RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 CATSPEREQ5SY80 951 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 Q6ZSN1 163 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 FGD2Q7Z6J4 655 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 OSBPL2Q9H1P3 480 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 PCED1AQ9H1Q7 454 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 SLPIP03973 132 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 ACRV1P26436 265 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 IGFALSP35858 605 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 MECP2P51608 486 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 HHEXQ03014 270 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 ABHD17CQ6PCB6 329 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 ZNF503Q96F45 646 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 MRIQ9BWK5 157 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 ZNF341Q9BYN7 854 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 ACSS2Q9NR19 701 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 PLA2G3Q9NZ20 509 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 FAM184BQ9ULE4 1060 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 STAT5BP51692 787 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 ROM1Q03395 351 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 PTH1RQ03431 593 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 FOXL1Q12952 345 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 GRM7Q14831 915 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 KLHDC10Q6PID8 442 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 ZFPM1Q8IX07 1006 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 CHST14Q8NCH0 376 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 SHCBP1Q8NEM2 672 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 OR14K1Q8NGZ2 314 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3-204ENST00000561685 CYP27B1O15528 508 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 PRLP01236 227 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 ASLP04424 464 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 KIF11P52732 1056 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 NME9Q86XW9 330 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 C1orf210Q8IVY1 113 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 LILRB2Q8N423 598 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 RABGGTAQ92696 567 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 MPHOSPH9Q99550 1183 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 PCIF1Q9H4Z3 704 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 CABP5Q9NP86 173 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 NPIPB8E9PQR5 432 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 M0R2C6 588 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 SUV39H1O43463 412 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 RAPGEF3O95398 923 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 CYP17A1P05093 508 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 ABHD18Q0P651 414 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 RIN1Q13671 783 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 DGKDQ16760 1214 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 GPR135Q8IZ08 494 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 EXTL1Q92935 676 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 MAML3Q96JK9 1138 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 CSRNP2Q9H175 543 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 SLC6A15Q9H2J7 730 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 TLR9Q9NR96 1032 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 SAMD15Q9P1V8 674 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 GIT1Q9Y2X7 761 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 H7C1D1 291 aa5□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 OPA1O60313 960 aa5□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 KRT37O76014 449 aa5□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 ZNF202O95125 648 aa5□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 MCM7P33993 719 aa5□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 FLT3P36888 993 aa5□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 ZNF174Q15697 407 aa5□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 TTC38Q5R3I4 469 aa5□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 SGMS1Q86VZ5 419 aa5□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 D2HGDHQ8N465 521 aa5□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 OR5AN1Q8NGI8 311 aa5□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 IL17DQ8TAD2 202 aa5□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa5□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 KCMF1Q9P0J7 381 aa5□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 A0A1W2PRX2 142 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 CAPN14A8MX76 684 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 MAFGO15525 162 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 ADCY7P51828 1080 aa4.99□□□□□ -1.61
RRN3-204ENST00000561685 SLC6A3Q01959 620 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms