RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-204	ENST00000561685	KLF10	Q13118	480 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	ADAM15	Q13444	863 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	EPHA7	Q15375	998 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	AMER2	Q8N7J2	671 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	RFPL3	O75679	317 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	RGS3	P49796	1198 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	BCAR1	P56945	870 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	TGFB2	P61812	414 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	FHL2	Q14192	279 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	TRAF5	O00463	557 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	DVL2	O14641	736 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	PLSCR1	O15162	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	C1S	P09871	688 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRN3-204	ENST00000561685	CBX4	O00257	560 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	PEX11B	O96011	259 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	BPIFB4	P59827	614 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	CRHR2	Q13324	411 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	TCIRG1	Q13488	830 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	ZNF460	Q14592	562 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	DYDC2	Q96IM9	177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	WDR92	Q96MX6	357 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	MENT	Q9BUN1	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	C2orf78	A6NCI8	922 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	DAPK3	O43293	454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	JMJD7	P0C870	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	MAK	P20794	623 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	ADH4	P08319	380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	ANTXR2	P58335	489 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	ADAM8	P78325	824 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	DGCR2	P98153	550 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	DPT	Q07507	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	CFAP100	Q494V2	611 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	MFSD5	Q6N075	450 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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