RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	MMT1	Q03218	510 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	LIP2	Q06005	328 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	RIF2	Q06208	395 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	AEP3	Q12089	606 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	DST1	P07273	309 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	CAP2	P13517	287 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	PHA2	P32452	334 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	RTC2	P38279	296 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	GAT2	P40209	560 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	CHS6	P40955	746 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	TSA2	Q04120	196 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	CDC21	P06785	304 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	MSI1	P13712	422 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	CPR2	P23285	205 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	STP2	P38704	541 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	FAD1	P38913	306 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	YPS6	P40583	537 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	TOS3	P43637	560 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	PIB2	P53191	635 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	PLP2	Q12017	286 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.03	□□□□□ -1.92	not detected
RSM27	YGR215W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	EGT2	P42835	1041 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	YFR057W	P43625	151 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	AIM24	P47127	394 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	TOM22	P49334	152 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	MDM36	Q06820	579 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	JID1	Q12350	301 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	EAF3	Q12432	401 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RSM27	YGR215W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.02	□□□□□ -1.93	not detected
RSM27	YGR215W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	OXA1	P39952	402 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	DFG10	P40526	253 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	HAC1	P41546	238 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	YGR111W	P53265	400 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	CRH1	P53301	507 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	YLR456W	Q06199	204 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	SKN1	P33336	771 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	SPT10	P35208	640 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	MRP21	P38175	177 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	INM1	P38710	295 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	YHK8	P38776	514 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	STN1	P38960	494 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	TDA1	Q03533	586 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	DCI1	Q08558	271 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	IES6	P32617	166 aa		3	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	GPI16	P38875	610 aa		3	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	MAM33	P40513	266 aa		3	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	BNS1	P50084	137 aa		3	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	MST27	P53176	234 aa		3	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	ALF1	P53904	254 aa		3	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	YMR102C	Q03177	834 aa		3	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	GYL1	Q04322	720 aa		3	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	SMC5	Q08204	1093 aa		3	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	GPM3	Q12326	303 aa		3	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	POM152	P39685	1337 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	OPI3	P05375	206 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	PDE2	P06776	526 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	ROG1	P53118	685 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	COS1	P53822	381 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	SPR6	Q01684	191 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	UAF30	Q08747	228 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	CEX1	Q12453	761 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	SMC6	Q12749	1114 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	COX13	P32799	129 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	ATG18	P43601	500 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	YET2	Q04210	160 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	MFG1	Q07684	458 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	ALG1	P16661	449 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	RPB5	P20434	215 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	PHO91	P27514	894 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	PRR1	P28708	518 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	YEF1	P32622	495 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	YER186C	P40101	306 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	RUP1	Q12242	671 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RSM27	YGR215W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RSM27	YGR215W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.96	□□□□□ -1.94	not detected
RSM27	YGR215W	QDR3	P38227	689 aa		2.96	□□□□□ -1.94

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