RNA–Protein interactions for RNA: YPR117W

YPR117W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YPR117W, Length 7,470 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPR117W	YPR117W	IBA57	P47158	497 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	UFO1	Q04511	668 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	TRM10	Q12400	293 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	BOL1	Q3E793	110 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	FAR1	P21268	830 aa		0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	REC107	P21651	314 aa		0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	MSG5	P38590	489 aa		0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	SPO73	P40031	143 aa		0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	SER3	P40054	469 aa		0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	YMR134W	P40207	237 aa		0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	BAP3	P41815	604 aa		0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	RAD17	P48581	401 aa		0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	IMO32	P53219	342 aa		0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	FHN1	P53279	174 aa		0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	SMA1	Q02651	245 aa		0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	FAR8	Q05040	523 aa		0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	VPS74	Q06385	345 aa		0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	YOL159C	Q08300	171 aa		0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	VPS33	P20795	691 aa		0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	YCR061W	P25639	631 aa		0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	MEI5	P32489	222 aa		0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.26
YPR117W	YPR117W	VPS13	Q07878	3144 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	STF1	P01098	86 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	PDE2	P06776	526 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	CBS1	P14066	229 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	SEC63	P14906	663 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	SEC66	P33754	206 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	MNL1	P38888	796 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	SMF1	P38925	575 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	COX15	P40086	486 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	0.9	□□□□□ -2.27	not detected
YPR117W	YPR117W	MAF1	P41910	395 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	YNR068C	P53754	272 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	HER2	Q03557	464 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	BCH1	Q05029	724 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	YFH1	Q07540	174 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	YPL191C	Q08930	360 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	TPK3	P05986	398 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	ELO2	P25358	347 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	AFG1	P32317	509 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	MNN2	P38069	597 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	YPT10	P38146	199 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	RRT2	P38332	387 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	ERV46	P39727	415 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	YIL024C	P40543	189 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	SWP82	P43554	623 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	FAR3	P46671	204 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	MPS3	P47069	682 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	YGR266W	P53326	701 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	SNF12	P53628	566 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	TOF1	P53840	1238 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	DUG3	P53871	357 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	KAP120	Q02932	1032 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	IVY1	Q04934	453 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	YML053C	Q04978	212 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	SEC39	Q12745	709 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	STE2	D6VTK4	431 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	HEM2	P05373	342 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	MER1	P16523	270 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	BRF1	P29056	596 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	DCG1	P32460	244 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	PPQ1	P32945	549 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.9	□□□□□ -2.27	not detected
YPR117W	YPR117W	COY1	P34237	679 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	RGI2	P40188	164 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	PRM10	P42946	383 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	YGR219W	P53307	113 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	ATP23	P53722	227 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	SRN2	Q99176	213 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	NUP1	P20676	1076 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	RBK1	P25332	333 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YPR117W	YPR117W	AAD3	P25612	363 aa		0.9	□□□□□ -2.27

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