RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297533.8

TMUB1-201, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMUB1, Length 1,353 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1-201ENST00000297533 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.13■■■■□ 3.37
TMUB1-201ENST00000297533 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
TMUB1-201ENST00000297533 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.11■■■■□ 3.37
TMUB1-201ENST00000297533 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
TMUB1-201ENST00000297533 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
TMUB1-201ENST00000297533 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.1■■■■□ 3.37
TMUB1-201ENST00000297533 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.07■■■■□ 3.36
TMUB1-201ENST00000297533 ABCC5O15440 1437 aa36.07■■■■□ 3.36
TMUB1-201ENST00000297533 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.06■■■■□ 3.36
TMUB1-201ENST00000297533 DAPK1P53355 1430 aa36.04■■■■□ 3.36
TMUB1-201ENST00000297533 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.04■■■■□ 3.36
TMUB1-201ENST00000297533 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
TMUB1-201ENST00000297533 PZPP20742 1482 aa36.02■■■■□ 3.36
TMUB1-201ENST00000297533 NCOA1Q15788 1441 aa36.02■■■■□ 3.36
TMUB1-201ENST00000297533 KIF15Q9NS87 1388 aa36■■■■□ 3.35
TMUB1-201ENST00000297533 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36■■■■□ 3.35
TMUB1-201ENST00000297533 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
TMUB1-201ENST00000297533 PTPRTO14522 1441 aa35.97■■■■□ 3.35
TMUB1-201ENST00000297533 FBXO41Q8TF61 875 aa35.96■■■■□ 3.35
TMUB1-201ENST00000297533 ERBINQ96RT1 1412 aa35.95■■■■□ 3.35
TMUB1-201ENST00000297533 ABCC3O15438 1527 aa35.94■■■■□ 3.34
TMUB1-201ENST00000297533 TNRQ92752 1358 aa35.93■■■■□ 3.34
TMUB1-201ENST00000297533 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.92■■■■□ 3.34
TMUB1-201ENST00000297533 PLA2R1Q13018 1463 aa35.92■■■■□ 3.34
TMUB1-201ENST00000297533 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.9■■■■□ 3.34
TMUB1-201ENST00000297533 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.9■■■■□ 3.34
TMUB1-201ENST00000297533 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
TMUB1-201ENST00000297533 DEPDC5O75140 1603 aa35.88■■■■□ 3.33
TMUB1-201ENST00000297533 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
TMUB1-201ENST00000297533 CEP152O94986 1710 aa35.87■■■■□ 3.33
TMUB1-201ENST00000297533 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
TMUB1-201ENST00000297533 CERKQ8TCT0 537 aa35.85■■■■□ 3.33
TMUB1-201ENST00000297533 NLRP1Q9C000 1473 aa35.82■■■■□ 3.32
TMUB1-201ENST00000297533 PKD2Q13563 968 aa35.82■■■■□ 3.32
TMUB1-201ENST00000297533 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.82■■■■□ 3.32
TMUB1-201ENST00000297533 ADGRL2O95490 1459 aa35.8■■■■□ 3.32
TMUB1-201ENST00000297533 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.78■■■■□ 3.32
TMUB1-201ENST00000297533 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.78■■■■□ 3.32
TMUB1-201ENST00000297533 ERVK-7P63135 1459 aa35.75■■■■□ 3.31
TMUB1-201ENST00000297533 KANK1Q14678 1352 aa35.74■■■■□ 3.31
TMUB1-201ENST00000297533 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.71■■■■□ 3.31
TMUB1-201ENST00000297533 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.7■■■■□ 3.31
TMUB1-201ENST00000297533 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.7■■■■□ 3.31
TMUB1-201ENST00000297533 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
TMUB1-201ENST00000297533 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.69■■■■□ 3.3
TMUB1-201ENST00000297533 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
TMUB1-201ENST00000297533 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.66■■■■□ 3.3
TMUB1-201ENST00000297533 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.63■■■■□ 3.29
TMUB1-201ENST00000297533 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
TMUB1-201ENST00000297533 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.63■■■■□ 3.29
TMUB1-201ENST00000297533 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.61■■■■□ 3.292e-9■■□□□ 11.5
TMUB1-201ENST00000297533 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.61■■■■□ 3.29
TMUB1-201ENST00000297533 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.59■■■■□ 3.29
TMUB1-201ENST00000297533 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.57■■■■□ 3.29
TMUB1-201ENST00000297533 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
TMUB1-201ENST00000297533 ROCK1Q13464 1354 aa35.55■■■■□ 3.28
TMUB1-201ENST00000297533 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
TMUB1-201ENST00000297533 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.54■■■■□ 3.28
TMUB1-201ENST00000297533 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.53■■■■□ 3.28
TMUB1-201ENST00000297533 UNC13BO14795 1591 aa35.51■■■■□ 3.28
TMUB1-201ENST00000297533 MED14O60244 1454 aa35.49■■■■□ 3.27
TMUB1-201ENST00000297533 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
TMUB1-201ENST00000297533 IQGAP1P46940 1657 aa35.44■■■■□ 3.26
TMUB1-201ENST00000297533 PIK3C2BO00750 1634 aa35.43■■■■□ 3.26
TMUB1-201ENST00000297533 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
TMUB1-201ENST00000297533 TET3O43151 1660 aa35.43■■■■□ 3.26
TMUB1-201ENST00000297533 SYNMO15061 1565 aa35.42■■■■□ 3.26
TMUB1-201ENST00000297533 ITGAEP38570 1179 aa35.42■■■■□ 3.26
TMUB1-201ENST00000297533 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
TMUB1-201ENST00000297533 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.4■■■■□ 3.26
TMUB1-201ENST00000297533 NOS1P29475 1434 aa35.39■■■■□ 3.26
TMUB1-201ENST00000297533 SLIT1O75093 1534 aa35.39■■■■□ 3.26
TMUB1-201ENST00000297533 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
TMUB1-201ENST00000297533 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
TMUB1-201ENST00000297533 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.38■■■■□ 3.25
TMUB1-201ENST00000297533 CPS1P31327 1500 aa35.37■■■■□ 3.25
TMUB1-201ENST00000297533 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.36■■■■□ 3.25
TMUB1-201ENST00000297533 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.34■■■■□ 3.25
TMUB1-201ENST00000297533 IDI1Q13907 227 aa35.32■■■■□ 3.24
TMUB1-201ENST00000297533 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.3■■■■□ 3.24
TMUB1-201ENST00000297533 EID1Q9Y6B2 187 aa35.3■■■■□ 3.24
TMUB1-201ENST00000297533 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.3■■■■□ 3.24
TMUB1-201ENST00000297533 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.29■■■■□ 3.24
TMUB1-201ENST00000297533 ADGRB3O60242 1522 aa35.28■■■■□ 3.24
TMUB1-201ENST00000297533 E9PCH4 1651 aa35.28■■■■□ 3.24
TMUB1-201ENST00000297533 LTKP29376 864 aa35.25■■■■□ 3.23
TMUB1-201ENST00000297533 NUP155O75694 1391 aa35.23■■■■□ 3.23
TMUB1-201ENST00000297533 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.22■■■■□ 3.23
TMUB1-201ENST00000297533 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.2■■■■□ 3.23
TMUB1-201ENST00000297533 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.19■■■■□ 3.22
TMUB1-201ENST00000297533 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.1■■■■□ 3.21
TMUB1-201ENST00000297533 NAIPQ13075 1403 aa35.09■■■■□ 3.21
TMUB1-201ENST00000297533 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.07■■■■□ 3.21
TMUB1-201ENST00000297533 TOM1O60784 492 aa35.07■■■■□ 3.2
TMUB1-201ENST00000297533 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.04■■■■□ 3.2
TMUB1-201ENST00000297533 ZFYVE9O95405 1425 aa35.04■■■■□ 3.2
TMUB1-201ENST00000297533 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
TMUB1-201ENST00000297533 HFM1A2PYH4 1435 aa35.03■■■■□ 3.2
TMUB1-201ENST00000297533 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.01■■■■□ 3.2
TMUB1-201ENST00000297533 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms