RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258083.2

PRADC1-201, Transcript of protease associated domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRADC1, Length 1,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1-201ENST00000258083 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
PRADC1-201ENST00000258083 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
PRADC1-201ENST00000258083 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
PRADC1-201ENST00000258083 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.59■■■■□ 3.13
PRADC1-201ENST00000258083 STRCQ7RTU9 1775 aa34.56■■■■□ 3.12
PRADC1-201ENST00000258083 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa34.55■■■■□ 3.12
PRADC1-201ENST00000258083 KIF15Q9NS87 1388 aa34.55■■■■□ 3.12
PRADC1-201ENST00000258083 PZPP20742 1482 aa34.54■■■■□ 3.12
PRADC1-201ENST00000258083 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
PRADC1-201ENST00000258083 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.52■■■■□ 3.12
PRADC1-201ENST00000258083 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.51■■■■□ 3.11
PRADC1-201ENST00000258083 ERBINQ96RT1 1412 aa34.5■■■■□ 3.11
PRADC1-201ENST00000258083 NCOA1Q15788 1441 aa34.49■■■■□ 3.11
PRADC1-201ENST00000258083 DMRT2Q9Y5R5 561 aa34.49■■■■□ 3.11
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
PRADC1-201ENST00000258083 ABCC3O15438 1527 aa34.47■■■■□ 3.11
PRADC1-201ENST00000258083 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.47■■■■□ 3.11
PRADC1-201ENST00000258083 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
PRADC1-201ENST00000258083 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
PRADC1-201ENST00000258083 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
PRADC1-201ENST00000258083 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.44■■■■□ 3.1
PRADC1-201ENST00000258083 PTPRTO14522 1441 aa34.44■■■■□ 3.1
PRADC1-201ENST00000258083 ADGRL2O95490 1459 aa34.43■■■■□ 3.1
PRADC1-201ENST00000258083 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.43■■■■□ 3.1
PRADC1-201ENST00000258083 TNRQ92752 1358 aa34.42■■■■□ 3.1
PRADC1-201ENST00000258083 A2ML1A8K2U0 1454 aa34.4■■■■□ 3.1
PRADC1-201ENST00000258083 PLA2R1Q13018 1463 aa34.4■■■■□ 3.1
PRADC1-201ENST00000258083 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
PRADC1-201ENST00000258083 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
PRADC1-201ENST00000258083 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.39■■■■□ 3.1
PRADC1-201ENST00000258083 DEPDC5O75140 1603 aa34.35■■■■□ 3.09
PRADC1-201ENST00000258083 FBXO41Q8TF61 875 aa34.32■■■■□ 3.08
PRADC1-201ENST00000258083 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.32■■■■□ 3.08
PRADC1-201ENST00000258083 NLRP1Q9C000 1473 aa34.31■■■■□ 3.08
PRADC1-201ENST00000258083 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.3■■■■□ 3.08
PRADC1-201ENST00000258083 PKD2Q13563 968 aa34.29■■■■□ 3.08
PRADC1-201ENST00000258083 ERVK-7P63135 1459 aa34.28■■■■□ 3.08
PRADC1-201ENST00000258083 CEP152O94986 1710 aa34.28■■■■□ 3.08
PRADC1-201ENST00000258083 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa34.27■■■■□ 3.08
PRADC1-201ENST00000258083 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.26■■■■□ 3.08
PRADC1-201ENST00000258083 CERKQ8TCT0 537 aa34.26■■■■□ 3.08
PRADC1-201ENST00000258083 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.25■■■■□ 3.07
PRADC1-201ENST00000258083 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.23■■■■□ 3.07
PRADC1-201ENST00000258083 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.21■■■■□ 3.07
PRADC1-201ENST00000258083 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
PRADC1-201ENST00000258083 KANK1Q14678 1352 aa34.21■■■■□ 3.07
PRADC1-201ENST00000258083 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.2■■■■□ 3.07
PRADC1-201ENST00000258083 ROCK1Q13464 1354 aa34.2■■■■□ 3.07
PRADC1-201ENST00000258083 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.18■■■■□ 3.06
PRADC1-201ENST00000258083 LTBP4Q8N2S1 1624 aa34.16■■■■□ 3.06
PRADC1-201ENST00000258083 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
PRADC1-201ENST00000258083 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.11■■■■□ 3.05
PRADC1-201ENST00000258083 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
PRADC1-201ENST00000258083 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.07■■■■□ 3.04
PRADC1-201ENST00000258083 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.07■■■■□ 3.04
PRADC1-201ENST00000258083 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
PRADC1-201ENST00000258083 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
PRADC1-201ENST00000258083 MED14O60244 1454 aa34.05■■■■□ 3.04
PRADC1-201ENST00000258083 NOS1P29475 1434 aa34.03■■■■□ 3.04
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
PRADC1-201ENST00000258083 UNC13BO14795 1591 aa34.02■■■■□ 3.04
PRADC1-201ENST00000258083 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.01■■■■□ 3.04
PRADC1-201ENST00000258083 IQSEC2Q5JU85 1478 aa34.01■■■■□ 3.03
PRADC1-201ENST00000258083 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
PRADC1-201ENST00000258083 ITGAEP38570 1179 aa33.98■■■■□ 3.03
PRADC1-201ENST00000258083 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
PRADC1-201ENST00000258083 ARHGAP23Q9P227 1491 aa33.96■■■■□ 3.03
PRADC1-201ENST00000258083 SYNMO15061 1565 aa33.96■■■■□ 3.03
PRADC1-201ENST00000258083 SLIT1O75093 1534 aa33.95■■■■□ 3.03
PRADC1-201ENST00000258083 TET3O43151 1660 aa33.94■■■■□ 3.02
PRADC1-201ENST00000258083 PIK3C2BO00750 1634 aa33.93■■■■□ 3.02
PRADC1-201ENST00000258083 IDI1Q13907 227 aa33.92■■■■□ 3.02
PRADC1-201ENST00000258083 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
PRADC1-201ENST00000258083 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
PRADC1-201ENST00000258083 SLC52A1Q9NWF4 448 aa33.88■■■■□ 3.01
PRADC1-201ENST00000258083 IQGAP3Q86VI3 1631 aa33.87■■■■□ 3.01
PRADC1-201ENST00000258083 IQGAP1P46940 1657 aa33.87■■■■□ 3.01
PRADC1-201ENST00000258083 TMEM2Q9UHN6 1383 aa33.86■■■■□ 3.01
PRADC1-201ENST00000258083 LTKP29376 864 aa33.86■■■■□ 3.01
PRADC1-201ENST00000258083 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.86■■■■□ 3.01
PRADC1-201ENST00000258083 NUP155O75694 1391 aa33.83■■■■□ 3.01
PRADC1-201ENST00000258083 CPS1P31327 1500 aa33.81■■■■□ 3
PRADC1-201ENST00000258083 TXNDC2Q86VQ3 553 aa33.81■■■■□ 3
PRADC1-201ENST00000258083 ADGRB3O60242 1522 aa33.8■■■■□ 3
PRADC1-201ENST00000258083 NAIPQ13075 1403 aa33.79■■■■□ 3
PRADC1-201ENST00000258083 STAG3Q9UJ98 1225 aa33.79■■■■□ 3
PRADC1-201ENST00000258083 E9PCH4 1651 aa33.78■■■■□ 3
PRADC1-201ENST00000258083 EID1Q9Y6B2 187 aa33.77■■■■□ 3
PRADC1-201ENST00000258083 HFM1A2PYH4 1435 aa33.71■■■□□ 2.99
PRADC1-201ENST00000258083 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa33.67■■■□□ 2.98
PRADC1-201ENST00000258083 ZFYVE9O95405 1425 aa33.66■■■□□ 2.98
PRADC1-201ENST00000258083 STRCP1A6NGW2 1772 aa33.65■■■□□ 2.98
PRADC1-201ENST00000258083 UBAP1LF5GYI3 381 aa33.62■■■□□ 2.97
PRADC1-201ENST00000258083 LRRC7Q96NW7 1537 aa33.6■■■□□ 2.97
PRADC1-201ENST00000258083 RIMS2Q9UQ26 1411 aa33.57■■■□□ 2.96
PRADC1-201ENST00000258083 MYO5BQ9ULV0 1848 aa33.57■■■□□ 2.96
PRADC1-201ENST00000258083 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa33.54■■■□□ 2.96
PRADC1-201ENST00000258083 HDGFP51858 240 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
PRADC1-201ENST00000258083 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa33.52■■■□□ 2.96
PRADC1-201ENST00000258083 TOM1O60784 492 aa33.5■■■□□ 2.95
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