RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa12.67□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP12.67□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 TPM4P67936 248 aa12.66□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 APPP05067 770 aa12.65□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 PRDM2Q13029 1718 aa12.64□□□□□ -0.39
TTL-201ENST00000233336 SMARCA2P51531 1590 aa12.64□□□□□ -0.39
TTL-201ENST00000233336 SOX12O15370 315 aa12.63□□□□□ -0.39
TTL-201ENST00000233336 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
TTL-201ENST00000233336 NFKBIBQ15653 356 aa12.63□□□□□ -0.39
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TTL-201ENST00000233336 KIF16BQ96L93 1317 aa12.61□□□□□ -0.39
TTL-201ENST00000233336 HMMRO75330 724 aa12.61□□□□□ -0.39
TTL-201ENST00000233336 GPATCH3Q96I76 525 aa12.61□□□□□ -0.39
TTL-201ENST00000233336 FAM43AQ8N2R8 423 aa12.61□□□□□ -0.39
TTL-201ENST00000233336 BRPF3Q9ULD4 1205 aa12.61□□□□□ -0.39
TTL-201ENST00000233336 FHOD3Q2V2M9 1422 aa12.6□□□□□ -0.39
TTL-201ENST00000233336 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
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TTL-201ENST00000233336 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
TTL-201ENST00000233336 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
TTL-201ENST00000233336 LMOD2Q6P5Q4 547 aa12.58□□□□□ -0.39
TTL-201ENST00000233336 STK26Q9P289 416 aa12.58□□□□□ -0.4
TTL-201ENST00000233336 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa12.58□□□□□ -0.4
TTL-201ENST00000233336 SMARCA4P51532 1647 aa12.58□□□□□ -0.4
TTL-201ENST00000233336 BCL2L13Q9BXK5 485 aa12.57□□□□□ -0.4
TTL-201ENST00000233336 E9PSI1 815 aa12.57□□□□□ -0.4
TTL-201ENST00000233336 ANKRD45Q5TZF3 282 aa12.57□□□□□ -0.4
TTL-201ENST00000233336 CNTLNQ9NXG0 1405 aa12.57□□□□□ -0.4
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TTL-201ENST00000233336 COG6Q9Y2V7 657 aa12.57□□□□□ -0.4
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TTL-201ENST00000233336 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa12.55□□□□□ -0.4
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TTL-201ENST00000233336 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa12.55□□□□□ -0.4
TTL-201ENST00000233336 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
TTL-201ENST00000233336 SLC4A10Q6U841 1118 aa12.54□□□□□ -0.4
TTL-201ENST00000233336 ZNF592Q92610 1267 aa12.54□□□□□ -0.4
TTL-201ENST00000233336 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
TTL-201ENST00000233336 NASPP49321 788 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
TTL-201ENST00000233336 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa12.53□□□□□ -0.4
TTL-201ENST00000233336 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
TTL-201ENST00000233336 CCDC34Q96HJ3 373 aa12.53□□□□□ -0.4
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TTL-201ENST00000233336 TEX35Q5T0J7 233 aa12.52□□□□□ -0.41
TTL-201ENST00000233336 CCDC7Q96M83 1385 aa12.52□□□□□ -0.41
TTL-201ENST00000233336 KIF21BO75037 1637 aa12.51□□□□□ -0.41
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TTL-201ENST00000233336 H3BQV1 296 aa12.5□□□□□ -0.41
TTL-201ENST00000233336 IFFO2Q5TF58 517 aa12.5□□□□□ -0.41
TTL-201ENST00000233336 RILPL2Q969X0 211 aa12.5□□□□□ -0.41
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TTL-201ENST00000233336 TPM2P07951 284 aa12.5□□□□□ -0.41
TTL-201ENST00000233336 REC8O95072 547 aa12.5□□□□□ -0.41
TTL-201ENST00000233336 C22orf23Q9BZE7 217 aa12.5□□□□□ -0.41
TTL-201ENST00000233336 NPHP1O15259 732 aa12.5□□□□□ -0.41
TTL-201ENST00000233336 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
TTL-201ENST00000233336 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
TTL-201ENST00000233336 BECN2A8MW95 431 aa12.5□□□□□ -0.41
TTL-201ENST00000233336 CREBRFQ8IUR6 639 aa12.5□□□□□ -0.41
TTL-201ENST00000233336 GPS2Q13227 327 aa12.49□□□□□ -0.41
TTL-201ENST00000233336 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
TTL-201ENST00000233336 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
TTL-201ENST00000233336 TERF2IPQ9NYB0 399 aa12.49□□□□□ -0.41
TTL-201ENST00000233336 LMOD3Q0VAK6 560 aa12.49□□□□□ -0.41
TTL-201ENST00000233336 KIF3AQ9Y496 699 aa12.49□□□□□ -0.41
TTL-201ENST00000233336 WDR97A6NE52 1622 aa12.48□□□□□ -0.41
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TTL-201ENST00000233336 DDX19BQ9UMR2 479 aa12.47□□□□□ -0.41
TTL-201ENST00000233336 KIF7Q2M1P5 1343 aa12.47□□□□□ -0.41
TTL-201ENST00000233336 APAF1O14727 1248 aa12.47□□□□□ -0.41
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TTL-201ENST00000233336 WASHC2AQ641Q2 1341 aa12.45□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 HDAC5Q9UQL6 1122 aa12.44□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 UACAQ9BZF9 1416 aa12.44□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 CHMP4AQ9BY43 222 aa12.44□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 CCDC66A2RUB6 948 aa12.44□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 RASSF8Q8NHQ8 419 aa12.44□□□□□ -0.42
TTL-201ENST00000233336 IFT57Q9NWB7 429 aa12.44□□□□□ -0.42
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