RNA–Protein interactions for RNA: YHL028W

WSC4, Transcript of Endoplasmic reticulum (ER) membrane protein, yeast

Gene WSC4, Length 1,818 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
WSC4	YHL028W	YKL097C	P34245	136 aa		7.29	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	RSM22	P36056	628 aa		7.29	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	IFA38	P38286	347 aa		7.29	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	NEM1	P38757	446 aa		7.29	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	BUR6	P40096	142 aa		7.29	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	MAD2	P40958	196 aa		7.29	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	RAD17	P48581	401 aa		7.29	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	MTQ1	P53944	314 aa		7.29	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	AIM36	Q03798	255 aa		7.29	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	ROY1	Q04847	553 aa		7.29	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	MFB1	Q04922	465 aa		7.29	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	PLB3	Q08108	686 aa		7.29	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		7.29	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	TFS1	P14306	219 aa		7.28	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	LST4	P34239	828 aa		7.28	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.28	□□□□□ -1.24	not detected
WSC4	YHL028W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	MDM31	P38880	579 aa		7.28	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	NVJ1	P38881	321 aa		7.28	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	AXL2	P38928	823 aa		7.28	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	HXT9	P40885	567 aa		7.28	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	MRPS18	P42847	217 aa		7.28	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	AAD14	P42884	376 aa		7.28	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	NUP116	Q02630	1113 aa		7.28	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	YLR446W	Q06204	433 aa		7.28	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	FEX1	Q08913	375 aa		7.28	□□□□□ -1.24
WSC4	YHL028W	FLP1	P03870	423 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	MRPL3	P36516	390 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	GDS1	P41913	522 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	ATG18	P43601	500 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	IRC7	P43623	340 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	FDC1	Q03034	503 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YLR283W	Q05867	314 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	OPI10	Q08202	246 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	INH1	P01097	85 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	PET54	P10834	293 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	CMP2	P14747	604 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	NTH1	P32356	751 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	ZRG8	P40021	1076 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	MET28	P40573	187 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	MEP3	P53390	489 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	RHO4	Q00246	291 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YDR444W	Q04093	687 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YMR087W	Q04299	284 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	ASR1	Q06834	288 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	FEX2	Q08991	375 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YPR022C	Q12139	1133 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YPL066W	Q12194	479 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	ATP14	Q12349	124 aa		7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	STE7	P06784	515 aa		7.26	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	SPS2	P08459	502 aa		7.26	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	DSF1	P0CX08	502 aa		7.26	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YNR073C	P0CX09	502 aa		7.26	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	ARE1	P25628	610 aa		7.26	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	CPR3	P25719	182 aa		7.26	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	MSN2	P33748	704 aa		7.26	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	TED1	P40533	473 aa		7.26	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	TIR3	P40552	269 aa		7.26	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	RRN9	P53437	365 aa		7.26	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YNR061C	P53747	219 aa		7.26	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	DCS1	Q06151	350 aa		7.26	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	BSC1	Q12140	328 aa		7.26	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	ADE1	P27616	306 aa		7.25	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	SNC1	P31109	117 aa		7.25	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	RCY1	P39531	840 aa		7.25	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	MNT3	P40549	630 aa		7.25	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	TIM54	P47045	478 aa		7.25	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	ECM27	P47144	725 aa		7.25	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	SCS7	Q03529	384 aa		7.25	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	CDA2	Q06703	312 aa		7.25	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		7.25	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	MTR10	Q99189	972 aa		7.25	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	MSB2	P32334	1306 aa		7.25	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	HXT2	P23585	541 aa		7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
WSC4	YHL028W	RML2	P32611	393 aa		7.24	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37.3 ms