RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	DCR2	Q05924	578 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	KCS1	Q12494	1050 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	RGS2	Q99188	309 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	HSP150	P32478	413 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	COX13	P32799	129 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	ETR1	P38071	380 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	MSS4	P38994	779 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	CAJ1	P39101	391 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YJL206C	P39529	758 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	GNP1	P48813	663 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	KEL2	P50090	882 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YGR066C	P53242	292 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	RPM2	Q02773	1202 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	MET31	Q03081	177 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	SDC1	Q03323	175 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	RXT3	Q07458	294 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.23	□□□□□ -1.57	not detected
SYF2	YGR129W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	PRB1	P09232	635 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YCK1	P23291	538 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YEF1	P32622	495 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YKL187C	P34231	750 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	MGE1	P38523	228 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	REV7	P38927	245 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	FET3	P38993	636 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	COA1	P40452	197 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	YMR209C	Q03648	457 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	VTI1	Q04338	217 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	SML1	Q04964	104 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	TMA10	Q06177	86 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	GPB1	Q08886	897 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	PSF1	Q12488	208 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYF2	YGR129W	HEM4	P06174	275 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	GAL3	P13045	520 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	MEF1	P25039	761 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	PTH2	P34222	208 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	ARN2	P38724	620 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	NDC80	P40460	691 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	YIL012W	P40551	113 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	INA22	P40576	216 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	AXL1	P40851	1208 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	REE1	P40893	198 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	MAD3	P47074	515 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	TOM22	P49334	152 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	CDH1	P53197	566 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	TAF11	Q04226	346 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	API2	Q04413	109 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	RNH1	Q04740	348 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	GET4	Q12125	312 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	PET111	P08468	800 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	CBS2	P14905	389 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	AAC3	P18238	307 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	PHA2	P32452	334 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	YME1	P32795	747 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	SPO23	P33757	523 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	MRPS5	P33759	307 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	SET3	P36124	751 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	ATG7	P38862	630 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	PEP8	P40335	379 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	ALG5	P40350	334 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	YFL051C	P43552	160 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	RNH70	P53331	553 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	RHO4	Q00246	291 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	YML131W	Q03102	365 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	SEC10	Q06245	871 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	GEP5	Q12393	293 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	SPO24	Q3E752	67 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	CCW14	O13547	238 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	DST1	P07273	309 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	BAR1	P12630	587 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	CTA1	P15202	515 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	RPB5	P20434	215 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SYF2	YGR129W	YCR087C-A	P37263	153 aa		5.19	□□□□□ -1.58

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