RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 MADDQ8WXG6 1647 aa23.22■■□□□ 1.31
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TSNARE1-201ENST00000307180 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.21■■□□□ 1.31
TSNARE1-201ENST00000307180 ERBINQ96RT1 1412 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-201ENST00000307180 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-201ENST00000307180 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.18■■□□□ 1.3
TSNARE1-201ENST00000307180 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.18■■□□□ 1.3
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TSNARE1-201ENST00000307180 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
TSNARE1-201ENST00000307180 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
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TSNARE1-201ENST00000307180 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.12■■□□□ 1.29
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TSNARE1-201ENST00000307180 HFM1A2PYH4 1435 aa23.08■■□□□ 1.29
TSNARE1-201ENST00000307180 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.08■■□□□ 1.29
TSNARE1-201ENST00000307180 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.07■■□□□ 1.28
TSNARE1-201ENST00000307180 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.06■■□□□ 1.28
TSNARE1-201ENST00000307180 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.05■■□□□ 1.28
TSNARE1-201ENST00000307180 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.05■■□□□ 1.28
TSNARE1-201ENST00000307180 ZMYM3Q14202 1370 aa23.05■■□□□ 1.28
TSNARE1-201ENST00000307180 DEPDC5O75140 1603 aa23.05■■□□□ 1.28
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TSNARE1-201ENST00000307180 KANK1Q14678 1352 aa23.04■■□□□ 1.28
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TSNARE1-201ENST00000307180 CEP152O94986 1710 aa23.03■■□□□ 1.28
TSNARE1-201ENST00000307180 C3P01024 1663 aa23.02■■□□□ 1.27
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TSNARE1-201ENST00000307180 MROH2AA6NES4 1674 aa23■■□□□ 1.27
TSNARE1-201ENST00000307180 NUP155O75694 1391 aa22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-201ENST00000307180 UNC13BO14795 1591 aa22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-201ENST00000307180 TRIM52Q96A61 297 aa22.98■■□□□ 1.27
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TSNARE1-201ENST00000307180 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.97■■□□□ 1.27
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TSNARE1-201ENST00000307180 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-201ENST00000307180 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.94■■□□□ 1.26
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TSNARE1-201ENST00000307180 PZPP20742 1482 aa22.91■■□□□ 1.26
TSNARE1-201ENST00000307180 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.9■■□□□ 1.26
TSNARE1-201ENST00000307180 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.9■■□□□ 1.26
TSNARE1-201ENST00000307180 NPATQ14207 1427 aa22.88■■□□□ 1.25
TSNARE1-201ENST00000307180 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.86■■□□□ 1.25
TSNARE1-201ENST00000307180 TET3O43151 1660 aa22.86■■□□□ 1.25
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TSNARE1-201ENST00000307180 ERVK-7P63135 1459 aa22.83■■□□□ 1.24
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TSNARE1-201ENST00000307180 E9PCH4 1651 aa22.82■■□□□ 1.24
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TSNARE1-201ENST00000307180 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.77■■□□□ 1.24
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TSNARE1-201ENST00000307180 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.77■■□□□ 1.24
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TSNARE1-201ENST00000307180 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.72■■□□□ 1.23
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TSNARE1-201ENST00000307180 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TSNARE1-201ENST00000307180 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
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TSNARE1-201ENST00000307180 NLRP1Q9C000 1473 aa22.7■■□□□ 1.22
TSNARE1-201ENST00000307180 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1-201ENST00000307180 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1-201ENST00000307180 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.69■■□□□ 1.22
TSNARE1-201ENST00000307180 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.68■■□□□ 1.22
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TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.67■■□□□ 1.22
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TSNARE1-201ENST00000307180 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.6■■□□□ 1.21
TSNARE1-201ENST00000307180 CLTCL1P53675 1640 aa22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1-201ENST00000307180 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-201ENST00000307180 ADGRB3O60242 1522 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-201ENST00000307180 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-201ENST00000307180 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-201ENST00000307180 STRCQ7RTU9 1775 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-201ENST00000307180 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.52■■□□□ 1.2
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