RNA–Protein interactions for RNA: YLR008C

PAM18, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM18, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM18	YLR008C	SNX4	P47057	423 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YGL159W	P53110	370 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YGR127W	P53275	312 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	MAL13	P53338	473 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	OCA2	P53949	197 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	HXT11	P54862	567 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	MFM1	Q02783	413 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	MRPL35	Q06678	367 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YEH2	Q07950	538 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	SGO1	Q08490	590 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	NPC2	Q12408	173 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	CHS1	P08004	1131 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	WHI2	P12611	486 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	TUP1	P16649	713 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	HXT2	P23585	541 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	PTC6	P25646	442 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	CTS1	P29029	562 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	SIN4	P32259	974 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	LHS1	P36016	881 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	RIB1	P38066	345 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	SBE22	P38814	852 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	FMO1	P38866	432 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	FHL1	P39521	936 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YER130C	P39959	443 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	SSY5	P47002	699 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	STB4	P50104	949 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	ROG1	P53118	685 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	CDC123	Q05791	360 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	ORM2	Q06144	216 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YFT2	Q06676	274 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	PAM18	Q07914	168 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	ESA1	Q08649	445 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.78	□□□□□ -1.8	not detected
PAM18	YLR008C	RRD2	Q12461	358 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	SPO24	Q3E752	67 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAM18	YLR008C	YIL177C	P40434	1758 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YJL225C	P40889	1758 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	RAD1	P06777	1100 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YML003W	P0CF16	290 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	ERG11	P10614	530 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	REV1	P12689	985 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	VMA16	P23968	213 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	SKT5	P34226	696 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	RPC25	P35718	212 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	BMT2	P38278	337 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	BIG1	P38813	335 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	PFS1	P38872	237 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	3.77	□□□□□ -1.81	not detected
PAM18	YLR008C	YHR210C	P38893	341 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	FET3	P38993	636 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YAR1	P46683	200 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YJL163C	P46996	555 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YGL117W	P53133	265 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	MTQ1	P53944	314 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	SPP2	Q02521	185 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	FIN1	Q03898	291 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	SPC24	Q04477	213 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	AIM33	Q04516	312 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	SPO77	Q06134	477 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	MSH5	Q12175	901 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	VAM3	Q12241	283 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	COX2	P00410	251 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	PMR1	P13586	950 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	GPI12	P23797	304 aa		3.76	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
PAM18	YLR008C	HCM1	P25364	564 aa		3.76	□□□□□ -1.81

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