RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221138.8

PPP2CB-201, Transcript of protein phosphatase 2 catalytic subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP2CB, Length 2,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2CB-201ENST00000221138 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.41■■■■■ 4.38
PPP2CB-201ENST00000221138 NEO1Q92859 1461 aa42.41■■■■■ 4.38
PPP2CB-201ENST00000221138 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa42.39■■■■■ 4.38
PPP2CB-201ENST00000221138 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.38■■■■■ 4.37
PPP2CB-201ENST00000221138 KIF7Q2M1P5 1343 aa42.37■■■■■ 4.37
PPP2CB-201ENST00000221138 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.36■■■■■ 4.37
PPP2CB-201ENST00000221138 TSPY4P0CV99 314 aa42.35■■■■■ 4.37
PPP2CB-201ENST00000221138 TSPY10P0CW01 314 aa42.35■■■■■ 4.37
PPP2CB-201ENST00000221138 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.31■■■■■ 4.36
PPP2CB-201ENST00000221138 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
PPP2CB-201ENST00000221138 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa42.29■■■■■ 4.36
PPP2CB-201ENST00000221138 KDM5CP41229 1560 aa42.29■■■■■ 4.36
PPP2CB-201ENST00000221138 AFAP1Q8N556 730 aa42.28■■■■■ 4.36
PPP2CB-201ENST00000221138 MAST1Q9Y2H9 1570 aa42.24■■■■■ 4.35
PPP2CB-201ENST00000221138 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.24■■■■■ 4.35
PPP2CB-201ENST00000221138 PKD2Q13563 968 aa42.23■■■■■ 4.35
PPP2CB-201ENST00000221138 ERICH6BQ5W0A0 696 aa42.23■■■■■ 4.35
PPP2CB-201ENST00000221138 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
PPP2CB-201ENST00000221138 CCDC184Q52MB2 194 aa42.22■■■■■ 4.35
PPP2CB-201ENST00000221138 RALGAPBQ86X10 1494 aa42.21■■■■■ 4.35
PPP2CB-201ENST00000221138 USP47Q96K76 1375 aa42.19■■■■■ 4.34
PPP2CB-201ENST00000221138 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.17■■■■■ 4.34
PPP2CB-201ENST00000221138 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.17■■■■■ 4.34
PPP2CB-201ENST00000221138 ZBED9Q6R2W3 1325 aa42.17■■■■■ 4.34
PPP2CB-201ENST00000221138 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
PPP2CB-201ENST00000221138 MRS2Q9HD23 443 aa42.15■■■■■ 4.34
PPP2CB-201ENST00000221138 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
PPP2CB-201ENST00000221138 RICTORQ6R327 1708 aa42.12■■■■■ 4.33
PPP2CB-201ENST00000221138 RAPGEF3O95398 923 aa42.12■■■■■ 4.33
PPP2CB-201ENST00000221138 NUP155O75694 1391 aa42.11■■■■■ 4.33
PPP2CB-201ENST00000221138 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.09■■■■■ 4.33
PPP2CB-201ENST00000221138 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa42.08■■■■■ 4.33
PPP2CB-201ENST00000221138 PLXNC1O60486 1568 aa42.08■■■■■ 4.33
PPP2CB-201ENST00000221138 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP42.08■■■■■ 4.33
PPP2CB-201ENST00000221138 ATP7AQ04656 1500 aa42.06■■■■■ 4.32
PPP2CB-201ENST00000221138 KIF15Q9NS87 1388 aa42.05■■■■■ 4.32
PPP2CB-201ENST00000221138 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
PPP2CB-201ENST00000221138 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa42.03■■■■■ 4.32
PPP2CB-201ENST00000221138 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.02■■■■■ 4.32
PPP2CB-201ENST00000221138 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.01■■■■■ 4.32
PPP2CB-201ENST00000221138 FAM9BQ8IZU0 186 aa42■■■■■ 4.31
PPP2CB-201ENST00000221138 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.98■■■■■ 4.31
PPP2CB-201ENST00000221138 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
PPP2CB-201ENST00000221138 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.97■■■■■ 4.31
PPP2CB-201ENST00000221138 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
PPP2CB-201ENST00000221138 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.92■■■■■ 4.3
PPP2CB-201ENST00000221138 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.91■■■■■ 4.3
PPP2CB-201ENST00000221138 UNC13BO14795 1591 aa41.91■■■■■ 4.3
PPP2CB-201ENST00000221138 ANP32EQ9BTT0 268 aa41.9■■■■■ 4.3
PPP2CB-201ENST00000221138 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.88■■■■■ 4.3
PPP2CB-201ENST00000221138 E9PCH4 1651 aa41.87■■■■■ 4.29
PPP2CB-201ENST00000221138 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
PPP2CB-201ENST00000221138 PPP4R2Q9NY27 417 aa41.86■■■■■ 4.29
PPP2CB-201ENST00000221138 ABCA6Q8N139 1617 aa41.83■■■■■ 4.29
PPP2CB-201ENST00000221138 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
PPP2CB-201ENST00000221138 CARD11Q9BXL7 1154 aa41.81■■■■■ 4.28
PPP2CB-201ENST00000221138 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
PPP2CB-201ENST00000221138 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa41.79■■■■■ 4.28
PPP2CB-201ENST00000221138 ERBINQ96RT1 1412 aa41.78■■■■■ 4.28
PPP2CB-201ENST00000221138 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
PPP2CB-201ENST00000221138 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.77■■■■■ 4.28
PPP2CB-201ENST00000221138 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.76■■■■■ 4.28
PPP2CB-201ENST00000221138 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.76■■■■■ 4.28
PPP2CB-201ENST00000221138 LAMC1P11047 1609 aa41.74■■■■■ 4.27
PPP2CB-201ENST00000221138 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.73■■■■■ 4.27
PPP2CB-201ENST00000221138 A2MP01023 1474 aa41.73■■■■■ 4.27
PPP2CB-201ENST00000221138 PRAG1Q86YV5 1406 aa41.68■■■■■ 4.26
PPP2CB-201ENST00000221138 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.67■■■■■ 4.26
PPP2CB-201ENST00000221138 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
PPP2CB-201ENST00000221138 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.64■■■■■ 4.26
PPP2CB-201ENST00000221138 POLR3GLQ9BT43 218 aa41.62■■■■■ 4.25
PPP2CB-201ENST00000221138 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa41.62■■■■■ 4.25
PPP2CB-201ENST00000221138 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
PPP2CB-201ENST00000221138 GPRASP1Q5JY77 1395 aa41.61■■■■■ 4.25
PPP2CB-201ENST00000221138 KIF3BO15066 747 aa41.6■■■■■ 4.25
PPP2CB-201ENST00000221138 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
PPP2CB-201ENST00000221138 ATP10AO60312 1499 aa41.6■■■■■ 4.25
PPP2CB-201ENST00000221138 PLA2R1Q13018 1463 aa41.6■■■■■ 4.25
PPP2CB-201ENST00000221138 NUDCQ9Y266 331 aa41.59■■■■■ 4.25
PPP2CB-201ENST00000221138 RNF123Q5XPI4 1314 aa41.59■■■■■ 4.25
PPP2CB-201ENST00000221138 FANCIQ9NVI1 1328 aa41.59■■■■■ 4.25
PPP2CB-201ENST00000221138 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
PPP2CB-201ENST00000221138 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.58■■■■■ 4.25
PPP2CB-201ENST00000221138 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.57■■■■■ 4.24
PPP2CB-201ENST00000221138 RALBP1Q15311 655 aa41.56■■■■■ 4.24
PPP2CB-201ENST00000221138 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.56■■■■■ 4.24
PPP2CB-201ENST00000221138 DEPDC5O75140 1603 aa41.55■■■■■ 4.24
PPP2CB-201ENST00000221138 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
PPP2CB-201ENST00000221138 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
PPP2CB-201ENST00000221138 REREQ9P2R6 1566 aa41.49■■■■■ 4.23
PPP2CB-201ENST00000221138 TMC1Q8TDI8 760 aa41.49■■■■■ 4.23
PPP2CB-201ENST00000221138 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
PPP2CB-201ENST00000221138 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.46■■■■■ 4.23
PPP2CB-201ENST00000221138 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.43■■■■■ 4.22
PPP2CB-201ENST00000221138 PARD3Q8TEW0 1356 aa41.41■■■■■ 4.22
PPP2CB-201ENST00000221138 GGT6Q6P531 493 aa41.39■■■■■ 4.22
PPP2CB-201ENST00000221138 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa41.38■■■■■ 4.21
PPP2CB-201ENST00000221138 AGLP35573 1532 aa41.38■■■■■ 4.21
PPP2CB-201ENST00000221138 KANK1Q14678 1352 aa41.37■■■■■ 4.21
PPP2CB-201ENST00000221138 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.36■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms