.18
CLTB-201ENST00000310418 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
CLTB-201ENST00000310418 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.85■■■■□ 3.17
CLTB-201ENST00000310418 ITGAEP38570 1179 aa34.82■■■■□ 3.16
CLTB-201ENST00000310418 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.77■■■■□ 3.16
CLTB-201ENST00000310418 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.76■■■■□ 3.15
CLTB-201ENST00000310418 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.15
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CLTB-201ENST00000310418 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.74■■■■□ 3.15
CLTB-201ENST00000310418 KCNA6P17658 529 aa34.72■■■■□ 3.15
CLTB-201ENST00000310418 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.72■■■■□ 3.15
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