RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 KIF15Q9NS87 1388 aa47.33■■■■■ 5.17
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INO80B-201ENST00000233331 FAM135AQ9P2D6 1515 aa47.29■■■■■ 5.16
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INO80B-201ENST00000233331 CHIC2Q9UKJ5 165 aa47.27■■■■■ 5.16
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INO80B-201ENST00000233331 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP46.94■■■■■ 5.11e-8■□□□□ 11.2
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INO80B-201ENST00000233331 A2ML1A8K2U0 1454 aa46.85■■■■■ 5.09
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INO80B-201ENST00000233331 DMRT2Q9Y5R5 561 aa46.76■■■■■ 5.08
INO80B-201ENST00000233331 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa46.75■■■■■ 5.07
INO80B-201ENST00000233331 NLRP1Q9C000 1473 aa46.75■■■■■ 5.07
INO80B-201ENST00000233331 LMTK2Q8IWU2 1503 aa46.74■■■■■ 5.07
INO80B-201ENST00000233331 PLA2R1Q13018 1463 aa46.72■■■■■ 5.07
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INO80B-201ENST00000233331 PTPRTO14522 1441 aa46.67■■■■■ 5.06
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INO80B-201ENST00000233331 UNC13BO14795 1591 aa46.64■■■■■ 5.06
INO80B-201ENST00000233331 UGGT1Q9NYU2 1555 aa46.62■■■■■ 5.05
INO80B-201ENST00000233331 EFCAB6Q5THR3 1501 aa46.62■■■■■ 5.05
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INO80B-201ENST00000233331 NOS1P29475 1434 aa46.42■■■■■ 5.02
INO80B-201ENST00000233331 NUP155O75694 1391 aa46.41■■■■■ 5.02
INO80B-201ENST00000233331 NEURL4Q96JN8 1562 aa46.4■■■■■ 5.02
INO80B-201ENST00000233331 PIK3C2BO00750 1634 aa46.39■■■■■ 5.02
INO80B-201ENST00000233331 NAIPQ13075 1403 aa46.39■■■■■ 5.02
INO80B-201ENST00000233331 ANKLE2Q86XL3 938 aa46.39■■■■■ 5.02
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INO80B-201ENST00000233331 LTBP4Q8N2S1 1624 aa46.27■■■■■ 5
INO80B-201ENST00000233331 FBXO41Q8TF61 875 aa46.26■■■■■ 5
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INO80B-201ENST00000233331 SLC52A1Q9NWF4 448 aa46.23■■■■■ 4.99
INO80B-201ENST00000233331 ARHGAP23Q9P227 1491 aa46.23■■■■■ 4.99
INO80B-201ENST00000233331 ADGRB3O60242 1522 aa46.22■■■■■ 4.99
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INO80B-201ENST00000233331 EID1Q9Y6B2 187 aa46.11■■■■■ 4.97
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INO80B-201ENST00000233331 CHGAP10645 457 aaKnown RBP45.99■■■■■ 4.95
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INO80B-201ENST00000233331 ZFYVE9O95405 1425 aa45.89■■■■■ 4.94
INO80B-201ENST00000233331 RIMS2Q9UQ26 1411 aa45.89■■■■■ 4.94
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INO80B-201ENST00000233331 STRCP1A6NGW2 1772 aa45.81■■■■■ 4.92
INO80B-201ENST00000233331 SETD5Q9C0A6 1442 aa45.81■■■■■ 4.92
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