RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439830.5

ANKRD28-203, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 5

Gene ANKRD28, Length 592 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 FGFR1P11362 822 aa28.36■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 ERICH6BQ5W0A0 696 aa28.36■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 NLRP7Q8WX94 980 aa28.36■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 IGFLR1Q9H665 355 aa28.36■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 HOXA2O43364 376 aa28.35■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 DARSP14868 501 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.134e-6■□□□□ 11.1
ANKRD28-203ENST00000439830 AK2P54819 239 aa28.35■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa28.35■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.132e-7■■■□□ 16.4
ANKRD28-203ENST00000439830 TMEM150BA6NC51 233 aa28.34■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 TBX10O75333 385 aa28.34■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 STBD1O95210 358 aa28.34■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 IRS1P35568 1242 aa28.34■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 PSMC5P62195 406 aa28.34■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 UBE3AQ05086 875 aa28.34■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 PPP4R3AQ6IN85 833 aa28.34■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 WASF1Q92558 559 aa28.34■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 FAM20AQ96MK3 541 aa28.34■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 TMEM117Q9H0C3 514 aa28.34■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 KCNMB3Q9NPA1 279 aa28.34■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 GJB4Q9NTQ9 266 aa28.34■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 CTDNEP1O95476 244 aa28.33■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 LAG3P18627 525 aa28.33■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 DNM2P50570 870 aa28.33■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 CDC42EP1Q00587 391 aa28.33■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 PPP2R5CQ13362 524 aa28.33■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 DRP2Q13474 957 aa28.33■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa28.33■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa28.33■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa28.33■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 CEP89Q96ST8 783 aa28.33■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 SH2D3AQ9BRG2 576 aa28.33■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 HCSTQ9UBK5 93 aa28.33■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 PRKAG3Q9UGI9 489 aa28.33■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 VAV3Q9UKW4 847 aa28.33■■■□□ 2.13
ANKRD28-203ENST00000439830 DDX11L8A8MPP1 907 aa28.32■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 CLUL1Q15846 466 aa28.32■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 THNSL1Q8IYQ7 743 aa28.32■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 ABI1Q8IZP0 508 aa28.32■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 OXER1Q8TDS5 423 aa28.32■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa28.31■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 EML1O00423 815 aa28.31■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 LINC01565O15544 149 aa28.31■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 DTNBO60941 627 aa28.31■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 FGF18O76093 207 aa28.31■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 NDUFV1P49821 464 aa28.31■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 ADAM15Q13444 863 aa28.31■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 ECHDC2Q86YB7 292 aa28.31■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 LRRC43Q8N309 656 aa28.31■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 CWH43Q9H720 699 aa28.31■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 TLR9Q9NR96 1032 aa28.31■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 DACT1Q9NYF0 836 aa28.31■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 TBX3O15119 743 aa28.3■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP28.3■■■□□ 2.122e-12■■■■■ 55.8
ANKRD28-203ENST00000439830 MAFO75444 373 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 FGFR4P22455 802 aa28.3■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 QARSP47897 775 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 ZP2Q05996 745 aa28.3■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 ANO5Q75V66 913 aa28.3■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 EFHBQ8N7U6 833 aa28.3■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 RNF169Q8NCN4 708 aa28.3■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 RNF19AQ9NV58 838 aa28.3■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 CD207Q9UJ71 328 aa28.3■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 PI4K2BG5E9Z4 385 aa28.29■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 MBTPS2O43462 519 aa28.29■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 NRIP1P48552 1158 aa28.29■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 TMEM31Q5JXX7 168 aa28.29■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 PLA2G4FQ68DD2 849 aa28.29■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF410Q86VK4 478 aa28.29■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa28.29■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 GTF3C6Q969F1 213 aa28.29■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 CASD1Q96PB1 797 aa28.29■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 BRMS1Q9HCU9 246 aa28.29■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa28.29■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa28.29■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 A0A087WZ62 844 aa28.28■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 A0A0U1RQF3 1178 aa28.28■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 MARCH6O60337 910 aa28.28■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 KRT2P35908 639 aa28.28■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 ME3Q16798 604 aa28.28■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 RHPN2Q8IUC4 686 aa28.28■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 ADHFE1Q8IWW8 467 aa28.28■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 NECAB1Q8N987 351 aa28.28■■■□□ 2.12
ANKRD28-203ENST00000439830 HAS1Q92839 578 aa28.28■■■□□ 2.12
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