RNA–Protein interactions for RNA: RDN18-2

RDN18-2, Transcript of 18S ribosomal RNA (18S rRNA), yeastyeast

Gene RDN18-2, Length 1,800 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDN18-2RDN18-2 YDR061WQ12298 539 aa9.51□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 YOR019WQ99248 730 aa9.51□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 YOL162WP0CF19 215 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 HOM2P13663 365 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 DBF2P22204 572 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 NAR1P23503 491 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 PTR2P32901 601 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 SNU114P36048 1008 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 RSM22P36056 628 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 ALP1P38971 573 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 BEM2P39960 2167 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 FMC1P40491 155 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 IMO32P53219 342 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 YKR011CQ02209 353 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 RKM5Q12367 367 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 SUS1Q6WNK7 96 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 YPR117WQ06116 2489 aa9.5□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 GPM1P00950 247 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 RNQ1P25367 405 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 SSH4P32343 579 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 YTA6P40328 754 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 PAM16P42949 149 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 YPQ2Q06328 317 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 TPO4Q12256 659 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 YJU2P28320 278 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 PRO1P32264 428 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 SUR1P33300 382 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 OAR1P35731 278 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 MBA1P38300 278 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 PFS2P42841 465 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 IRC18P47056 224 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 MNN10P50108 393 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 COA4Q05809 96 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 YLR346CQ06139 101 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 YPR196WQ06595 470 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 YOR238WQ08634 303 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 RAD59Q12223 238 aa9.49□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 APN1P22936 367 aa9.48□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 ORC2P32833 620 aa9.48□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 SKN1P33336 771 aa9.48□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 MNL1P38888 796 aa9.48□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 PGA1P53896 198 aa9.48□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 NOP12Q08208 459 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 CHL4P38907 458 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 FET5P43561 622 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 BUD9P53226 547 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 MSS11Q03825 758 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 PLM2Q04383 521 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 YDR514CQ04408 483 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 ARV1Q06541 321 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 YDL211CQ12121 372 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 SIR2P06700 562 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 GRX2P17695 143 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 AAC3P18238 307 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 MCK1P21965 375 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 HSP30P25619 332 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 YBR137WP38276 179 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 RPS20P38701 121 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 BAT1P38891 393 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 GIP2P40036 548 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 RPS12P48589 143 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 RRN9P53437 365 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 CWC24P53769 259 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 INP1Q03694 420 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 HSP42Q12329 375 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 PCL9Q12477 304 aa9.47□□□□□ -0.89
RDN18-2RDN18-2 PDE2P06776 526 aa9.46□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 PET122P10355 254 aa9.46□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 SRB5P32585 307 aa9.46□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 CDC13P32797 924 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 UTP30P36144 274 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 CIN1P40987 1014 aa9.46□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 ATG18P43601 500 aa9.46□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 YGR250CP53316 781 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 YFT2Q06676 274 aa9.46□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 YDL176WQ12027 708 aa9.46□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 DAP1Q12091 152 aa9.46□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 RTN2Q12443 393 aa9.46□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 SYG1P40528 902 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 CIS3P47001 227 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 MNT4P53745 580 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 OPT2Q06593 877 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 MRPL35Q06678 367 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 YGR161W-CQ3E744 92 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 DPM1P14020 267 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 YMC1P32331 307 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 PPQ1P32945 549 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 TOD6P34219 525 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 SRX1P36077 127 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 PZF1P39933 429 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 YIL165CP40446 119 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 AAD10P47182 288 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 FAA4P47912 694 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 SPT20P50875 604 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 TPC1P53257 314 aa9.45□□□□□ -0.9
RDN18-2RDN18-2 NOG1Q02892 647 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
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