RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ttc37F8VPK0 1563 aa12.25□□□□□ -0.45
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa12.25□□□□□ -0.45
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Naip2Q9QUK4 1447 aa12.24□□□□□ -0.45
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Abcc5Q9R1X5 1436 aa12.24□□□□□ -0.45
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ipo4Q8VI75 1082 aa12.24□□□□□ -0.45
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Adcy10Q8C0T9 1614 aa12.23□□□□□ -0.45
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa12.23□□□□□ -0.45
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp777B9EKF4 885 aa12.23□□□□□ -0.45
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vps8Q0P5W1 1427 aa12.23□□□□□ -0.45
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cul7Q8VE73 1689 aa12.22□□□□□ -0.45
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mast1Q9R1L5 1570 aa12.22□□□□□ -0.45
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa12.21□□□□□ -0.45
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Taok2Q6ZQ29 1240 aa12.21□□□□□ -0.45
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.46
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Plch2A2AP18 1501 aa12.2□□□□□ -0.46
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fmn2Q9JL04 1578 aa12.2□□□□□ -0.46
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Abcc3B2RX12 1523 aa12.19□□□□□ -0.46
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf608Q56A10 1511 aa12.19□□□□□ -0.46
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Atp10aO54827 1508 aa12.19□□□□□ -0.46
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pprc1Q6NZN1 1644 aa12.18□□□□□ -0.46
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nsd2Q8BVE8 1365 aa12.18□□□□□ -0.46
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gtf3c5Q8R2T8 520 aa12.17□□□□□ -0.46
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 SphkapQ6NSW3 1687 aa12.16□□□□□ -0.46
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kdm2aP59997 1161 aa12.15□□□□□ -0.46
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Stra8P70278 393 aa12.14□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trappc8E9PWG2 1437 aa12.14□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Polr3glQ8R0C0 218 aa12.14□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa12.13□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa12.13□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 DaxxO35613 739 aa12.12□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kiaa0556Q8C753 1610 aa12.12□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rgl3Q3UYI5 709 aa12.12□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hecw2Q6I6G8 1578 aa12.12□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Depdc5P61460 1591 aa12.11□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa12.11□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Uggt2E9Q4X2 1504 aa12.11□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mphosph9A6H5Y1 991 aa12.11□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NgefQ8CHT1 710 aa12.1□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Irx6Q9ER75 438 aa12.09□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Map4P27546 1125 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NpatQ8BMA5 1420 aa12.09□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pak3Q61036 559 aa12.08□□□□□ -0.47
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa12.08□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Camsap2Q8C1B1 1461 aa12.08□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp644E9QA22 1323 aa12.08□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kdm5cP41230 1554 aa12.08□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 BccipQ9CWI3 316 aa12.08□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Map3k5O35099 1380 aa12.07□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 AampJ3QN89 436 aa12.06□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa12.06□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa12.06□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf710Q3U288 666 aa12.06□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa12.05□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fndc1E9Q043 1732 aa12.05□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fhod3Q76LL6 1578 aa12.05□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Stk24Q99KH8 431 aa12.05□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kif3bQ61771 747 aa12.04□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CatipB9EKE5 520 aa12.03□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pkd2O35245 966 aa12.03□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf692Q3U381 531 aa12.03□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trak1Q6PD31 939 aa12.03□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nos1Q9Z0J4 1429 aa12.03□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.48
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Abca9Q8K449 1623 aa12.02□□□□□ -0.49
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Talpid3E9PV87 1520 aa12.01□□□□□ -0.49
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nlrp6Q91WS2 869 aa12.01□□□□□ -0.49
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gli2Q0VGT2 1544 aa12.01□□□□□ -0.49
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NeflP08551 543 aa12□□□□□ -0.49
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kidins220E9Q9B7 1793 aa11.99□□□□□ -0.49
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ttll5Q8CHB8 1328 aa11.99□□□□□ -0.49
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pde4cQ3UEI1 686 aa11.97□□□□□ -0.49
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ssh2Q5SW75 1423 aa11.97□□□□□ -0.49
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PtprgQ05909 1442 aa11.96□□□□□ -0.49
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 RereQ80TZ9 1558 aa11.96□□□□□ -0.49
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kcnn1Q9EQR3 537 aa11.96□□□□□ -0.5
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 AlkP97793 1621 aa11.95□□□□□ -0.5
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Myom3A2ABU4 1439 aa11.95□□□□□ -0.5
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cnga1P29974 684 aa11.94□□□□□ -0.5
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf316Q6PGE4 1016 aa11.94□□□□□ -0.5
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trim26Q99PN3 545 aa11.94□□□□□ -0.5
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dip2cE9PWR4 1557 aa11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42 ms