RNA–Protein interactions for RNA: YMR107W

SPG4, Transcript of Protein required for high temperature survival during stationary phase, yeast

Gene SPG4, Length 348 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPG4	YMR107W	PDC2	P32896	925 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	YBR013C	P38215	129 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	CCZ1	P38273	704 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
SPG4	YMR107W	PRM9	P39551	298 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	BUR6	P40096	142 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	MNT3	P40549	630 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	ATG18	P43601	500 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	IDS2	P46958	469 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	PET130	P47065	347 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	BFA1	P47113	574 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	CGR1	P53188	120 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	PEX25	Q02969	394 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	EAR1	Q03212	550 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	MSC2	Q03455	724 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	HPF1	Q05164	967 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	VPS74	Q06385	345 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	ANT1	Q06497	328 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	BSP1	Q06604	576 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	RGT2	Q12300	763 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	MET8	P15807	274 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	ERD2	P18414	219 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	SNF6	P18888	332 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	MNE1	P24720	663 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	YCL002C	P25565	263 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	PXA2	P34230	853 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	EMC3	P36039	253 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	RCY1	P39531	840 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	AIM2	P39721	246 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	SNM1	P40993	198 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	NSE4	P43124	402 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	YJR030C	P47101	745 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	SNN1	P48232	102 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	COS12	P53053	380 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	SHY1	P53266	389 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	MRPL22	P53881	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	ASI3	P53983	676 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	HLR1	Q04429	423 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	GRX8	Q05926	109 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	KEI1	Q06346	221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	SSK1	Q07084	712 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	ICL2	Q12031	575 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	NMD4	Q12129	218 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	GLO4	Q12320	285 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	DCN1	Q12395	269 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	EAF3	Q12432	401 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	AI1	P03875	834 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	REV1	P12689	985 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	GLN3	P18494	730 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	MSS51	P32335	436 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	SRB6	P32570	121 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	PPG1	P32838	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	CLB6	P32943	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	PHO11	P35842	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	REG2	P38232	338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	PHO12	P38693	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	MDM31	P38880	579 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	RAD55	P38953	406 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	ACA1	P39970	489 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	LAS21	P40367	830 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	MEP2	P41948	499 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	CHA4	P43634	648 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	DAN1	P47178	298 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	SRB7	P47822	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	EXG2	P52911	562 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	COS10	P52924	374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	SCS3	P53012	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	TPO2	P53283	614 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	TIM13	P53299	105 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	MNT4	P53745	580 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	CUZ1	P53899	274 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61

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